113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02763 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1366  glutamate--cysteine ligase  58.22 
 
 		 533 aa  641    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02763  glutamate cysteine ligase  100 
 
 		 532 aa  1106    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.969679  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4078  glutamate--cysteine ligase  50.29 
 
 		 529 aa  524  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.479247  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1058  glutamate--cysteine ligase  47.98 
 
 		 526 aa  511  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3373  glutamate--cysteine ligase  46.87 
 
 		 526 aa  500  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3207  glutamate--cysteine ligase  47.49 
 
 		 517 aa  491  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00285651  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0847  glutamate--cysteine ligase  47.61 
 
 		 520 aa  494  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000051454  hitchhiker  0.00000388875 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1120  glutamate--cysteine ligase  47.09 
 
 		 517 aa  489  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00403409  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1227  glutamate--cysteine ligase  48.84 
 
 		 523 aa  486  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0090  glutamate--cysteine ligase  48.57 
 
 		 524 aa  483  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1002  glutamate--cysteine ligase  46.55 
 
 		 518 aa  481  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.41654  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002530  glutamate--cysteine ligase  47.31 
 
 		 522 aa  475  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03486  glutamate--cysteine ligase  48.37 
 
 		 522 aa  478  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0987  glutamate--cysteine ligase  46.75 
 
 		 520 aa  476  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000558415  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3234  glutamate--cysteine ligase  45.69 
 
 		 532 aa  472  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314176  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0891  glutamate--cysteine ligase  45.69 
 
 		 532 aa  474  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000207295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3369  glutamate--cysteine ligase  45.69 
 
 		 532 aa  472  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00208999  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0643  glutamate--cysteine ligase  48.02 
 
 		 521 aa  472  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02543  glutamate-cysteine ligase  46.43 
 
 		 518 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.247513  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0996  glutamate/cysteine ligase  46.43 
 
 		 518 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00172637  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2824  glutamate--cysteine ligase  46.43 
 
 		 518 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00050885  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1019  glutamate--cysteine ligase  46.43 
 
 		 518 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.145998  normal  0.0132259 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2810  glutamate--cysteine ligase  46.43 
 
 		 518 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000302956  hitchhiker  0.00165416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3934  glutamate--cysteine ligase  46.43 
 
 		 518 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.161519  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02508  hypothetical protein  46.43 
 
 		 518 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276481  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3559  glutamate--cysteine ligase  48.33 
 
 		 564 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2980  glutamate--cysteine ligase  47.92 
 
 		 549 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3062  glutamate--cysteine ligase  47.92 
 
 		 549 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.502221 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3168  glutamate--cysteine ligase  46 
 
 		 514 aa  466  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2971  glutamate--cysteine ligase  46.23 
 
 		 518 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000810543  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1329  glutamate--cysteine ligase  45.45 
 
 		 544 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.423999  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3020  glutamate--cysteine ligase  45.8 
 
 		 518 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.427194  hitchhiker  0.0000869019 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3003  glutamate--cysteine ligase  45.8 
 
 		 518 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.179247  hitchhiker  0.000116011 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2968  glutamate--cysteine ligase  45.8 
 
 		 518 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209272  hitchhiker  0.00113196 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2937  glutamate--cysteine ligase  45.8 
 
 		 518 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00247606  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3127  glutamate--cysteine ligase  45.8 
 
 		 518 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.986087  normal  0.0373745 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1072  glutamate--cysteine ligase  45.92 
 
 		 539 aa  462  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3160  glutamate--cysteine ligase  47.72 
 
 		 549 aa  462  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.768452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1208  glutamate--cysteine ligase  46.53 
 
 		 522 aa  464  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3188  glutamate--cysteine ligase  46.03 
 
 		 518 aa  464  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00136573  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0201  glutamate--cysteine ligase  46.51 
 
 		 523 aa  457  1e-127  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1036  glutamate--cysteine ligase  46.83 
 
 		 549 aa  457  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1132  glutamate--cysteine ligase  45.66 
 
 		 549 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3326  glutamate--cysteine ligase  46.44 
 
 		 542 aa  456  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0015659 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1031  glutamate--cysteine ligase  45.47 
 
 		 549 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1098  glutamate--cysteine ligase  45.47 
 
 		 549 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3260  glutamate--cysteine ligase  45.47 
 
 		 549 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.116271 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1219  glutamate--cysteine ligase  45.56 
 
 		 524 aa  449  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0257  glutamate--cysteine ligase  45.21 
 
 		 532 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0243  glutamate--cysteine ligase  44.95 
 
 		 525 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0244786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0258  glutamate--cysteine ligase  44.95 
 
 		 530 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358158  normal  0.0162786 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05020  glutamate--cysteine ligase  43.32 
 
 		 530 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.402642  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0268  glutamate--cysteine ligase  44.73 
 
 		 530 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.237882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0356  glutamate--cysteine ligase  44.59 
 
 		 526 aa  428  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0696  glutamate/cysteine ligase  42.15 
 
 		 524 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0255  glutamate--cysteine ligase  43.57 
 
 		 535 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2654  glutamate-cysteine ligase  44.64 
 
 		 536 aa  420  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.440832  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3430  glutamate--cysteine ligase  42.35 
 
 		 530 aa  421  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4969  glutamate--cysteine ligase  44.34 
 
 		 525 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3583  glutamate-cysteine ligase  41.57 
 
 		 530 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.508788 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0325  glutamate--cysteine ligase  42.61 
 
 		 529 aa  415  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5948  glutamate--cysteine ligase  43.35 
 
 		 527 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906336  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68730  glutamate--cysteine ligase  43.75 
 
 		 527 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2324  glutamate/cysteine ligase  42.21 
 
 		 528 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.995496  normal  0.291443 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6505  glutamate--cysteine ligase  42.47 
 
 		 537 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0104225  normal  0.185874 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3169  glutamate--cysteine ligase  41.54 
 
 		 537 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00288227  hitchhiker  0.00000108947 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1606  glutamate--cysteine ligase, monofunctional  42.31 
 
 		 519 aa  405  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.526422  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2536  glutamate--cysteine ligase  41.62 
 
 		 533 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0916365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3149  glutamate--cysteine ligase  41.62 
 
 		 533 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0807881  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0110  glutamate/cysteine ligase  41.99 
 
 		 532 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3202  glutamate--cysteine ligase  41.09 
 
 		 537 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.676712  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3143  glutamate--cysteine ligase  41.28 
 
 		 537 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000827615 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3086  glutamate--cysteine ligase  41.12 
 
 		 547 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0401294  hitchhiker  0.00000000000210379 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0087  glutamate--cysteine ligase  41.06 
 
 		 548 aa  396  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000417414  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0750  glutamate--cysteine ligase  40.98 
 
 		 530 aa  395  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.44822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3087  glutamate--cysteine ligase  41.09 
 
 		 537 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00169886  normal  0.0244082 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2467  glutamate--cysteine ligase  40.63 
 
 		 509 aa  392  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0117  glutamate--cysteine ligase  40.3 
 
 		 533 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000417338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2251  glutamate--cysteine ligase  40.3 
 
 		 537 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0100341  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0118  glutamate--cysteine ligase  40.49 
 
 		 537 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000414773  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0324  glutamate--cysteine ligase  40.3 
 
 		 548 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000109041  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3399  glutamate-cysteine ligase  40.94 
 
 		 537 aa  391  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3637  glutamate/cysteine ligase  41.29 
 
 		 518 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2834  glutamate--cysteine ligase  40.3 
 
 		 537 aa  392  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000012706  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0134  glutamate--cysteine ligase  40.3 
 
 		 537 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2302  glutamate--cysteine ligase  40.3 
 
 		 537 aa  392  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2325  glutamate--cysteine ligase  40.3 
 
 		 537 aa  392  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.82079  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3953  glutamate--cysteine ligase  40.58 
 
 		 538 aa  389  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3571  glutamate--cysteine ligase, monofunctional  41.39 
 
 		 518 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1925  glutamate--cysteine ligase  39.68 
 
 		 519 aa  381  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.196838 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0046  glutamate--cysteine ligase  41.89 
 
 		 526 aa  377  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4484  glutamate--cysteine ligase  40.31 
 
 		 538 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0203665  unclonable  0.00000138966 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0465  glutamate--cysteine ligase  41.85 
 
 		 518 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260743  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2262  glutamate-cysteine ligase  38.65 
 
 		 518 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0149794  unclonable  0.0000000142325 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1308  glutamate--cysteine ligase  39.24 
 
 		 527 aa  373  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0035  glutamate-cysteine ligase  40.72 
 
 		 527 aa  368  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0043  glutamate--cysteine ligase, monofunctional  40.98 
 
 		 527 aa  369  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2521  glutamate-cysteine ligase  38.4 
 
 		 510 aa  360  3e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000545569 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1339  glutamate/cysteine ligase  38.4 
 
 		 510 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.881569  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2471  glutamate--cysteine ligase  38.11 
 
 		 509 aa  353  5.9999999999999994e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257873 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>