30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02432 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02432  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  805    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2542  hypothetical protein  34.26 
 
 		 395 aa  243  5e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1434  domain of unknown function DUF1745  41.64 
 
 		 402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318192  normal  0.236861 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1892  hypothetical protein  38.51 
 
 		 382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.056146  normal  0.181862 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003465  hypothetical protein  32.12 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1054  hypothetical protein  35.29 
 
 		 405 aa  197  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02305  hypothetical protein  36.62 
 
 		 395 aa  194  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1561  hypothetical protein  32.84 
 
 		 394 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0408772  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05570  hypothetical protein  28.9 
 
 		 387 aa  112  9e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  25.36 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  24.9 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  22.58 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  23.72 
 
 		 933 aa  59.7  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  25 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  22.75 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  25.31 
 
 		 365 aa  56.2  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0696  transcriptional regulator, TrmB  24.64 
 
 		 512 aa  55.8  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  23.66 
 
 		 416 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2052  domain of unknown function DUF1745  25.35 
 
 		 379 aa  53.5  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0128  hypothetical protein  24.23 
 
 		 379 aa  51.2  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.193314  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  22.98 
 
 		 427 aa  50.4  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  20.73 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  22.93 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  22.69 
 
 		 381 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  21.29 
 
 		 395 aa  47.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  25 
 
 		 396 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2479  hypothetical protein  23.77 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  24.56 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  21.22 
 
 		 400 aa  43.5  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3242  domain of unknown function DUF1745  22.12 
 
 		 371 aa  43.5  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0186777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>