More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02445 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01682  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  63.65 
 
 		 795 aa  1023    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0961927  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1929  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  63.65 
 
 		 795 aa  1023    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000518334  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2149  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  64.28 
 
 		 795 aa  1057    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.625217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1972  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  54.83 
 
 		 793 aa  867    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.025038 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2470  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  55.14 
 
 		 793 aa  864    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1793  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  63.65 
 
 		 795 aa  1023    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000955232  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2469  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  60.38 
 
 		 795 aa  988    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0698  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  50.5 
 
 		 791 aa  800    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155841  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2007  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  61.64 
 
 		 795 aa  997    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.693647 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1956  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  65.16 
 
 		 795 aa  1063    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2995  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  60.97 
 
 		 807 aa  1025    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0870176  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1908  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  62.01 
 
 		 795 aa  1029    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00255913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1717  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  62.89 
 
 		 795 aa  1048    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00142202  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2086  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  61.76 
 
 		 795 aa  1028    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2383  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  54.77 
 
 		 792 aa  859    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295144  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1955  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  63.65 
 
 		 795 aa  1020    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.111711  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01671  hypothetical protein  63.65 
 
 		 795 aa  1023    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0686641  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2765  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  45.31 
 
 		 793 aa  713    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2638  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  45.18 
 
 		 793 aa  711    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2167  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  54.65 
 
 		 792 aa  854    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1995  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  44.24 
 
 		 801 aa  649    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.263135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2672  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  45.93 
 
 		 794 aa  672    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1449  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  61.76 
 
 		 795 aa  998    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1473  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  48.05 
 
 		 792 aa  758    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000187632  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003705  phenylalanyl-tRNA synthetase beta chain  60.8 
 
 		 801 aa  987    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.374236  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1145  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  49.38 
 
 		 793 aa  785    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.158362  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1936  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  54.27 
 
 		 792 aa  849    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0927196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2048  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  63.4 
 
 		 795 aa  1037    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424555  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1477  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  63.52 
 
 		 795 aa  1020    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.020093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1433  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  61.89 
 
 		 795 aa  999    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.030197 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3020  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  48.62 
 
 		 796 aa  717    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2215  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  62.64 
 
 		 795 aa  1036    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.188862 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1932  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  63.77 
 
 		 795 aa  1024    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047761  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1662  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  46.48 
 
 		 793 aa  747    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2315  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  44.98 
 
 		 803 aa  657    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000507205  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0492  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  45.69 
 
 		 792 aa  689    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.229173  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1901  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  61.89 
 
 		 795 aa  1029    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00294003  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02093  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  60.05 
 
 		 806 aa  980    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1315  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  44.97 
 
 		 799 aa  659    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1829  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  62.01 
 
 		 795 aa  1014    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000186413  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2620  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  63.02 
 
 		 795 aa  1050    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00723547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3220  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  55.01 
 
 		 793 aa  863    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2418  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  61.89 
 
 		 795 aa  1029    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000318266  hitchhiker  0.0000890505 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1582  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  52.67 
 
 		 816 aa  822    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3476  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  54.76 
 
 		 793 aa  855    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698698 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1998  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  45.21 
 
 		 784 aa  652    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.109142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1603  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  61.01 
 
 		 795 aa  1012    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.643795  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1981  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  53.64 
 
 		 792 aa  845    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134276  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1804  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  52.08 
 
 		 793 aa  806    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0844  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  59.37 
 
 		 795 aa  978    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714216  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2298  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  44.49 
 
 		 801 aa  650    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.184232  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0917  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  47.18 
 
 		 786 aa  699    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0467  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  45.74 
 
 		 794 aa  725    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.137562  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2509  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  53.02 
 
 		 792 aa  817    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02445  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  100 
 
 		 795 aa  1616    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.202536  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1893  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  65.03 
 
 		 795 aa  1056    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2494  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  66.79 
 
 		 795 aa  1078    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0476201  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2592  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  53.84 
 
 		 794 aa  854    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0126631 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1918  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  63.65 
 
 		 795 aa  1023    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.333448  normal  0.421493 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2067  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  62.14 
 
 		 795 aa  1035    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0861  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  56.48 
 
 		 795 aa  895    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0924508  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1825  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  63.02 
 
 		 795 aa  1048    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.713489  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1809  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  62.01 
 
 		 795 aa  1032    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2168  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  62.14 
 
 		 795 aa  1033    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0570245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0763  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  52.13 
 
 		 797 aa  818    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1709  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  61.26 
 
 		 795 aa  1023    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2431  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  63.77 
 
 		 795 aa  1024    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1874  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  62.26 
 
 		 795 aa  1034    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000755096  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1732  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  59.37 
 
 		 795 aa  988    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00878056  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28710  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  53.02 
 
 		 792 aa  816    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.458463  decreased coverage  0.000000000220958 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1455  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  50.13 
 
 		 789 aa  785    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105434  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1410  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  48.05 
 
 		 792 aa  758    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0168176  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1729  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  63.4 
 
 		 795 aa  1000    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1835  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  61.89 
 
 		 795 aa  999    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000347523  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20470  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  54.27 
 
 		 792 aa  853    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2185  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  64.65 
 
 		 795 aa  1049    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.861692  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2597  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  63.02 
 
 		 795 aa  1044    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0200655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2800  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  44.6 
 
 		 802 aa  674    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1864  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  61.76 
 
 		 795 aa  1027    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1466  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  61.89 
 
 		 795 aa  999    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0432  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.73 
 
 		 792 aa  757    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2056  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  53.46 
 
 		 790 aa  857    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1952  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  62.39 
 
 		 795 aa  1027    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1404  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  59.37 
 
 		 795 aa  974    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1012  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  43.2 
 
 		 781 aa  634  1e-180  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0141167 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01388  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.75 
 
 		 792 aa  629  1e-179  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.547763  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1972  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.63 
 
 		 809 aa  622  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1642  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.51 
 
 		 809 aa  618  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.39134 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2395  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.22 
 
 		 814 aa  615  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.990048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1280  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.05 
 
 		 815 aa  615  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.477194  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1453  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.22 
 
 		 814 aa  615  9.999999999999999e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1582  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.38 
 
 		 809 aa  609  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2590  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.35 
 
 		 810 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1875  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  40.83 
 
 		 813 aa  605  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2107  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  40.96 
 
 		 808 aa  605  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.123782  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1376  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.3 
 
 		 811 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1553  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  40.98 
 
 		 810 aa  601  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2094  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  40.68 
 
 		 792 aa  602  1e-170  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2854  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.46 
 
 		 812 aa  599  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.440462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2849  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  40.59 
 
 		 808 aa  600  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0102687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>