194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02708 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  50.89 
 
 
617 aa  659    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  51.9 
 
 
615 aa  661    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  69.88 
 
 
618 aa  868    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  52.31 
 
 
615 aa  659    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  51.98 
 
 
615 aa  655    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  52.12 
 
 
625 aa  647    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  50.24 
 
 
616 aa  642    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  52.15 
 
 
615 aa  659    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  52.22 
 
 
614 aa  665    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  50.08 
 
 
616 aa  641    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  52.3 
 
 
613 aa  642    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  100 
 
 
617 aa  1282    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  51.77 
 
 
627 aa  661    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  51.26 
 
 
628 aa  637    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  50.08 
 
 
616 aa  637    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  52.97 
 
 
613 aa  674    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  50.25 
 
 
616 aa  641    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  54.96 
 
 
618 aa  632  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  51.62 
 
 
602 aa  623  1e-177  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  52.12 
 
 
624 aa  618  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  52.28 
 
 
625 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  48.21 
 
 
605 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  46.33 
 
 
628 aa  548  1e-154  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  44.41 
 
 
629 aa  534  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  42.31 
 
 
608 aa  459  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  42.83 
 
 
614 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  41.88 
 
 
607 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  41.88 
 
 
607 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  41.88 
 
 
607 aa  427  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  40.8 
 
 
611 aa  428  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  42.25 
 
 
614 aa  427  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  42.33 
 
 
617 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  42.33 
 
 
614 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  42.33 
 
 
614 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  39.37 
 
 
622 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  36.49 
 
 
611 aa  386  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  38.41 
 
 
585 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  36.68 
 
 
616 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  35.96 
 
 
611 aa  373  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  35.24 
 
 
609 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  35.5 
 
 
609 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  35.32 
 
 
616 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  35.18 
 
 
609 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  35.96 
 
 
609 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  36.06 
 
 
609 aa  372  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  35.08 
 
 
609 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  35.89 
 
 
609 aa  372  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  35.07 
 
 
610 aa  366  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  37.08 
 
 
1283 aa  368  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  34.11 
 
 
607 aa  364  3e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  36.29 
 
 
609 aa  363  6e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  34.47 
 
 
601 aa  361  2e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  33.81 
 
 
609 aa  361  2e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  34.8 
 
 
603 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  35.43 
 
 
609 aa  361  3e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  34.96 
 
 
603 aa  360  4e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  34.47 
 
 
601 aa  359  9e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  34.31 
 
 
601 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  34.9 
 
 
603 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  34.63 
 
 
603 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  35.06 
 
 
603 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  33.33 
 
 
601 aa  350  5e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  34.09 
 
 
602 aa  350  5e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  34.91 
 
 
599 aa  345  1e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  34.95 
 
 
588 aa  341  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  34.84 
 
 
589 aa  339  7e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  33.56 
 
 
629 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  34.28 
 
 
583 aa  337  2.9999999999999997e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  33.93 
 
 
591 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  33.11 
 
 
594 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  33.85 
 
 
619 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  32.02 
 
 
630 aa  335  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  32.58 
 
 
635 aa  331  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  32.52 
 
 
635 aa  332  2e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  32.63 
 
 
635 aa  331  3e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  33.28 
 
 
609 aa  330  5.0000000000000004e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  36.63 
 
 
628 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  35.52 
 
 
621 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  34.4 
 
 
611 aa  327  6e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  31.92 
 
 
599 aa  326  1e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  32.52 
 
 
610 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  33.84 
 
 
587 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  34.41 
 
 
604 aa  320  5e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  32.24 
 
 
599 aa  317  5e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  30.89 
 
 
635 aa  317  5e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  34.46 
 
 
621 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  33.45 
 
 
605 aa  315  1.9999999999999998e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  30.79 
 
 
637 aa  314  3.9999999999999997e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  34.66 
 
 
613 aa  312  1e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  34.54 
 
 
605 aa  311  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  33.49 
 
 
595 aa  309  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  35.2 
 
 
586 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  32.69 
 
 
592 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  33.28 
 
 
619 aa  303  6.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  34.62 
 
 
590 aa  303  9e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  33.99 
 
 
589 aa  301  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  34.81 
 
 
584 aa  300  4e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0165  hypothetical protein  33.33 
 
 
608 aa  298  1e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4257  hypothetical protein  36.12 
 
 
636 aa  298  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00173192  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  35.06 
 
 
633 aa  297  5e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>