99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02733 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02733  electron transport complex protein RnfG  100 
 
 		 257 aa  529  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2969  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  49.36 
 
 		 215 aa  238  8e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02968  electron transport complex protein RnfG  47.62 
 
 		 212 aa  221  7e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002945  electron transport complex protein RnfG  46.58 
 
 		 210 aa  219  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.564885  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2277  electron transport complex protein RnfG  44.44 
 
 		 212 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.050891  normal  0.93229 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0534  electron transport complex protein RnfG  47.01 
 
 		 209 aa  201  8e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000007202  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1834  electron transport complex protein RnfG  43.51 
 
 		 215 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.856968  normal  0.105681 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2061  electron transport complex protein RnfG  44.78 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000406522  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4549  electron transport complex protein RnfG  44.35 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2263  electron transport complex protein RnfG  44.35 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00083065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2108  electron transport complex protein RnfG  44.35 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.220327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2068  electron transport complex protein RnfG  45.22 
 
 		 208 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00132342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1907  electron transport complex protein RnfG  45.22 
 
 		 208 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2040  electron transport complex protein RnfG  44.1 
 
 		 208 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.8254  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2512  electron transport complex protein RnfG  43.46 
 
 		 212 aa  193  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2070  electron transport complex protein RnfG  42.06 
 
 		 212 aa  193  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2172  electron transport complex protein RnfG  44.78 
 
 		 208 aa  192  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2176  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  45.65 
 
 		 215 aa  190  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1846  electron transport complex protein RnfG  44.16 
 
 		 208 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000030729  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2404  electron transport complex protein RnfG  44.74 
 
 		 215 aa  189  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.59015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2560  electron transport complex protein RnfG  42.36 
 
 		 208 aa  189  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0486766 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1868  electron transport complex protein RnfG  43.83 
 
 		 210 aa  186  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803831  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01601  electron transport complex protein RnfG  46.12 
 
 		 206 aa  184  8e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00338935  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1998  electron transport complex protein RnfG  46.12 
 
 		 206 aa  184  8e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0210205  normal  0.220533 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01591  hypothetical protein  46.12 
 
 		 206 aa  184  8e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00493917  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2236  electron transport complex protein RnfG  44.74 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000312896 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1839  electron transport complex protein RnfG  45.69 
 
 		 206 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00239547  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1568  electron transport complex protein RnfG  45.69 
 
 		 206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1820  electron transport complex protein RnfG  45.69 
 
 		 206 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.953623  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2010  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  45.69 
 
 		 206 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00233582  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2343  electron transport complex protein RnfG  45.69 
 
 		 206 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2357  electron transport complex protein RnfG  46.29 
 
 		 207 aa  181  7e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1707  electron transport complex protein RnfG  45.26 
 
 		 206 aa  181  8.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.116117  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1400  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  44.44 
 
 		 211 aa  180  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.50013 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1817  electron transport complex protein RnfG  47.44 
 
 		 206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0386367  decreased coverage  0.000324023 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19230  Electron transport complex, subunit G  42.79 
 
 		 208 aa  178  8e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1565  electron transport complex protein RnfG  43.3 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896563  normal  0.099042 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1920  electron transport complex protein RnfG  43.78 
 
 		 211 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1719  electron transport complex protein RnfG  43.3 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275661  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1887  electron transport complex protein RnfG  43.3 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0734  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  40.52 
 
 		 211 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1625  electron transport complex protein RnfG  42.86 
 
 		 206 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.469993 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1553  electron transport complex protein RnfG  43.3 
 
 		 206 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1636  hypothetical protein  40.89 
 
 		 213 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2195  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  39.04 
 
 		 259 aa  171  9e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.648995  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2630  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  40.71 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2011  electron transport complex protein RnfG  40.17 
 
 		 209 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000172244  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2249  electron transport complex protein RnfG  40.17 
 
 		 209 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000657737  normal  0.472384 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1899  electron transport complex protein RnfG  40.17 
 
 		 209 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00381532  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1867  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  38.36 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2321  electron transport complex protein RnfG  41.59 
 
 		 209 aa  168  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2021  electron transport complex protein RnfG  41.15 
 
 		 209 aa  168  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2158  electron transport complex protein RnfG  40.45 
 
 		 210 aa  168  9e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.915166  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18900  hypothetical protein  40.27 
 
 		 214 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0705821  normal  0.0432187 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0812  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  38.89 
 
 		 220 aa  161  8.000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151893  normal  0.42525 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1032  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  40.18 
 
 		 217 aa  160  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480333  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1063  electron transport complex protein RnfG  42.51 
 
 		 207 aa  159  4e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137113  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2019  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  42.67 
 
 		 216 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1171  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  36.82 
 
 		 210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1541  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  40.18 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.174651 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0934  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  39.19 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2897  electron transport complex, G subunit  39.04 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1159  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  38.89 
 
 		 222 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2820  electron transport complex, G subunit  42.93 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3196  RnfA-Nqr electron transport subunit  36.89 
 
 		 220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.401599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2993  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  36.49 
 
 		 218 aa  135  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3935  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.41 
 
 		 219 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00699897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0686  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  37.05 
 
 		 211 aa  128  9.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50940  Electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  38.76 
 
 		 229 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0444757  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3196  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  34.93 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0287  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.35 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0817829  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1489  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  37.27 
 
 		 229 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3236  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.29 
 
 		 222 aa  123  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556232  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0722  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.41 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.271576  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1783  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.21 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1794  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.35 
 
 		 222 aa  115  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  hitchhiker  0.000880554 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4511  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.07 
 
 		 201 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304258 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1094  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.16 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1134  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.69 
 
 		 200 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.82 
 
 		 200 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1531  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.64 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00374795  normal  0.943593 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1123  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25.55 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0261  NADH:ubiquinone oxidoreductase, RnfG subunit-like  28.18 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1312  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.09 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.777604  normal  0.23386 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0308  FMN-binding domain-containing protein  28.7 
 
 		 199 aa  62  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0470915  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1157  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.21 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0986  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.75 
 
 		 181 aa  57  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625397  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1382  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.5 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000652446  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1958  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.85 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.537285  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0496  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  36.47 
 
 		 177 aa  49.3  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00037002  hitchhiker  0.000327646 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0081  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.4 
 
 		 193 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0628211  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.17 
 
 		 344 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0617616  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0702  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.64 
 
 		 224 aa  47  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0678  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.64 
 
 		 224 aa  47  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1093  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  24.07 
 
 		 178 aa  45.8  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.997884  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  21.86 
 
 		 368 aa  45.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1325  FMN-binding domain protein  26.99 
 
 		 181 aa  43.9  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000405195  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1573  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  37.35 
 
 		 225 aa  42.7  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0159916  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0651  FMN-binding domain-containing protein  34.62 
 
 		 203 aa  42.7  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.330764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>