More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02590 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02590  Glycosyl transferase, family 2  100 
 
 		 328 aa  669    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105398  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2124  glycosyl transferase family protein  68.59 
 
 		 340 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001053  glycosyltransferase  55.97 
 
 		 333 aa  384  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3710  glycosyl transferase family 2  54.95 
 
 		 345 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0328231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1957  glycosyl transferase family protein  53.12 
 
 		 327 aa  351  8.999999999999999e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.890096  normal  0.0695773 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2554  glycosyl transferase family 2  49.68 
 
 		 385 aa  336  2.9999999999999997e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1180  glycosyl transferase family 2  50 
 
 		 333 aa  323  2e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3369  glycosyl transferase family protein  52.37 
 
 		 349 aa  323  4e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000732835  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4518  glycosyl transferase family protein  50.62 
 
 		 346 aa  320  3e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000506598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2360  glycosyl transferase family 2  47.44 
 
 		 354 aa  318  9e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.571738  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0014  glycosyl transferase family protein  50 
 
 		 357 aa  317  3e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00192438  hitchhiker  0.0000617059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3609  glycosyl transferase family protein  47.9 
 
 		 319 aa  316  4e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2557  glycosyl transferase family 2  49.36 
 
 		 321 aa  315  7e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1795  glycosyl transferase family 2  47.75 
 
 		 357 aa  301  9e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00120607  normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0044  glycosyltransferase  48.4 
 
 		 352 aa  300  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117079  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  35.05 
 
 		 253 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2614  glycosyl transferase family 2  36.59 
 
 		 253 aa  126  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501358  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  34.97 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  30.15 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  30.45 
 
 		 309 aa  102  7e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 		 355 aa  99.4  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.46 
 
 		 220 aa  99.4  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 		 229 aa  99.4  8e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1142  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  29.57 
 
 		 321 aa  97.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 		 228 aa  97.4  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  32.16 
 
 		 353 aa  97.4  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1109  glycosyltransferase  32.44 
 
 		 531 aa  97.1  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.405384  normal  0.415248 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  26.55 
 
 		 448 aa  96.3  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 		 313 aa  96.3  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  32.67 
 
 		 232 aa  95.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  28.04 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  28.07 
 
 		 749 aa  94.7  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 		 228 aa  94  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 		 228 aa  92.8  8e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0441  glycosyl transferase family protein  31.61 
 
 		 271 aa  92.4  9e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397838  normal  0.437223 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4209  glycosyl transferase family 2  25.08 
 
 		 346 aa  92.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.220629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8133  glycosyl transferase, family 2  29.84 
 
 		 260 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0483  hypothetical protein  34.3 
 
 		 247 aa  91.7  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 374 aa  91.3  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  27.24 
 
 		 313 aa  90.5  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2074  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 		 327 aa  89.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4238  glycosyl transferase family protein  24.24 
 
 		 332 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.440412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  26.87 
 
 		 299 aa  89.4  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 		 243 aa  89.4  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0997  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 		 226 aa  89  9e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 346 aa  89.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  25.24 
 
 		 310 aa  89  9e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 		 378 aa  89  9e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7628  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.325444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  34 
 
 		 336 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0121  b-glycosyltransferase  33.94 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 		 229 aa  87.8  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  27.13 
 
 		 314 aa  87.8  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0054  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.39 
 
 		 528 aa  87.4  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00397279  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0256  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 		 317 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.0678648 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2299  glycosyl transferase family protein  24.75 
 
 		 332 aa  87  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1737  glycosyl transferase family protein  24.92 
 
 		 312 aa  86.7  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5883  glycosyl transferase family protein  27 
 
 		 314 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  25.08 
 
 		 322 aa  86.3  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000000647727  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0549  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 		 321 aa  86.3  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000233931  normal  0.956589 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3866  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 		 324 aa  86.3  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0214545  decreased coverage  0.00118676 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1495  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.025805  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  27.45 
 
 		 324 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.73 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2355  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000348766 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0730  glycosyl transferase family protein  26.35 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578304  normal  0.224353 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0487  glycosyl transferase family 2  26.6 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1971  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.02 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0974  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.01 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.85219  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1105  glycosyl transferase family 2  34.12 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000104847  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.78 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  25.76 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1340  glycosyl transferase family protein  29.24 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275627  normal  0.171595 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2243  glycosyl transferase family protein  32.68 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3944  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 		 242 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 		 221 aa  82  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0438  glycosyl transferase family protein  28.01 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.599386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2410  glycosyl transferase family 2  25.44 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.488157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8285  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 		 694 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.493669 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3212  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08960  glycosyl transferase  29 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  24.67 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  25.95 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  25.74 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6508  glycosyl transferase family 2  33.14 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000357167  normal  0.251982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>