More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02745 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  45.84 
 
 		 877 aa  708    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  51.85 
 
 		 867 aa  804    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  43.22 
 
 		 867 aa  669    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  44.86 
 
 		 857 aa  697    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  43.86 
 
 		 870 aa  678    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  43.37 
 
 		 861 aa  680    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  42.02 
 
 		 869 aa  672    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  50.78 
 
 		 856 aa  859    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  100 
 
 		 1015 aa  2077    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  44.76 
 
 		 851 aa  689    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  43.8 
 
 		 858 aa  682    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  43.51 
 
 		 867 aa  672    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  39.03 
 
 		 823 aa  560  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  34.29 
 
 		 868 aa  473  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  33.26 
 
 		 864 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  35.11 
 
 		 800 aa  436  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  34.78 
 
 		 800 aa  416  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  32.24 
 
 		 817 aa  410  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 		 843 aa  412  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  33.03 
 
 		 872 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  32.53 
 
 		 803 aa  399  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  32.52 
 
 		 853 aa  396  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 797 aa  392  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 948 aa  392  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  32.29 
 
 		 797 aa  392  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  32.95 
 
 		 812 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  32.91 
 
 		 812 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  32.17 
 
 		 797 aa  392  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  32.95 
 
 		 812 aa  389  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 797 aa  389  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  32.29 
 
 		 817 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  31.73 
 
 		 795 aa  369  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  32.68 
 
 		 797 aa  362  2e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 853 aa  357  7.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  30.47 
 
 		 788 aa  355  2.9999999999999997e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  31.35 
 
 		 847 aa  352  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 788 aa  352  3e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 883 aa  350  8e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 887 aa  341  4e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  32.15 
 
 		 848 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  32 
 
 		 815 aa  337  5e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  32.15 
 
 		 821 aa  337  7e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  29.39 
 
 		 870 aa  329  1.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  28.28 
 
 		 961 aa  324  5e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 874 aa  323  9.000000000000001e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.14 
 
 		 799 aa  315  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 803 aa  315  2.9999999999999996e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  30.47 
 
 		 811 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 933 aa  300  7e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.12 
 
 		 832 aa  299  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  30.49 
 
 		 948 aa  298  3e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 871 aa  289  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 947 aa  285  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  28.44 
 
 		 818 aa  275  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  30.15 
 
 		 847 aa  274  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  36.01 
 
 		 800 aa  272  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 795 aa  258  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 850 aa  253  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  33.93 
 
 		 784 aa  249  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 987 aa  249  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  31.15 
 
 		 793 aa  238  5.0000000000000005e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 793 aa  236  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  32.7 
 
 		 811 aa  231  5e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 849 aa  226  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  33.66 
 
 		 795 aa  226  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  31.4 
 
 		 811 aa  214  7.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  30.17 
 
 		 840 aa  204  5e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  30.5 
 
 		 918 aa  202  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 804 aa  201  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  37.57 
 
 		 884 aa  201  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 835 aa  200  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  29.18 
 
 		 924 aa  189  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  31.23 
 
 		 842 aa  188  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 852 aa  180  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 815 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 924 aa  169  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 885 aa  160  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  27.86 
 
 		 833 aa  159  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 		 842 aa  154  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 879 aa  147  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  32.23 
 
 		 858 aa  147  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  34.24 
 
 		 816 aa  133  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  24.89 
 
 		 880 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 		 813 aa  130  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 836 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  24.97 
 
 		 853 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  24.97 
 
 		 853 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 853 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3124  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 973 aa  128  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308275 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  25.99 
 
 		 839 aa  127  9e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  23.95 
 
 		 853 aa  126  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 853 aa  126  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2243  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 1000 aa  124  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  38.05 
 
 		 873 aa  119  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 842 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 838 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1520  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 1055 aa  112  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  21.79 
 
 		 936 aa  111  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 912 aa  110  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0739  TonB-dependent receptor  34.1 
 
 		 912 aa  105  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0580341  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>