More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02137 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02137  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 100 aa  202  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00401129  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  73.86 
 
 		 293 aa  140  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1848  dihydrodipicolinate synthase  62.77 
 
 		 294 aa  120  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  65.91 
 
 		 293 aa  120  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  65.91 
 
 		 299 aa  119  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  65.91 
 
 		 299 aa  119  9e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1879  dihydrodipicolinate synthase  59.6 
 
 		 294 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1702  dihydrodipicolinate synthase  60.61 
 
 		 294 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000467042  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1864  dihydrodipicolinate synthase  64.21 
 
 		 294 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000003415  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2340  dihydrodipicolinate synthase  58.59 
 
 		 294 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00299163  hitchhiker  0.000000559319 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2412  dihydrodipicolinate synthase  58.59 
 
 		 294 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0470285  hitchhiker  0.00564144 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1656  dihydrodipicolinate synthase  62.5 
 
 		 294 aa  118  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00451745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  65.91 
 
 		 293 aa  117  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1980  dihydrodipicolinate synthase  63.83 
 
 		 294 aa  117  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1691  dihydrodipicolinate synthase  63.64 
 
 		 292 aa  117  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.719895  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  59.78 
 
 		 292 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2590  dihydrodipicolinate synthase  56.57 
 
 		 294 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000266276  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1792  dihydrodipicolinate synthase  56.57 
 
 		 294 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000368333  hitchhiker  0.00000000144356 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2667  dihydrodipicolinate synthase  56.57 
 
 		 294 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000190321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2177  dihydrodipicolinate synthase  63.64 
 
 		 294 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000474227  normal  0.485402 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2552  dihydrodipicolinate synthase  56.57 
 
 		 294 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000411762  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0678  dihydrodipicolinate synthase  64.37 
 
 		 300 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2430  dihydrodipicolinate synthase  62.5 
 
 		 294 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104748  hitchhiker  0.0000338239 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1908  dihydrodipicolinate synthase  64.77 
 
 		 293 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  62.79 
 
 		 297 aa  114  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  59.78 
 
 		 292 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  59.57 
 
 		 292 aa  114  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  62.79 
 
 		 292 aa  113  6.9999999999999995e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  61.05 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  61.05 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  59.34 
 
 		 291 aa  113  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  60.87 
 
 		 292 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  67.05 
 
 		 292 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.484069 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  65.91 
 
 		 292 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  64.77 
 
 		 292 aa  111  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  64.77 
 
 		 292 aa  111  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  64.77 
 
 		 292 aa  111  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  64.77 
 
 		 292 aa  111  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  61.05 
 
 		 295 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  64.77 
 
 		 292 aa  111  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  64.77 
 
 		 292 aa  111  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  64.77 
 
 		 292 aa  111  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  64.77 
 
 		 292 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  64.77 
 
 		 292 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  64.77 
 
 		 292 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  64.77 
 
 		 292 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  64.77 
 
 		 292 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  64.77 
 
 		 292 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  64.77 
 
 		 292 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  65.91 
 
 		 292 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  59.09 
 
 		 292 aa  110  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1738  dihydrodipicolinate synthase  58.95 
 
 		 292 aa  110  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  61.18 
 
 		 292 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  58.51 
 
 		 294 aa  110  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  61.36 
 
 		 290 aa  110  8.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  57.95 
 
 		 293 aa  108  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  62.5 
 
 		 292 aa  107  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  62.5 
 
 		 292 aa  107  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  59.09 
 
 		 292 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  59.09 
 
 		 292 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  57.95 
 
 		 291 aa  107  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2379  dihydrodipicolinate synthase  58.14 
 
 		 293 aa  107  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  56.52 
 
 		 291 aa  106  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  57.95 
 
 		 292 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1860  dihydrodipicolinate synthase  57.95 
 
 		 293 aa  105  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151494  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  59.09 
 
 		 291 aa  105  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  55.1 
 
 		 300 aa  105  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  52.13 
 
 		 292 aa  104  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  57.65 
 
 		 296 aa  104  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0843  dihydrodipicolinate synthase  55.68 
 
 		 290 aa  104  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0686751  normal  0.56042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0987  dihydrodipicolinate synthase  55.68 
 
 		 290 aa  104  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.193638  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0158  dihydrodipicolinate synthase  55.17 
 
 		 301 aa  104  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0298297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0148  dihydrodipicolinate synthase  55.17 
 
 		 301 aa  103  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000206082  hitchhiker  0.0000319288 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2358  dihydrodipicolinate synthase  57.95 
 
 		 291 aa  103  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592923  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1992  dihydrodipicolinate synthase  57.95 
 
 		 291 aa  103  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.122144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1735  dihydrodipicolinate synthase  55.32 
 
 		 293 aa  103  9e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00310784  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1540  dihydrodipicolinate synthase  57.47 
 
 		 300 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.336283  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  56.82 
 
 		 292 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  54.55 
 
 		 290 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  54.95 
 
 		 302 aa  102  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0492  dihydrodipicolinate synthase  54.65 
 
 		 298 aa  102  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  53.68 
 
 		 302 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  57.95 
 
 		 292 aa  101  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  53.12 
 
 		 290 aa  101  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  56.98 
 
 		 287 aa  100  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  54.02 
 
 		 298 aa  100  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2961  dihydrodipicolinate synthase  52.69 
 
 		 296 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  53.41 
 
 		 294 aa  99.8  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  53.49 
 
 		 296 aa  98.6  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  51.72 
 
 		 297 aa  99  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  54.02 
 
 		 298 aa  99.4  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  55.68 
 
 		 290 aa  98.6  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  55.17 
 
 		 319 aa  98.6  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  58.54 
 
 		 286 aa  98.2  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  51.72 
 
 		 298 aa  97.8  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  51.72 
 
 		 298 aa  97.8  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  51.72 
 
 		 294 aa  97.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  48.96 
 
 		 290 aa  97.4  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  51.61 
 
 		 296 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  55.81 
 
 		 291 aa  97.1  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>