More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02547 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02547  proton/glutamate symporter  100 
 
 		 417 aa  814    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003079  proton/glutamate symporter  85.18 
 
 		 419 aa  679    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000289708  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02764  hypothetical protein  82.65 
 
 		 419 aa  685    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0157  proton/glutamate symporter  70.54 
 
 		 412 aa  551  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0147  sodium:dicarboxylate symporter  70.37 
 
 		 409 aa  553  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0142  sodium:dicarboxylate symporter  70.02 
 
 		 409 aa  553  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0142  sodium:dicarboxylate symporter  69.78 
 
 		 409 aa  551  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  68.6 
 
 		 416 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  68.36 
 
 		 416 aa  548  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  68.12 
 
 		 416 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  68.12 
 
 		 416 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0145  sodium:dicarboxylate symporter  66.75 
 
 		 416 aa  534  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1116  sodium:dicarboxylate symporter  66.09 
 
 		 408 aa  531  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1570  sodium:dicarboxylate symporter  63.94 
 
 		 420 aa  525  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3625  sodium:dicarboxylate symporter  69.9 
 
 		 408 aa  524  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1046  sodium:dicarboxylate symporter  67.49 
 
 		 408 aa  523  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0737  proton/glutamate symporter  83.9 
 
 		 252 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0146822  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0790  proton/glutamate symporter  75.56 
 
 		 190 aa  276  5e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000536716  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  39.47 
 
 		 434 aa  275  9e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  37.41 
 
 		 435 aa  272  7e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  42.11 
 
 		 433 aa  272  8.000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  37.41 
 
 		 440 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  37.41 
 
 		 440 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  40.1 
 
 		 445 aa  272  9e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  36.74 
 
 		 424 aa  270  4e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  36.98 
 
 		 433 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  37.84 
 
 		 409 aa  269  7e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  36.39 
 
 		 443 aa  268  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  40.22 
 
 		 434 aa  268  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  40.72 
 
 		 434 aa  267  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  39.67 
 
 		 439 aa  266  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  37.34 
 
 		 444 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  39.78 
 
 		 437 aa  266  4e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  37.34 
 
 		 444 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  37.09 
 
 		 444 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  37.09 
 
 		 444 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  39.73 
 
 		 440 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  39.73 
 
 		 440 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  38.46 
 
 		 432 aa  263  6e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  39.73 
 
 		 440 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  36.36 
 
 		 409 aa  262  8e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  39.84 
 
 		 437 aa  262  8e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  39.73 
 
 		 440 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  37.57 
 
 		 436 aa  262  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  39.56 
 
 		 437 aa  261  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1395  glutamate/aspartate:proton symporter  35.95 
 
 		 438 aa  261  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  35.8 
 
 		 411 aa  261  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  39.56 
 
 		 437 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  36.05 
 
 		 411 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  36.05 
 
 		 411 aa  260  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  36.05 
 
 		 411 aa  260  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  36.05 
 
 		 411 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  36.05 
 
 		 411 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  35.8 
 
 		 411 aa  260  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  36.3 
 
 		 411 aa  259  4e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  35.92 
 
 		 411 aa  259  6e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1793  glutamate/aspartate:proton symporter  37 
 
 		 438 aa  259  7e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  39.23 
 
 		 436 aa  258  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  35.68 
 
 		 442 aa  258  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  35.56 
 
 		 411 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  40.16 
 
 		 437 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  36.78 
 
 		 430 aa  258  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  35.8 
 
 		 411 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  37.41 
 
 		 444 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  34.93 
 
 		 449 aa  257  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  37.41 
 
 		 444 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  37.66 
 
 		 443 aa  255  9e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1290  sodium:dicarboxylate symporter  36.5 
 
 		 443 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3946  glutamate/aspartate:proton symporter  36.18 
 
 		 438 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3834  glutamate/aspartate:proton symporter  37.16 
 
 		 438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.918484  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3920  glutamate/aspartate:proton symporter  37.16 
 
 		 438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  36.24 
 
 		 436 aa  254  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  37.16 
 
 		 443 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  38.24 
 
 		 410 aa  249  9e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4677  glutamate/aspartate:proton symporter  35.94 
 
 		 436 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4537  glutamate/aspartate:proton symporter  35.94 
 
 		 436 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.94288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4628  glutamate/aspartate:proton symporter  35.94 
 
 		 436 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4628  glutamate/aspartate:proton symporter  35.94 
 
 		 436 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.740703 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4543  glutamate/aspartate:proton symporter  35.94 
 
 		 436 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.707717  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  38.59 
 
 		 449 aa  247  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2704  sodium:dicarboxylate symporter  36.25 
 
 		 438 aa  246  4e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  36.9 
 
 		 423 aa  246  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  37.57 
 
 		 447 aa  246  6e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03949  glutamate/aspartate:proton symporter  35.94 
 
 		 437 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4322  glutamate/aspartate:proton symporter  35.94 
 
 		 437 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4633  glutamate/aspartate:proton symporter  35.94 
 
 		 437 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03909  hypothetical protein  35.94 
 
 		 437 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0137  glutamate/aspartate:proton symporter  37.34 
 
 		 442 aa  246  8e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0298  sodium:dicarboxylate symporter  35.94 
 
 		 438 aa  246  8e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0042  glutamate/aspartate:proton symporter  37.09 
 
 		 443 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192783  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5583  glutamate/aspartate:proton symporter  35.7 
 
 		 437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3950  glutamate/aspartate:proton symporter  35.7 
 
 		 437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4540  glutamate/aspartate:proton symporter  35.7 
 
 		 437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4598  glutamate/aspartate:proton symporter  35.7 
 
 		 437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  37.35 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3915  sodium:dicarboxylate symporter  35.7 
 
 		 437 aa  244  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  37.25 
 
 		 423 aa  242  9e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  37.25 
 
 		 423 aa  242  9e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  37.25 
 
 		 423 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  37 
 
 		 423 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>