More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02310 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02310  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
279 aa  574  1.0000000000000001e-163  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000371048  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  78.14 
 
 
469 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  67.74 
 
 
471 aa  411  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  67.74 
 
 
471 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  67.74 
 
 
471 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  67.74 
 
 
471 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  67.74 
 
 
471 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  67.51 
 
 
471 aa  407  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  67.38 
 
 
471 aa  408  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000352174  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  67.74 
 
 
471 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3417  glutamyl-tRNA synthetase  67.87 
 
 
469 aa  407  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634908  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  67.74 
 
 
471 aa  409  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  67.38 
 
 
471 aa  409  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  67.51 
 
 
471 aa  404  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  67.51 
 
 
471 aa  404  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2673  glutamyl-tRNA synthetase  67.63 
 
 
471 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1191  glutamyl-tRNA synthetase  67.51 
 
 
471 aa  402  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  67.15 
 
 
471 aa  404  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2649  glutamyl-tRNA synthetase  67.63 
 
 
471 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000633167  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1365  glutamyl-tRNA synthetase  68.82 
 
 
469 aa  400  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000124879  normal  0.0325353 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1430  glutamyl-tRNA synthetase  68.82 
 
 
469 aa  401  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2558  glutamyl-tRNA synthetase  67.63 
 
 
471 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000165684  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2607  glutamyl-tRNA synthetase  67.63 
 
 
471 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00191122  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1418  glutamyl-tRNA synthetase  68.82 
 
 
469 aa  401  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000145575  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3084  glutamyl-tRNA synthetase  67.87 
 
 
471 aa  404  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00745356  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  68.46 
 
 
469 aa  403  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000288711  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2779  glutamyl-tRNA synthetase  67.63 
 
 
471 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00021769  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2947  glutamyl-tRNA synthetase  68.1 
 
 
469 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000528448  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2822  glutamyl-tRNA synthetase  68.1 
 
 
469 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000059188  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2798  glutamyl-tRNA synthetase  66.43 
 
 
472 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0783891  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2906  glutamyl-tRNA synthetase  68.82 
 
 
469 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000836575  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1554  glutamyl-tRNA synthetase  68.1 
 
 
469 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000003282  normal  0.0351282 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2802  glutamyl-tRNA synthetase  67.74 
 
 
469 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000260001  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2931  glutamyl-tRNA synthetase  66.19 
 
 
471 aa  394  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000400457  normal  0.117314 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2499  glutamyl-tRNA synthetase  67.74 
 
 
469 aa  397  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000172182  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1728  glutamyl-tRNA synthetase  67.38 
 
 
469 aa  391  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000433955  normal  0.283148 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2714  glutamyl-tRNA synthetase  67.03 
 
 
469 aa  392  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  67.39 
 
 
470 aa  394  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1449  glutamyl-tRNA synthetase  66.31 
 
 
469 aa  389  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000565413  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3216  glutamyl-tRNA synthetase  65.58 
 
 
470 aa  388  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2533  glutamyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 
473 aa  389  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000038789  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1456  glutamyl-tRNA synthetase  66.31 
 
 
469 aa  387  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2350  glutamyl-tRNA synthetase  63.9 
 
 
474 aa  379  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  62.82 
 
 
509 aa  375  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  64.39 
 
 
475 aa  372  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  64.03 
 
 
475 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  61.17 
 
 
480 aa  365  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  53.76 
 
 
470 aa  328  5.0000000000000004e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  54.35 
 
 
470 aa  328  7e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  56.52 
 
 
470 aa  327  9e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 
470 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  52.75 
 
 
473 aa  314  9.999999999999999e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  52.75 
 
 
469 aa  314  9.999999999999999e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  52.52 
 
 
468 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0456  glutamyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 
466 aa  313  1.9999999999999998e-84  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  54.58 
 
 
471 aa  309  4e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  52.55 
 
 
468 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  50.18 
 
 
469 aa  296  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
472 aa  276  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1209  glutamyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
467 aa  267  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0142351 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 
465 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2028  glutamyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 
467 aa  265  7e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04820  glutamyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 
467 aa  263  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 
465 aa  261  6e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1321  glutamyl-tRNA synthetase  50.57 
 
 
464 aa  260  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246268  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 
472 aa  258  9e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1950  glutamyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
467 aa  257  2e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 
466 aa  254  8e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 
466 aa  254  8e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 
467 aa  253  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 
466 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 
472 aa  252  5.000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
468 aa  252  5.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 
467 aa  250  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  48.74 
 
 
467 aa  250  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  44.32 
 
 
466 aa  249  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 
512 aa  246  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2075  glutamyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 
469 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467012  normal  0.81702 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2056  glutamyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 
469 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000244557  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1376  glutamyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
469 aa  241  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00012912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3210  glutamyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
469 aa  241  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000343347  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1600  glutamyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
469 aa  241  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000105625  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2487  glutamyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 
504 aa  242  6e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000251622  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6021  glutamyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 
469 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.00000000513528  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2103  glutamyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
469 aa  241  6e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014771  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1958  glutamyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 
469 aa  241  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846631  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2628  glutamyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
504 aa  241  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000191371  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2541  glutamyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
504 aa  241  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20953  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2088  glutamyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 
469 aa  241  9e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000151116  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1377  glutamyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
469 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000079335  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
469 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2140  glutamyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 
465 aa  238  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000804672  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2123  glutamyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 
468 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000117381  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1220  glutamyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
469 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000664891  normal  0.415477 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1179  glutamyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 
500 aa  236  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000996044  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
467 aa  236  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
467 aa  235  7e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2495  glutamyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 
469 aa  235  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000536822  hitchhiker  0.00468963 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1114  glutamyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 
465 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00321012  normal  0.762365 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
464 aa  232  6e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>