76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02878 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02878  polar flagellar assembly protein FliO  100 
 
 
120 aa  243  6e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3038  flagellar biosynthesis protein, FliO  47.41 
 
 
166 aa  105  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002824  flagellar biosynthesis protein FliO  40.86 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03152  hypothetical protein  45.83 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1511  flagellar protein FliO  40.85 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2288  flagellar protein FliO  39.73 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.667143  normal  0.915972 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2299  polar flagellar assembly protein FliO  37.93 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3918  flagellar biosynthesis protein FliO  34.65 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3445  flagellar biosynthesis protein, FliO  31.86 
 
 
146 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3057  flagellar biosynthesis protein, FliO  36.76 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  normal  0.139869 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1971  flagellar protein FliO  31.86 
 
 
146 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0391464  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3882  flagellar protein FliO  32.29 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45780  flagellar protein FliO  31.25 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1627  flagellar biosynthesis protein FliO  33.82 
 
 
124 aa  57.4  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1335  flagellar biosynthesis protein, FliO  30.85 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1706  flagellar protein FliO  39.71 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1191  flagellar biosynthesis protein, FliO  28.09 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3059  flagellar biosynthesis protein FliO  34.43 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.400554  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1985  flagellar biosynthesis protein, FliO  38.46 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271247  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1351  flagellar biosynthesis protein, FliO  32.79 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00422095  normal  0.37669 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3435  flagellar biosynthesis protein FliO  32.29 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1291  flagellar biosynthesis protein, FliO  32.79 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0485  flagellar biosynthesis protein, FliO  40.58 
 
 
153 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.188569  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1446  flagellar biosynthesis protein FliO  34.43 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00843701  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2917  flagellar biosynthesis protein FliO  34.43 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21495  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2927  flagellar biosynthesis protein FliO  34.43 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1358  flagellar biosynthesis protein, FliO  32.79 
 
 
135 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3219  flagellar protein FliO  32.79 
 
 
135 aa  54.7  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1510  flagellar biosynthesis protein, FliO  32.98 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534381  normal  0.0796172 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4356  flagellar assembly protein FliO  32.98 
 
 
144 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  normal  0.615031 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1375  flagellar biosynthesis protein, FliO  27.66 
 
 
125 aa  53.5  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.679292  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2567  flagellar biosynthesis protein, FliO  31.15 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2909  flagellar biosynthesis protein FliO  27.03 
 
 
120 aa  52  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3222  flagellar biosynthesis protein, FliO  26.27 
 
 
187 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.252328 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24140  Flagellar biosynthesis protein  25.23 
 
 
140 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0039  flagellar biosynthesis protein FliO  25.42 
 
 
186 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5300  flagellar biosynthesis protein, FliO  27.1 
 
 
186 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.592303  normal  0.104724 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0709  flagellar biosynthetic protein FliO  32.43 
 
 
211 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.942573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0242  flagellar protein FliO  29.21 
 
 
221 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682736  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3682  flagellar biosynthesis protein FliO  32.98 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0729728  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2687  flagellar protein FliO  29.21 
 
 
211 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0031  flagellar biosynthesis protein FliO  29.21 
 
 
221 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0031  flagellar biosynthesis protein FliO  29.21 
 
 
221 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0030  flagellar biosynthesis protein, FliO  25 
 
 
188 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1865  flagellar protein FliO  29.21 
 
 
211 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.511864  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3495  flagellar protein FliO  29.21 
 
 
221 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2762  flagellar protein FliO  29.21 
 
 
164 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1549  flagellar biosynthesis protein FliO  34.21 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2173  flagellar biogenesis protein-like  28.77 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0029  flagellar biosynthesis protein  30.99 
 
 
224 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241943  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0041  flagellar biosynthesis protein FliO  29.58 
 
 
191 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2813  flagellar biosynthesis protein, FliO  26.67 
 
 
143 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.392806  normal  0.0850882 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0057  flagellar biosynthesis protein FliO  30.43 
 
 
180 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0038  flagellar biosynthesis protein, FliO  30.88 
 
 
193 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0032  flagellar biosynthesis protein, FliO  30.88 
 
 
193 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2163  flagellar biosynthesis protein, FliO  27.27 
 
 
163 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1370  flagellar biosynthesis protein FliO  32.2 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0739  flagellar biosynthesis protein, FliO  35.71 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.548156  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1330  flagellar biosynthesis protein FliO  28.09 
 
 
150 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.443294  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2977  flagellar biosynthesis protein FliO  27.62 
 
 
180 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5882  flagellar biosynthesis protein, FliO  27.55 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51063  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1167  flagellar biosynthetic protein FliO  26.47 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481561  normal  0.0745006 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1754  flagellar protein fliO  30.65 
 
 
136 aa  43.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1141  flagellar biosynthesis protein FliO  27.94 
 
 
125 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0496709  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1264  flagellar biosynthesis protein FliO  27.94 
 
 
125 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1754  flagellar protein fliO  30.65 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2136  flagellar biosynthesis protein FliO  27.94 
 
 
125 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.206958 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2194  flagellar biosynthesis protein FliO  27.94 
 
 
125 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.805426 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2141  flagellar biosynthesis protein FliO  27.94 
 
 
125 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267968 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2538  flagellar biosynthesis protein FliO  28.99 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600463  normal  0.973594 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3584  flagellar biosynthesis protein, FliO, putative  24.32 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.621138  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1567  flagellar biosynthesis protein FliO  39.53 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32485  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1678  hypothetical protein  25 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1548  flagellar biosynthesis protein, FliO  29.33 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0633784  normal  0.54306 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3779  flagellar biosynthesis protein FliO  29.23 
 
 
203 aa  41.2  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0764  flagellar biosynthesis protein, FliO  30.43 
 
 
136 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.772244  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>