More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02385 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  53.04 
 
 		 663 aa  702    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  100 
 
 		 652 aa  1357    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  48.12 
 
 		 669 aa  573  1.0000000000000001e-162  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  43.86 
 
 		 673 aa  461  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  40.06 
 
 		 634 aa  440  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  42.99 
 
 		 542 aa  427  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  38.65 
 
 		 677 aa  406  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  40.64 
 
 		 573 aa  382  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  40.63 
 
 		 604 aa  374  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  34.42 
 
 		 1406 aa  301  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  33.68 
 
 		 1764 aa  293  8e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  29.35 
 
 		 725 aa  279  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  31.08 
 
 		 695 aa  277  4e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  35.74 
 
 		 700 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 		 697 aa  272  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  36.03 
 
 		 530 aa  266  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  29.68 
 
 		 648 aa  249  8e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  31.57 
 
 		 546 aa  246  8e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.91 
 
 		 530 aa  243  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  32.29 
 
 		 656 aa  240  5e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  30.86 
 
 		 524 aa  233  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  31.54 
 
 		 531 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  29.65 
 
 		 532 aa  219  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  34.8 
 
 		 542 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  31.17 
 
 		 717 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  27.66 
 
 		 527 aa  209  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  27.74 
 
 		 762 aa  207  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  27.74 
 
 		 762 aa  207  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  29.87 
 
 		 637 aa  206  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  30.42 
 
 		 720 aa  203  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  27.15 
 
 		 536 aa  203  9e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  31.88 
 
 		 533 aa  202  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  36.08 
 
 		 525 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  31.92 
 
 		 889 aa  202  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  26.02 
 
 		 899 aa  199  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  28.12 
 
 		 578 aa  194  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  33.23 
 
 		 322 aa  188  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 685 aa  172  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0167  sulfotransferase  30.63 
 
 		 488 aa  172  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 713 aa  167  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  32.81 
 
 		 742 aa  152  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  26.28 
 
 		 529 aa  150  7e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  29.53 
 
 		 549 aa  148  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  25.9 
 
 		 548 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  25.7 
 
 		 519 aa  145  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3336  sulfotransferase  30.6 
 
 		 670 aa  144  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.850036 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1699  hypothetical protein  30.03 
 
 		 307 aa  142  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.860301  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  25.93 
 
 		 514 aa  140  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  26.5 
 
 		 624 aa  139  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  26.44 
 
 		 636 aa  136  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  23.22 
 
 		 614 aa  133  9e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  27.86 
 
 		 482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  25.36 
 
 		 594 aa  130  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  25.46 
 
 		 502 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  31.89 
 
 		 538 aa  121  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  25.31 
 
 		 484 aa  121  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 494 aa  121  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  25.22 
 
 		 625 aa  120  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0258  sulfotransferase  26.22 
 
 		 626 aa  102  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3552  TPR repeat-containing protein  22.45 
 
 		 510 aa  100  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00157607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1421  tetratricopeptide TPR_2  24.09 
 
 		 471 aa  97.1  9e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0844206  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.96 
 
 		 764 aa  90.1  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  23.27 
 
 		 887 aa  84.3  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 		 505 aa  84.3  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 		 909 aa  84.3  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  30 
 
 		 622 aa  84.3  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  21.81 
 
 		 681 aa  83.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.66 
 
 		 878 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.12 
 
 		 466 aa  82.4  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.29 
 
 		 810 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0784  TPR repeat-containing protein  28.63 
 
 		 709 aa  82  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  24.73 
 
 		 733 aa  81.6  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  21.88 
 
 		 466 aa  80.9  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.44 
 
 		 730 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  23.03 
 
 		 435 aa  79.7  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 		 3145 aa  79  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 486 aa  79  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9233  hypothetical protein  27.68 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  22.92 
 
 		 676 aa  77.8  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.5 
 
 		 725 aa  77.4  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2065  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.85 
 
 		 465 aa  76.6  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145613  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 681 aa  75.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1897  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 		 598 aa  75.1  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00502769  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  24.73 
 
 		 865 aa  73.9  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  20.42 
 
 		 465 aa  71.6  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 		 468 aa  71.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  24.65 
 
 		 1694 aa  71.6  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  23.88 
 
 		 816 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  36.79 
 
 		 587 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 1276 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  20.72 
 
 		 1486 aa  69.7  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 637 aa  68.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1208  hypothetical protein  27.4 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 4489 aa  68.9  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 		 632 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  33.1 
 
 		 545 aa  68.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  27.68 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0799  sulfotransferase  24.01 
 
 		 341 aa  66.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0670086  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  31.9 
 
 		 560 aa  65.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 		 718 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>