More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02741 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02741  sodium-type flagellar protein MotY  100 
 
 
290 aa  607  1e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1400  OmpA/MotB  67.84 
 
 
287 aa  421  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000117865  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3471  sodium-type flagellar protein MotY  52.1 
 
 
291 aa  327  1e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1521  OmpA/MotB domain-containing protein  48.39 
 
 
286 aa  307  1e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227378  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2539  OmpA/MotB domain-containing protein  47.06 
 
 
290 aa  300  3e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  5.3368e-07  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1457  OmpA/MotB domain-containing protein  47.54 
 
 
289 aa  297  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.298949  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2446  OmpA/MotB domain-containing protein  46.71 
 
 
290 aa  297  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.91416e-06  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1398  OmpA/MotB  46.32 
 
 
289 aa  296  3e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  46.37 
 
 
290 aa  295  5e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  8.19929e-09  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1851  OmpA/MotB domain-containing protein  44.91 
 
 
297 aa  293  3e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.46772e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1601  OmpA/MotB domain-containing protein  45.67 
 
 
289 aa  292  5e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  1.9607e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2544  OmpA/MotB domain protein  45.33 
 
 
289 aa  291  7e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  3.20218e-09  hitchhiker  1.31905e-07 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1736  OmpA/MotB domain-containing protein  45.33 
 
 
289 aa  291  7e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  2.67219e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1740  OmpA/MotB domain-containing protein  45.33 
 
 
289 aa  291  7e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.40538e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1779  OmpA/MotB domain-containing protein  45.33 
 
 
289 aa  291  7e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.49804e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2738  OmpA/MotB domain-containing protein  46.47 
 
 
289 aa  290  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00376202  hitchhiker  0.000469935 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2570  OmpA/MotB domain-containing protein  46.52 
 
 
289 aa  289  5e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.24837e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2092  OmpA/MotB  46.27 
 
 
289 aa  281  8e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.4464e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002940  sodium-type flagellar protein MotY precursor  40.48 
 
 
293 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  8.66037e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0529  sodium-type flagellar protein MotY  40.49 
 
 
294 aa  231  8e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.08227e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02990  hypothetical protein  39.45 
 
 
293 aa  230  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1863  sodium-type flagellar protein MotY precursor  38.29 
 
 
292 aa  218  8e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1532  OmpA/MotB domain-containing protein  33.68 
 
 
296 aa  159  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.975631  normal  0.253081 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2504  OmpA/MotB domain-containing protein  32.06 
 
 
309 aa  149  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1621  outer membrane protein  29.1 
 
 
321 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0517761  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3893  OmpA/MotB  30 
 
 
300 aa  139  5e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18720  OmpA family membrane protein  29.1 
 
 
321 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.746177  normal  0.130207 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2427  putative outer membrane protein  33.09 
 
 
322 aa  132  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1393  OmpA/MotB domain-containing protein  27.7 
 
 
315 aa  131  1e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.567288 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3034  hypothetical protein  29.19 
 
 
294 aa  129  8e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2892  hypothetical protein  29.19 
 
 
294 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753.2  sodium-type flagellar protein MotY  45.45 
 
 
122 aa  126  4e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1128  OmpA/MotB domain-containing protein  27.59 
 
 
313 aa  121  1e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1087  OmpA family outer membrane protein  27.59 
 
 
317 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4518  OmpA/MotB  26.55 
 
 
302 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4325  OmpA/MotB domain-containing protein  28.28 
 
 
308 aa  120  4e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4156  sodium-type flagellar protein MotY, putative  29.08 
 
 
301 aa  117  2e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1116  OmpA/MotB domain-containing protein  25.95 
 
 
324 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2453  sodium-type flagellar protein MotY, putative  26.67 
 
 
280 aa  105  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.230815  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0080  hypothetical protein  25.43 
 
 
304 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.580583  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0086  OmpA/MotB domain-containing protein  27.53 
 
 
303 aa  89.7  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3567  OmpA/MotB domain-containing protein  25.75 
 
 
295 aa  88.2  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001183  putative sodium-type flagellar protein MotY precursor  24.7 
 
 
339 aa  86.3  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1455  OmpA/MotB domain-containing protein  24.14 
 
 
324 aa  79.3  6e-14  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.935476  normal  0.139769 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  41.51 
 
 
333 aa  77  3e-13  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  1.97596e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  32.24 
 
 
890 aa  77.4  3e-13  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  37 
 
 
498 aa  76.6  4e-13  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  47.3 
 
 
219 aa  74.7  2e-12  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  45.95 
 
 
219 aa  73.6  4e-12  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  40 
 
 
330 aa  73.6  4e-12  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  4.10155e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  44.59 
 
 
218 aa  73.2  5e-12  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  44.59 
 
 
218 aa  73.2  5e-12  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  46.84 
 
 
239 aa  72.8  6e-12  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  43.59 
 
 
242 aa  72.8  6e-12  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  39.62 
 
 
294 aa  72.8  7e-12  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  46.84 
 
 
220 aa  72.4  8e-12  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0693  OmpA/MotB  38.68 
 
 
166 aa  72.4  8e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  41.18 
 
 
214 aa  72.4  9e-12  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  3.03101e-06 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  38.78 
 
 
205 aa  71.6  1e-11  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 
210 aa  72  1e-11  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  2.6968e-08  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  40.19 
 
 
334 aa  71.2  2e-11  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 
220 aa  70.9  2e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 
217 aa  70.9  2e-11  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0992  OmpA/MotB domain-containing protein  37.37 
 
 
190 aa  71.2  2e-11  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  44.44 
 
 
220 aa  70.5  3e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 
220 aa  70.5  3e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  41.03 
 
 
212 aa  70.5  3e-11  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  37.11 
 
 
656 aa  70.9  3e-11  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  53.85 
 
 
207 aa  70.1  4e-11  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  37.76 
 
 
459 aa  70.1  5e-11  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  36.45 
 
 
215 aa  69.7  6e-11  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  36.44 
 
 
348 aa  69.7  6e-11  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04970  hypothetical protein  26.35 
 
 
350 aa  69.3  8e-11  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  41.03 
 
 
243 aa  68.9  9e-11  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  37.38 
 
 
210 aa  68.9  9e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  37.93 
 
 
417 aa  68.9  9e-11  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  37.38 
 
 
210 aa  68.9  9e-11  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  4.07187e-05 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  35.81 
 
 
200 aa  68.6  1e-10  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
263 aa  68.9  1e-10  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  38.46 
 
 
220 aa  68.9  1e-10  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1848  NAD-dependent DNA ligase  35.14 
 
 
195 aa  68.2  1e-10  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.449373  normal  0.815473 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
263 aa  68.6  1e-10  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  39.05 
 
 
220 aa  67.4  2e-10  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.3 
 
 
220 aa  68.2  2e-10  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  31.86 
 
 
376 aa  67.8  2e-10  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  1.02046e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  35.24 
 
 
230 aa  67.8  2e-10  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  5.54839e-06 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  36.19 
 
 
175 aa  67.8  2e-10  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 
230 aa  67.8  2e-10  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  43.24 
 
 
219 aa  67.4  2e-10  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  36.28 
 
 
316 aa  67.8  2e-10  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 
230 aa  67.8  2e-10  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  40.21 
 
 
224 aa  67.4  3e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0672  OmpA/MotB domain-containing protein  46.27 
 
 
165 aa  67  3e-10  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  39.18 
 
 
296 aa  67  3e-10  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  51.47 
 
 
216 aa  67  3e-10  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  30.67 
 
 
417 aa  67.4  3e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  7.26931e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  34.34 
 
 
345 aa  67  3e-10  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 
729 aa  67  3e-10  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  32.31 
 
 
641 aa  67.4  3e-10  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  37.08 
 
 
328 aa  67  4e-10  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>