86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02327 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02327  Pyridoxamine 5-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  100 
 
 		 189 aa  398  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.437223  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1590  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  43.88 
 
 		 197 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.012527 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1669  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  39.18 
 
 		 194 aa  149  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.297352 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2192  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  39.38 
 
 		 193 aa  140  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2144  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  39.38 
 
 		 193 aa  140  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0774  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  38.3 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0070  hypothetical protein  36.76 
 
 		 186 aa  131  6.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1458  hypothetical protein  35.11 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3018  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  35.57 
 
 		 201 aa  125  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.855594  hitchhiker  0.0018196 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4053  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  36 
 
 		 184 aa  114  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000260604  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1765  hypothetical protein  34.52 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0335869 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15591  hypothetical protein  36.69 
 
 		 183 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.63845  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15441  hypothetical protein  32.56 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.490668  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1456  hypothetical protein  34.5 
 
 		 183 aa  97.8  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15191  hypothetical protein  32.29 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41681  predicted protein  26.79 
 
 		 220 aa  87.8  8e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10301  hypothetical protein  29.17 
 
 		 180 aa  87  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.143046  hitchhiker  0.00037794 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0350  hypothetical protein  29.17 
 
 		 180 aa  86.3  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0960796  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47090  predicted protein  33.16 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0095  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28.98 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.905339 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43552  predicted protein  30.61 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0798  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.27 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4023  putative pyridoxamine-phosphate oxidase  33.33 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.323622  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1129  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  22.4 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1165  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  22.4 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1150  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  22.03 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.343525  normal  0.105039 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4286  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  21.86 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0262  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28.76 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0364941 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01800  hypothetical protein  27.12 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853891  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19500  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  22.95 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187849  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  20.73 
 
 		 215 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587779 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4331  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  20.21 
 
 		 215 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262405  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1229  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  21.02 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2478  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  31.82 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.12705  normal  0.1751 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4116  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  21.02 
 
 		 215 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.225541  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0514  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.41 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.439872  normal  0.298122 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1519  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.89 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000729179 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3221  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.55 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1436  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  21.31 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0717  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.55 
 
 		 265 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000096585  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3853  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  20.45 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0541085  normal  0.804089 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0107  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.27 
 
 		 214 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000023808  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0901  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.27 
 
 		 214 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.901665  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0594  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.75 
 
 		 206 aa  45.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2494  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.27 
 
 		 214 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00659427  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1061  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.27 
 
 		 214 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.040983  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0254  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  24.84 
 
 		 174 aa  45.1  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0904  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.27 
 
 		 214 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0158513  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0359  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.27 
 
 		 214 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0016328  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0659  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.27 
 
 		 214 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0194138  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1307  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  34.18 
 
 		 212 aa  45.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24050  pyridoxamine-phosphate oxidase  32.53 
 
 		 250 aa  44.7  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0741  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.41 
 
 		 213 aa  44.7  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1580  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  26.8 
 
 		 212 aa  44.7  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0367191  normal  0.0444647 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1018  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  23.3 
 
 		 214 aa  44.7  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.912565  decreased coverage  0.0000390202 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4775  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.21 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0634  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  31.65 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.119469 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2592  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.27 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.984906 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.27 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2568  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.27 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387899  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2463  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4018  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  24.85 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.264254 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1782  pyridoxamine-phosphate oxidase  26.56 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09410  pyrodoxamine 5'-phosphate oxidase  23.16 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2652  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  25 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.27 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495337 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0663  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  21.59 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0509  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.75 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.069325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1146  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.38 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0728  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.27 
 
 		 214 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1389  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.75 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2616  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.27 
 
 		 214 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1311  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.279184  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.73 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225533  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2487  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.27 
 
 		 214 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.262881 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1016  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.38 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0857  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.75 
 
 		 222 aa  42  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1088  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.89 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0116  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.18 
 
 		 224 aa  42  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0601  hypothetical protein  26.25 
 
 		 215 aa  41.6  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4756  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  25.69 
 
 		 210 aa  42  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.709041 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1205  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.75 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.692006 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0582  hypothetical protein  26.25 
 
 		 215 aa  41.6  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1512  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  24.68 
 
 		 209 aa  41.6  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000362889  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0443  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.73 
 
 		 218 aa  41.6  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.732477  normal  0.141335 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4813  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.91 
 
 		 214 aa  41.2  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134817  normal  0.171584 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>