225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02876 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02876  flagellar biosynthesis  100 
 
 
89 aa  172  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3036  flagellar biosynthetic protein FliQ  82.02 
 
 
89 aa  148  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1337  flagellar biosynthetic protein FliQ  64.04 
 
 
89 aa  122  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1193  flagellar biosynthetic protein FliQ  65.17 
 
 
89 aa  123  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1513  flagellar biosynthetic protein FliQ  64.77 
 
 
89 aa  122  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1704  flagellar biosynthesis protein FliQ  60.23 
 
 
89 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2286  flagellar biosynthetic protein FliQ  62.92 
 
 
89 aa  118  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.274745  normal  0.895374 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002826  flagellar biosynthesis protein FliQ  59.09 
 
 
89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3217  flagellar biosynthetic protein FliQ  62.92 
 
 
89 aa  117  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1293  flagellar biosynthetic protein FliQ  64.04 
 
 
89 aa  117  7e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1360  flagellar biosynthetic protein FliQ  64.04 
 
 
89 aa  117  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1353  flagellar biosynthetic protein FliQ  64.04 
 
 
89 aa  117  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  0.273475 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03150  flagellar biosynthesis protein FliQ  60.23 
 
 
89 aa  117  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1629  flagellar biosynthetic protein FliQ  61.8 
 
 
89 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2565  flagellar biosynthetic protein FliQ  62.92 
 
 
89 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2925  flagellar biosynthetic protein FliQ  61.8 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.832083  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3057  flagellar biosynthetic protein FliQ  61.8 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.554664  normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1448  flagellar biosynthetic protein FliQ  61.8 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115597  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2915  flagellar biosynthetic protein FliQ  61.8 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.114624  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3055  flagellar biosynthetic protein FliQ  62.92 
 
 
89 aa  114  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341394  normal  0.194371 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2811  flagellar biosynthesis protein FliQ  56.18 
 
 
89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369637  normal  0.0394695 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2297  flagellar biosynthesis protein FliQ  53.41 
 
 
89 aa  107  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1512  flagellar biosynthesis protein FliQ  55.06 
 
 
89 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294208  normal  0.120584 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4354  flagellar biosynthesis protein FliQ  53.93 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3916  flagellar biosynthesis protein FliQ  53.93 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.413536  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1550  flagellar biosynthesis protein FliQ  53.93 
 
 
89 aa  97.1  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00974617  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3680  flagellar biosynthesis protein FliQ  52.81 
 
 
89 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0305386  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45760  flagellar biosynthesis protein FliQ  53.93 
 
 
89 aa  96.7  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3482  flagellar biosynthetic protein FliQ  56.41 
 
 
89 aa  95.9  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1983  flagellar biosynthesis protein FliQ  47.19 
 
 
89 aa  94.4  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487259  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3433  flagellar biosynthetic protein FliQ  49.44 
 
 
89 aa  94.4  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3985  export protein FliQ  53.85 
 
 
89 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1973  flagellar biosynthetic protein FliQ  51.69 
 
 
89 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00808662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3443  flagellar biosynthesis protein FliQ  51.69 
 
 
89 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1377  flagellar biosynthetic protein FliQ  62.92 
 
 
89 aa  92  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.986753  normal  0.259013 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04966  flagellar biosynthesis pathway, component FliQ  48.31 
 
 
89 aa  90.9  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001179  flagellar biosynthesis protein FliQ  48.31 
 
 
89 aa  90.9  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.824092  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3880  flagellar biosynthesis protein FliQ  55.06 
 
 
89 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0215  flagellar biosynthetic protein FliQ  50.56 
 
 
90 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3665  export protein FliQ  49.38 
 
 
89 aa  87.4  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0090  flagellar biosynthetic protein FliQ  52.56 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0166  flagellar biosynthetic protein FliQ, putative  51.69 
 
 
90 aa  83.6  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1372  flagellar biosynthetic protein FliQ  67.42 
 
 
89 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.558893  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2171  flagellar hook-associated protein  43.82 
 
 
89 aa  82.8  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3594  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.31 
 
 
89 aa  82.8  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0084  export protein FliQ  50 
 
 
89 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0625  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.7 
 
 
90 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0705  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.7 
 
 
90 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00473714  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0240  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.7 
 
 
90 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.331629  normal  0.0227388 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.45 
 
 
89 aa  77.8  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  77  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.57 
 
 
89 aa  77  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4423  export protein FliQ  40.45 
 
 
90 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.844817 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4647  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.7 
 
 
90 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189721  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1169  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.2 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.843837  normal  0.0664804 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.33 
 
 
89 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.33 
 
 
89 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.08 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1395  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.75 
 
 
88 aa  70.9  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.45 
 
 
89 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  34.83 
 
 
89 aa  70.5  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0216  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.93 
 
 
93 aa  70.5  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397416  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.8 
 
 
83 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16710  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.08 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2698  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.59 
 
 
89 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.201121  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0979  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.33 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.277677  normal  0.0178906 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0052  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.23 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1966  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.36 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0483  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.5 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.564628  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0231  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.36 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.101974  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0233  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.36 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1125  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.71 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.533326 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5880  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.47 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0649  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.24 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.09 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  32.58 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1633  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.75 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.621306  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.71 
 
 
89 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  31.46 
 
 
89 aa  61.2  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1332  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.96 
 
 
89 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.498706  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3096  flagellar biosynthesis protein FliQ  31.4 
 
 
89 aa  60.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0695  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.95 
 
 
88 aa  60.5  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3796  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.58 
 
 
89 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4198  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.71 
 
 
89 aa  60.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2156  flagellar biosynthetic protein FliQ  34.09 
 
 
89 aa  60.1  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.504575  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3823  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.71 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3070  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.58 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0602281  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3907  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.71 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325384 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0742  export protein FliQ  32.58 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2238  flagellar biosynthetic protein FliQ  35 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2097  flagellar biosynthesis protein FliQ  40 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621208  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  29.21 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0858  flagellar biosynthetic protein FliQ  31.82 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.387191  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0701  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.51 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356402  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.25 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1407  flagellar biosynthetic protein FliQ  32.95 
 
 
89 aa  58.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0585  flagellar biosynthetic protein FliQ  30.12 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0961  export protein FliQ family 3  34.88 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0424  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.06 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0764  flagellar biosynthetic protein FliQ  35.63 
 
 
89 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>