More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02515 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02515  putative xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  100 
 
 
480 aa  994  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2424  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  57.95 
 
 
480 aa  562  1e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4278  xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  45.57 
 
 
484 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.513605  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1590  xanthine dehydrogenase, small subunit  45.57 
 
 
484 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.597851 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3604  xanthine dehydrogenase, small subunit  45.98 
 
 
484 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.703198  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3842  xanthine dehydrogenase, small subunit  45.81 
 
 
484 aa  435  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.977655  normal  0.775119 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2751  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  47.13 
 
 
479 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0433722  normal  0.51663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22290  xanthine dehydrogenase, small subunit  44.93 
 
 
496 aa  417  1e-115  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1815  ferredoxin:molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:[2Fe-2S]-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  44.12 
 
 
484 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522719  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44710  xanthine dehydrogenase  45.36 
 
 
484 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0199275 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1797  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  43.97 
 
 
484 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.014868  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3809  xanthine dehydrogenase  45.36 
 
 
484 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4864  xanthine dehydrogenase, iron-sulfur binding subunit  45.1 
 
 
494 aa  405  1e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3660  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  44.26 
 
 
484 aa  408  1e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807153  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2300  xanthine dehydrogenase small subunit  47.21 
 
 
476 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.289203  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0713  xanthine dehydrogenase, small subunit  42.65 
 
 
512 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2699  xanthine dehydrogenase small subunit  41.34 
 
 
499 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2704  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  40.66 
 
 
487 aa  381  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0893  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  42.89 
 
 
498 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366411  normal  0.919592 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0950  xanthine dehydrogenase, subunit A  44.24 
 
 
543 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4257  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  40.04 
 
 
481 aa  372  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0728  xanthine dehydrogenase, small subunit  41.65 
 
 
527 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2552  xanthine dehydrogenase, small subunit  41.27 
 
 
526 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.865646 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0711  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  41.5 
 
 
520 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2425  ferredoxin:molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:(2Fe-2S)-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  41.51 
 
 
500 aa  365  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0771886  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3924  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  42.19 
 
 
516 aa  364  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0832  2Fe-2S ferredoxin, iron-sulfur binding site  41.52 
 
 
528 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2448  xanthine dehydrogenase, small subunit  43.12 
 
 
507 aa  364  2e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0804  xanthine dehydrogenase, small subunit  41.73 
 
 
523 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0348  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  41.52 
 
 
528 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0658875  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3041  xanthine dehydrogenase, small subunit  43.09 
 
 
515 aa  363  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0266852 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3102  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  42.92 
 
 
507 aa  362  6e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238239  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4620  xanthine dehydrogenase small subunit  40.83 
 
 
493 aa  356  4e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2833  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  38.83 
 
 
492 aa  357  4e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1130  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  42.14 
 
 
507 aa  355  9e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.16283  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0451  xanthine dehydrogenase small subunit  38.78 
 
 
496 aa  355  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608502  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5002  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  43.81 
 
 
512 aa  354  2e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0860  xanthine dehydrogenase, small subunit  41.06 
 
 
504 aa  353  5e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3133  xanthine dehydrogenase, small subunit  41.05 
 
 
488 aa  352  7e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207802  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3907  xanthine dehydrogenase, small subunit  40.51 
 
 
542 aa  351  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3320  xanthine dehydrogenase  39.37 
 
 
490 aa  350  4e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151633  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0226  xanthine dehydrogenase, small subunit  40.86 
 
 
497 aa  349  7e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.183423  normal  0.106399 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4499  xanthine dehydrogenase small subunit  39.96 
 
 
496 aa  348  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.999061  normal  0.0980927 
 
 
-
 
NC_004310  BR0349  xanthine dehydrogenase, putative  38.41 
 
 
492 aa  347  4e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5910  xanthine dehydrogenase, small subunit  38.63 
 
 
537 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1035  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  39.96 
 
 
506 aa  345  1e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.22588  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0365  xanthine dehydrogenase, small subunit  38.41 
 
 
492 aa  345  1e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2861  xanthine dehydrogenase, small subunit  40.84 
 
 
488 aa  343  3e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0406506  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1922  xanthine dehydrogenase, small subunit  39.5 
 
 
504 aa  343  4e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.501378 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1339  xanthine dehydrogenase, small subunit  41.68 
 
 
501 aa  342  7e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00017372  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1155  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  41.62 
 
 
518 aa  341  2e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.874334  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3554  xanthine dehydrogenase, small subunit  40.78 
 
 
485 aa  340  4e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2095  putative xanthine dehydrogenase (subunit A) oxidoreductase protein  40.17 
 
 
516 aa  340  4e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2422  xanthine dehydrogenase, small subunit  39.51 
 
 
505 aa  338  1e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2246  xanthine dehydrogenase, small subunit  38.88 
 
 
504 aa  338  1e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3237  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  40.57 
 
 
485 aa  338  1e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492862  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3720  xanthine dehydrogenase, small subunit  37.45 
 
 
493 aa  335  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1481  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  37.77 
 
 
571 aa  335  1e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0612404 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0799  putative xanthine dehydrogenase (subunit A) oxidoreductase protein  41.98 
 
 
515 aa  334  2e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3948  hypothetical protein  39.79 
 
 
485 aa  332  8e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.804932  normal  0.121566 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0793  xanthine dehydrogenase, small subunit  38.62 
 
 
507 aa  332  9e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.229921 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0499  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  40.3 
 
 
467 aa  329  6e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.258857 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3886  putative xanthine dehydrogenase  37.96 
 
 
507 aa  328  2e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3460  xanthine dehydrogenase, small subunit  37.2 
 
 
530 aa  325  9e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266307 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1453  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  40.26 
 
 
461 aa  323  3e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0871  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  38.74 
 
 
505 aa  321  2e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222869  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2042  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  38.74 
 
 
505 aa  321  2e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3160  xanthine dehydrogenase, small subunit  38.74 
 
 
505 aa  321  2e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1905  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  38.74 
 
 
505 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.259352  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3215  xanthine dehydrogenase  38.74 
 
 
505 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.413066  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3199  xanthine dehydrogenase family protein, iron-sulfur-binding/FAD-binding subunit  38.74 
 
 
505 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188115  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2705  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  38.74 
 
 
505 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1788  xanthine dehydrogenase, small subunit  39.96 
 
 
467 aa  319  7e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.350368  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1140  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  36.38 
 
 
552 aa  317  2e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.578898  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1408  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  39.96 
 
 
592 aa  317  4e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332531  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2958  putative xanthine dehydrogenase  38.07 
 
 
483 aa  314  3e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0528227 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2603  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  38.76 
 
 
468 aa  308  1e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1789  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  40 
 
 
484 aa  307  2e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0937  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  37.58 
 
 
486 aa  300  5e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3759  xanthine dehydrogenase small subunit  37.5 
 
 
467 aa  292  9e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0259  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  35.41 
 
 
514 aa  291  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1636  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  38.95 
 
 
490 aa  277  4e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05613  Xanthine dehydrogenase (EC 1.17.1.4)(Purine hydroxylase I) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12553]  32.31 
 
 
1363 aa  240  5e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  0.0769199 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6765  (2Fe-2S)-binding domain protein  33.05 
 
 
470 aa  237  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0433  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  28.78 
 
 
450 aa  198  2e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.649108  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15968  predicted protein  30.04 
 
 
1387 aa  173  6e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1961  (2Fe-2S)-binding  50.35 
 
 
161 aa  139  9e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.451517 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1735  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  46.38 
 
 
157 aa  133  8e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0194  (2Fe-2S)-binding domain protein  42.95 
 
 
154 aa  133  9e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1738  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  28.62 
 
 
305 aa  132  1e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1739  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  42.86 
 
 
164 aa  131  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0595  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  47.1 
 
 
168 aa  130  7e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09178  conserved hypothetical protein  31.74 
 
 
1350 aa  130  7e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1503  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  38.92 
 
 
161 aa  129  1e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1818  (2Fe-2S)-binding  41.61 
 
 
156 aa  128  2e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2679  (2Fe-2S)-binding domain protein  43.36 
 
 
157 aa  127  6e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1531  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  41.4 
 
 
164 aa  126  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2773  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  43.97 
 
 
158 aa  124  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  3.54076e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4272  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  40.13 
 
 
167 aa  124  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3040  (2Fe-2S)-binding domain protein  44 
 
 
165 aa  124  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22503  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>