More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02238 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02238  acetate/propionate kinase  100 
 
 		 393 aa  803    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2590  acetate kinase  56.78 
 
 		 398 aa  462  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.871913  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  56.52 
 
 		 400 aa  463  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3539  acetate kinase  57.14 
 
 		 398 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  57.22 
 
 		 398 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  55.24 
 
 		 399 aa  455  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2674  acetate kinase  56.01 
 
 		 399 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  56.01 
 
 		 399 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000276936  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  56.01 
 
 		 399 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1705  acetate kinase  56.2 
 
 		 399 aa  454  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458561  hitchhiker  0.00694718 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2772  acetate kinase  56.01 
 
 		 399 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.170016  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  55.24 
 
 		 399 aa  455  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  55.24 
 
 		 399 aa  455  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2886  acetate kinase  57.4 
 
 		 398 aa  456  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530496  decreased coverage  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2409  acetate kinase  56.49 
 
 		 413 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  54.99 
 
 		 399 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  57.33 
 
 		 399 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1669  acetate kinase  57.25 
 
 		 398 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0184295  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2476  acetate kinase  56.52 
 
 		 400 aa  442  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0616  acetate kinase  53.65 
 
 		 398 aa  418  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.781931  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02942  acetate kinase  52.51 
 
 		 398 aa  411  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3176  acetate kinase  51.66 
 
 		 412 aa  407  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2112  acetate kinase  52.41 
 
 		 398 aa  408  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0121493  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002968  acetate kinase  52.14 
 
 		 398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3311  acetate kinase  51.39 
 
 		 404 aa  404  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2523  acetate kinase  50.63 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.340235 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2686  acetate kinase  50.63 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.888015 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2566  acetate kinase  50.63 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2478  acetate kinase  50.63 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.679526  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2578  acetate kinase  50.63 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2760  acetate kinase  53.03 
 
 		 402 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.819841  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02221  acetate kinase  51.13 
 
 		 400 aa  398  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.177023  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1360  acetate kinase  51.13 
 
 		 400 aa  398  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3436  acetate kinase  51.13 
 
 		 400 aa  398  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.1925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2590  acetate kinase  51.13 
 
 		 400 aa  398  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0300293  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02181  hypothetical protein  51.13 
 
 		 400 aa  398  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154164  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2840  acetate kinase  50.25 
 
 		 400 aa  396  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1356  acetate kinase  51.13 
 
 		 400 aa  398  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.446941  normal  0.180313 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2672  acetate kinase  51.13 
 
 		 400 aa  398  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.733134  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2446  acetate kinase  51.13 
 
 		 400 aa  398  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0138092  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2452  acetate kinase  51.13 
 
 		 400 aa  398  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.691119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1385  acetate kinase  50.76 
 
 		 400 aa  393  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00164511  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0803  acetate kinase  50.38 
 
 		 398 aa  393  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102321  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3316  acetate kinase  49.62 
 
 		 400 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00011444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1551  acetate kinase  49.12 
 
 		 400 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.099889  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001527  acetate kinase  49.36 
 
 		 397 aa  390  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1443  acetate kinase  48.87 
 
 		 400 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53470  acetate kinase  50.65 
 
 		 394 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00330068  hitchhiker  0.00786734 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1825  acetate kinase  48.87 
 
 		 400 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0994  acetate kinase  50.13 
 
 		 397 aa  383  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  9.48202e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2559  acetate kinase  49.75 
 
 		 400 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.139439  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1484  acetate kinase  50 
 
 		 400 aa  383  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.209908  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4684  acetate kinase  50.39 
 
 		 394 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34560  acetate kinase  50.13 
 
 		 395 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.576649  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2780  acetate kinase  50 
 
 		 400 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0653743  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1133  acetate kinase  49.12 
 
 		 401 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3099  acetate kinase  47.16 
 
 		 398 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.492017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  46.95 
 
 		 403 aa  365  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  46.84 
 
 		 403 aa  365  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0923  acetate kinase  48.33 
 
 		 421 aa  366  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3088  acetate kinase  47.06 
 
 		 425 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273293  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2998  acetate kinase  49.74 
 
 		 405 aa  363  2e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2897  acetate kinase  46.8 
 
 		 415 aa  362  6e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0217  acetate kinase  49.36 
 
 		 410 aa  362  9e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2983  acetate kinase  46.8 
 
 		 425 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.37833  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28510  acetate kinase  45.38 
 
 		 409 aa  361  1e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0382  acetate kinase  46.21 
 
 		 400 aa  357  2.9999999999999997e-97  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.627309  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  45.8 
 
 		 398 aa  355  5e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2309  acetate kinase  45.48 
 
 		 396 aa  356  5e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3644  acetate kinase  49.09 
 
 		 394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0052  acetate kinase  47.94 
 
 		 395 aa  353  2.9999999999999997e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0197  acetate kinase  48.97 
 
 		 410 aa  352  8.999999999999999e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246535 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2953  acetate kinase  45.91 
 
 		 402 aa  349  5e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.845819  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41120  acetate kinase  49.22 
 
 		 399 aa  348  8e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0461537  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0346  acetate kinase  46.39 
 
 		 400 aa  346  3e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00657885  hitchhiker  0.00000356853 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  42.64 
 
 		 398 aa  345  7e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3910  acetate kinase  44.07 
 
 		 411 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  44.44 
 
 		 404 aa  343  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  45.52 
 
 		 398 aa  342  7e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  45.06 
 
 		 398 aa  342  8e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1729  acetate kinase  43.73 
 
 		 404 aa  341  1e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.247984  normal  0.031096 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  44.81 
 
 		 397 aa  340  2e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  43.91 
 
 		 406 aa  340  2e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  42.24 
 
 		 401 aa  340  2e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3562  propionate/acetate kinase  47.04 
 
 		 402 aa  339  4e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  43.15 
 
 		 405 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4098  propionate/acetate kinase  44.25 
 
 		 403 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  43.32 
 
 		 396 aa  336  5e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1379  acetate kinase  47.06 
 
 		 408 aa  336  5e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  44.72 
 
 		 402 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  43.58 
 
 		 397 aa  335  9e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  43.54 
 
 		 406 aa  334  1e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  45.8 
 
 		 408 aa  333  2e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0557  acetate kinase  42.49 
 
 		 420 aa  333  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  42.57 
 
 		 400 aa  333  4e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3589  propionate/acetate kinase  45.13 
 
 		 402 aa  333  4e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.916752  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  42.57 
 
 		 400 aa  333  4e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0583  propionate/acetate kinase  45.52 
 
 		 402 aa  333  5e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0642  acetate kinase  47.18 
 
 		 449 aa  332  5e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02982  propionate kinase/acetate kinase C, anaerobic  44.5 
 
 		 406 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>