More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02136 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02136  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 192 aa  398  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00730006  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2478  dihydrodipicolinate synthase  69.11 
 
 		 293 aa  291  5e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376432  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1860  dihydrodipicolinate synthase  51.83 
 
 		 293 aa  206  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.151494  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 292 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0492  dihydrodipicolinate synthase  49.47 
 
 		 298 aa  197  7e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  47.89 
 
 		 292 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  47.89 
 
 		 292 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  47.89 
 
 		 292 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  47.89 
 
 		 292 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1198  dihydrodipicolinate synthase  47.89 
 
 		 292 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  47.89 
 
 		 292 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  47.89 
 
 		 292 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  47.89 
 
 		 292 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  47.89 
 
 		 292 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  48.95 
 
 		 292 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  48.42 
 
 		 292 aa  194  7e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  47.89 
 
 		 292 aa  193  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  50.54 
 
 		 297 aa  192  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  50.3 
 
 		 292 aa  190  9e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.484069 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 292 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1879  dihydrodipicolinate synthase  51.41 
 
 		 294 aa  189  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1792  dihydrodipicolinate synthase  50.85 
 
 		 294 aa  190  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000368333  hitchhiker  0.00000000144356 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2552  dihydrodipicolinate synthase  50.85 
 
 		 294 aa  190  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000411762  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 292 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 292 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 292 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2590  dihydrodipicolinate synthase  50.85 
 
 		 294 aa  190  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000266276  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2667  dihydrodipicolinate synthase  50.85 
 
 		 294 aa  190  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000190321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1738  dihydrodipicolinate synthase  51.96 
 
 		 292 aa  189  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 292 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2412  dihydrodipicolinate synthase  51.41 
 
 		 294 aa  187  7e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0470285  hitchhiker  0.00564144 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1980  dihydrodipicolinate synthase  49.72 
 
 		 294 aa  187  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2340  dihydrodipicolinate synthase  51.41 
 
 		 294 aa  187  9e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00299163  hitchhiker  0.000000559319 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1656  dihydrodipicolinate synthase  50.85 
 
 		 294 aa  186  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00451745  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  44.74 
 
 		 291 aa  185  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2430  dihydrodipicolinate synthase  50.85 
 
 		 294 aa  185  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104748  hitchhiker  0.0000338239 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1864  dihydrodipicolinate synthase  49.72 
 
 		 294 aa  185  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000003415  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1702  dihydrodipicolinate synthase  50.85 
 
 		 294 aa  185  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000467042  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  48.91 
 
 		 292 aa  185  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  46.84 
 
 		 295 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  46.84 
 
 		 295 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  47.12 
 
 		 293 aa  184  9e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  48.44 
 
 		 293 aa  183  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  47.12 
 
 		 293 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  48.44 
 
 		 299 aa  183  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  48.44 
 
 		 299 aa  183  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  45.79 
 
 		 292 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  52.66 
 
 		 293 aa  182  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1848  dihydrodipicolinate synthase  50.28 
 
 		 294 aa  182  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  48.52 
 
 		 286 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  46.32 
 
 		 295 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2379  dihydrodipicolinate synthase  45.79 
 
 		 293 aa  181  5.0000000000000004e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  44.74 
 
 		 292 aa  181  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  46.84 
 
 		 293 aa  181  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  47.85 
 
 		 292 aa  181  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2177  dihydrodipicolinate synthase  49.15 
 
 		 294 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000474227  normal  0.485402 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  46.32 
 
 		 292 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  48.42 
 
 		 300 aa  179  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1735  dihydrodipicolinate synthase  47.46 
 
 		 293 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00310784  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  47.89 
 
 		 293 aa  177  7e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  52.07 
 
 		 301 aa  177  8e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0678  dihydrodipicolinate synthase  50.31 
 
 		 300 aa  177  9e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  47.37 
 
 		 300 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  47.37 
 
 		 300 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  47.37 
 
 		 300 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  47.37 
 
 		 300 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  45.08 
 
 		 294 aa  176  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  47.37 
 
 		 300 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  47.37 
 
 		 300 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  47.37 
 
 		 300 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1908  dihydrodipicolinate synthase  44.97 
 
 		 293 aa  176  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  51.48 
 
 		 300 aa  175  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  51.48 
 
 		 300 aa  175  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  51.48 
 
 		 300 aa  175  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  49.7 
 
 		 292 aa  174  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  44.74 
 
 		 291 aa  174  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  49.11 
 
 		 287 aa  174  9e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  51.48 
 
 		 301 aa  174  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0148  dihydrodipicolinate synthase  50.6 
 
 		 301 aa  173  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000206082  hitchhiker  0.0000319288 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  51.48 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  49.41 
 
 		 320 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  51.48 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 		 292 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  42.71 
 
 		 293 aa  171  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  46.07 
 
 		 294 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0158  dihydrodipicolinate synthase  45.79 
 
 		 301 aa  171  9e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0298297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2358  dihydrodipicolinate synthase  46.2 
 
 		 291 aa  170  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592923  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  46.07 
 
 		 294 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1992  dihydrodipicolinate synthase  46.2 
 
 		 291 aa  170  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.122144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  45.26 
 
 		 291 aa  169  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  45.79 
 
 		 302 aa  168  4e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  46.03 
 
 		 292 aa  168  6e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  44.5 
 
 		 294 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  49.4 
 
 		 292 aa  166  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 		 307 aa  166  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  44.15 
 
 		 296 aa  166  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  49.7 
 
 		 294 aa  166  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  43.98 
 
 		 292 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  43.46 
 
 		 292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  43.68 
 
 		 295 aa  165  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>