20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02633 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02633  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  381  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0927  hypothetical protein  43.15 
 
 
156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000534724  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0984  hypothetical protein  45.27 
 
 
160 aa  125  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.229596  normal  0.532531 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0560  hypothetical protein  41.83 
 
 
159 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.95108 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0732  hypothetical protein  39.87 
 
 
154 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.136479  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61450  hypothetical protein  36.73 
 
 
157 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.428854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5293  hypothetical protein  36.73 
 
 
157 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0187  hypothetical protein  43.85 
 
 
159 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4441  hypothetical protein  36.55 
 
 
157 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1896  hypothetical protein  36.81 
 
 
165 aa  98.6  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0748  hypothetical protein  33.78 
 
 
157 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0117939  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2080  hypothetical protein  35.06 
 
 
158 aa  95.9  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0789  hypothetical protein  34.48 
 
 
157 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3978  hypothetical protein  40.62 
 
 
169 aa  95.5  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248075  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0776  hypothetical protein  33.11 
 
 
157 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3247  hypothetical protein  34.25 
 
 
156 aa  94  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0620  hypothetical protein  32.03 
 
 
159 aa  90.5  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.573395  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0034  hypothetical protein  32.17 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3327  hypothetical protein  33.81 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5656  hypothetical protein  30.3 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>