More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02478 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  100 
 
 		 153 aa  308  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  62.34 
 
 		 178 aa  208  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  55.92 
 
 		 178 aa  173  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  52.94 
 
 		 152 aa  164  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  50 
 
 		 175 aa  162  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  52.29 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  47.37 
 
 		 184 aa  145  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  45.7 
 
 		 177 aa  140  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  44.37 
 
 		 177 aa  137  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  44.08 
 
 		 193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  44 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  41.72 
 
 		 185 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  42.67 
 
 		 185 aa  128  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  43.33 
 
 		 187 aa  124  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  40 
 
 		 196 aa  120  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  41.45 
 
 		 192 aa  120  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  40 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  41.33 
 
 		 221 aa  117  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  40.67 
 
 		 196 aa  116  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  40 
 
 		 195 aa  115  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  40 
 
 		 196 aa  115  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  37.33 
 
 		 200 aa  114  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  40.4 
 
 		 196 aa  114  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  40.91 
 
 		 216 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  40.13 
 
 		 192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  39.47 
 
 		 192 aa  111  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  39.47 
 
 		 192 aa  111  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  36.84 
 
 		 238 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  37.33 
 
 		 213 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  35.53 
 
 		 219 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  35.33 
 
 		 235 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  38.67 
 
 		 189 aa  110  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  35.33 
 
 		 235 aa  110  9e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  37.5 
 
 		 195 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  36 
 
 		 234 aa  107  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  37.75 
 
 		 220 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  35.95 
 
 		 208 aa  107  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  35.95 
 
 		 192 aa  103  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  36.67 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  36.67 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  36 
 
 		 191 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  39.87 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  39.22 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  37.33 
 
 		 247 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  37.93 
 
 		 264 aa  93.6  9e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  34.93 
 
 		 193 aa  93.2  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  32.08 
 
 		 205 aa  92.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  42.31 
 
 		 455 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  42.31 
 
 		 455 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  42.31 
 
 		 439 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  37.41 
 
 		 270 aa  86.7  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  40.37 
 
 		 419 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3223  polysaccharide export protein  37.3 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0801201  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  32.64 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  33.92 
 
 		 214 aa  81.3  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1536  polysaccharide export protein  27.22 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595422  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2734  capsular polysaccharide export protein, putative  37.29 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3405  hypothetical protein  38.66 
 
 		 410 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3695  polysaccharide export protein  41.75 
 
 		 441 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.597234  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1974  polysaccharide export protein  38.95 
 
 		 411 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.154701 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  30.77 
 
 		 193 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2548  Outer membrane polysaccharide export protein, exoF  40 
 
 		 410 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1207  polysaccharide export protein  40 
 
 		 410 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150349 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2367  polysaccharide export protein EpsE  38.18 
 
 		 262 aa  72  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  36.59 
 
 		 277 aa  71.2  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  31.33 
 
 		 473 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  35.85 
 
 		 415 aa  70.9  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  29.14 
 
 		 212 aa  71.2  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1985  polysaccharide export protein  28.31 
 
 		 208 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560938  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2488  polysaccharide export protein  30.82 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.486389  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5877  polysaccharide export protein  30.08 
 
 		 425 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694613  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2392  polysaccharide export protein  28.14 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  30.72 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4021  polysaccharide export protein  34.58 
 
 		 451 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  28.86 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  26.04 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  34.86 
 
 		 816 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  30.99 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 417 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  28.57 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  30.99 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3185  polysaccharide export protein  33.64 
 
 		 451 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  31.78 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  34.91 
 
 		 415 aa  67.8  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  28.91 
 
 		 324 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  31.2 
 
 		 427 aa  67.8  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  34.91 
 
 		 415 aa  67.8  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0834  polysaccharide export protein  30.13 
 
 		 309 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  34.97 
 
 		 478 aa  67.8  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3561  polysaccharide export protein  34.43 
 
 		 441 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  34.11 
 
 		 270 aa  67  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  33.85 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  30.28 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  33.33 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  34.44 
 
 		 495 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  30.71 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  26.63 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4611  polysaccharide export protein  28.69 
 
 		 429 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1660  polysaccharide export protein  29.17 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.614311  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  40.62 
 
 		 422 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>