More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02502 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02502  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 809 aa  1638    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00256111  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2225  TonB-dependent receptor  72.16 
 
 		 812 aa  1194    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.946751  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3760  TonB-dependent receptor  32.97 
 
 		 802 aa  358  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0989  TonB-dependent receptor plug  32.39 
 
 		 824 aa  353  7e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.829693  normal  0.277398 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1790  TonB-dependent receptor  32.57 
 
 		 816 aa  343  7e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0607055 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1920  TonB-dependent receptor plug  24.79 
 
 		 800 aa  156  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01786  putative TonB dependent receptor  24.82 
 
 		 779 aa  152  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0396  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 799 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2956  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 790 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3333  TonB-dependent receptor plug  28.81 
 
 		 858 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.198214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  29.15 
 
 		 723 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2136  TonB-dependent siderophore receptor  27.55 
 
 		 722 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.503645  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2124  TonB-dependent siderophore receptor  27.52 
 
 		 722 aa  80.9  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000170131  normal  0.221939 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3863  TonB-dependent siderophore receptor  28.3 
 
 		 733 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000567085  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2339  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 		 722 aa  79  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000312883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0950  TonB-dependent siderophore receptor  26.87 
 
 		 723 aa  77  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000152119  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  28.88 
 
 		 728 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0988  TonB-dependent siderophore receptor  26.87 
 
 		 731 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00021194  normal  0.772446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  28.06 
 
 		 708 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0952  TonB-dependent siderophore receptor  26.12 
 
 		 729 aa  74.3  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000770151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0917  TonB-dependent siderophore receptor  21.66 
 
 		 696 aa  73.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.572242 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  23.78 
 
 		 789 aa  73.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  28.52 
 
 		 742 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  30.26 
 
 		 906 aa  72  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0677  TonB-dependent siderophore receptor  25.78 
 
 		 745 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00133  FhuE receptor  24.91 
 
 		 697 aa  71.2  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 718 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  27.95 
 
 		 733 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  32.31 
 
 		 656 aa  68.9  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  27.75 
 
 		 696 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  27.23 
 
 		 696 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  22.04 
 
 		 797 aa  65.9  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4099  TonB-dependent siderophore receptor  28.43 
 
 		 743 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0727583  decreased coverage  0.00321586 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1841  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 		 696 aa  65.5  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000240616  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  22.44 
 
 		 860 aa  65.1  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  26.89 
 
 		 743 aa  65.1  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1045  TonB-dependent siderophore receptor  26.16 
 
 		 699 aa  64.3  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616371  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5294  TonB-dependent siderophore receptor  23.21 
 
 		 727 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117694 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3474  ferrichrome receptor precursor protein  21.6 
 
 		 719 aa  63.9  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.588367  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  27 
 
 		 806 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 698 aa  62.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3374  TonB-dependent siderophore receptor  23.21 
 
 		 738 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0588335  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  24.88 
 
 		 722 aa  62.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4993  TonB-dependent siderophore receptor  23.21 
 
 		 738 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0250813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  27.08 
 
 		 713 aa  63.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1678  TonB-dependent siderophore receptor  32.73 
 
 		 830 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2580  iron(III) compound receptor  28.04 
 
 		 718 aa  62.4  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000113666  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02230  outer membrane ferripyoverdine receptor  24.62 
 
 		 789 aa  62.8  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  31.82 
 
 		 704 aa  62.4  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  27.5 
 
 		 797 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  22.71 
 
 		 655 aa  62  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 720 aa  62  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  27.06 
 
 		 748 aa  62  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  23.36 
 
 		 828 aa  62.4  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 737 aa  62  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4624  TonB-dependent siderophore receptor  31.03 
 
 		 797 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185618  decreased coverage  0.0000000123032 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1676  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 757 aa  61.2  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4755  TonB-dependent siderophore receptor  31.03 
 
 		 797 aa  61.2  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.251254  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  22.95 
 
 		 828 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0272  TonB-dependent siderophore receptor  25.81 
 
 		 765 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199499 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.18 
 
 		 833 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4761  TonB-dependent siderophore receptor  29.35 
 
 		 797 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1821  TonB-dependent siderophore receptor  28 
 
 		 712 aa  60.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  25.71 
 
 		 817 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 715 aa  60.1  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3233  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 		 738 aa  60.1  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0212526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  22.95 
 
 		 828 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2977  TonB-dependent receptor, plug  27.05 
 
 		 518 aa  59.7  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826241  normal  0.256941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3196  TonB-dependent siderophore receptor  26.24 
 
 		 803 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222384  normal  0.197486 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003321  ferrichrome-iron receptor  26.67 
 
 		 711 aa  59.3  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  24.51 
 
 		 705 aa  59.3  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  27.09 
 
 		 718 aa  58.9  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  24.86 
 
 		 745 aa  58.9  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  22.13 
 
 		 797 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  24.25 
 
 		 715 aa  58.5  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0288  TonB-dependent siderophore receptor  25.45 
 
 		 765 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  0.515749 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  26.1 
 
 		 809 aa  58.5  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  23.4 
 
 		 722 aa  58.5  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3640  TonB-dependent siderophore receptor  25.51 
 
 		 708 aa  58.5  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168279  normal  0.0985281 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 794 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  25.78 
 
 		 746 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3666  TonB-dependent siderophore receptor  25.94 
 
 		 828 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476594 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0540  TonB-dependent siderophore receptor  24.07 
 
 		 718 aa  58.2  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  30.27 
 
 		 750 aa  58.2  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 715 aa  57.8  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2591  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 		 797 aa  57.8  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  22.22 
 
 		 715 aa  57.8  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0666  TonB-dependent receptor, plug  22.73 
 
 		 615 aa  57.4  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  23.74 
 
 		 757 aa  57  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  23.12 
 
 		 736 aa  57  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2077  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 742 aa  57.4  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  26.51 
 
 		 665 aa  56.2  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 802 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 		 708 aa  56.6  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  26.51 
 
 		 665 aa  56.2  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  26.51 
 
 		 665 aa  56.2  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4082  TonB-dependent siderophore receptor  23.33 
 
 		 819 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.671478  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  24.03 
 
 		 701 aa  56.2  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 774 aa  56.6  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2342  TonB-dependent siderophore receptor  24.81 
 
 		 693 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000105633  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>