177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02121 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02121  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 		 58 aa  123  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000298663  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00911  phosphoserine aminotransferase  63.83 
 
 		 362 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.500761  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2736  phosphoserine aminotransferase  63.83 
 
 		 362 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00221847  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2689  phosphoserine aminotransferase  63.83 
 
 		 362 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00904863  normal  0.812894 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2469  phosphoserine aminotransferase  63.83 
 
 		 361 aa  72.4  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302224  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2214  phosphoserine aminotransferase  63.83 
 
 		 362 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.183325  normal  0.123491 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00918  hypothetical protein  63.83 
 
 		 362 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359811  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2421  phosphoserine aminotransferase  63.83 
 
 		 362 aa  72.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000598679  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1013  phosphoserine aminotransferase  63.83 
 
 		 362 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000154945  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1004  phosphoserine aminotransferase  63.83 
 
 		 362 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000735422  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1068  phosphoserine aminotransferase  63.83 
 
 		 362 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0934537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1427  phosphoserine aminotransferase  61.7 
 
 		 362 aa  71.2  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0453137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1115  phosphoserine aminotransferase  63.83 
 
 		 362 aa  71.2  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.27291 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0611  phosphoserine aminotransferase  75.61 
 
 		 358 aa  70.5  0.000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0982  phosphoserine aminotransferase  61.7 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0279153  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1090  phosphoserine aminotransferase  61.7 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.988584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1075  phosphoserine aminotransferase  61.7 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.25346 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1041  phosphoserine aminotransferase  61.7 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.147052  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1010  phosphoserine aminotransferase  61.7 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2041  phosphoserine aminotransferase  56.6 
 
 		 360 aa  68.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2342  phosphoserine aminotransferase  54.72 
 
 		 361 aa  68.6  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0172943  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02623  phosphoserine aminotransferase  57.69 
 
 		 367 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0728  phosphoserine aminotransferase  68.18 
 
 		 379 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000226259  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2240  phosphoserine aminotransferase  57.45 
 
 		 361 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0005461  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1732  phosphoserine aminotransferase  52.83 
 
 		 361 aa  67  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2000  phosphoserine aminotransferase  52.83 
 
 		 361 aa  67.4  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.572206  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003748  phosphoserine aminotransferase  65.91 
 
 		 364 aa  67  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000403909  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1706  phosphoserine aminotransferase  57.45 
 
 		 361 aa  67  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000174531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0252  phosphoserine aminotransferase  58.7 
 
 		 363 aa  67  0.00000000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1231  phosphoserine aminotransferase  57.45 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2069  phosphoserine aminotransferase  59.57 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311647  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2332  phosphoserine aminotransferase  69.05 
 
 		 361 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2307  phosphoserine aminotransferase  59.57 
 
 		 364 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0347378  hitchhiker  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2410  phosphoserine aminotransferase  58.33 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1369  phosphoserine aminotransferase  56.82 
 
 		 362 aa  65.5  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1687  phosphoserine aminotransferase  57.45 
 
 		 360 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1920  phosphoserine aminotransferase  59.57 
 
 		 363 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00965708  hitchhiker  0.00000000132125 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2058  phosphoserine aminotransferase  59.57 
 
 		 363 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00301752  unclonable  0.0000270653 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1952  phosphoserine aminotransferase  57.45 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000132565  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1973  phosphoserine aminotransferase  59.57 
 
 		 363 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000290161  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1732  phosphoserine aminotransferase  56.6 
 
 		 364 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.443235  hitchhiker  0.00319916 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2671  phosphoserine aminotransferase  57.45 
 
 		 361 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.146724  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2583  phosphoserine aminotransferase  57.45 
 
 		 361 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00074187  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1373  phosphoserine aminotransferase  56.82 
 
 		 362 aa  65.5  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2129  phosphoserine aminotransferase  55.32 
 
 		 363 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.246141  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0494  phosphoserine aminotransferase  56.52 
 
 		 365 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000536248  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1314  phosphoserine aminotransferase  56.52 
 
 		 365 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.177266  hitchhiker  1.24275e-22 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2190  phosphoserine aminotransferase  55.32 
 
 		 362 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2302  phosphoserine aminotransferase  57.45 
 
 		 364 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.589874  hitchhiker  0.000000030251 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1947  phosphoserine aminotransferase  55.32 
 
 		 363 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.72775  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1192  phosphoserine aminotransferase  62.79 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0570  phosphoserine aminotransferase  59.57 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0903  phosphoserine aminotransferase  54 
 
 		 378 aa  62  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1536  phosphoserine aminotransferase  57.45 
 
 		 360 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0949  phosphoserine aminotransferase  54.55 
 
 		 359 aa  62  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0172  phosphoserine aminotransferase  55.32 
 
 		 360 aa  62.4  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.974532  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0924  phosphoserine aminotransferase  55.32 
 
 		 360 aa  62.8  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.395764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1022  phosphoserine aminotransferase  55.32 
 
 		 360 aa  62  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.707312  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0773  phosphoserine aminotransferase  54 
 
 		 378 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.431862  decreased coverage  0.00259178 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0844  phosphoserine aminotransferase  54 
 
 		 378 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.259314  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3014  phosphoserine aminotransferase  57.45 
 
 		 360 aa  61.2  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3120  phosphoserine aminotransferase  54.9 
 
 		 381 aa  60.8  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1793  phosphoserine aminotransferase  57.45 
 
 		 368 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00029635 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2063  phosphoserine aminotransferase  53.19 
 
 		 363 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.234142  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2069  phosphoserine aminotransferase  53.19 
 
 		 363 aa  60.8  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000307219  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2059  phosphoserine aminotransferase  53.19 
 
 		 363 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0529016  unclonable  0.00000000000274518 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0254  phosphoserine aminotransferase  58.14 
 
 		 359 aa  60.5  0.000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.258322  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1950  phosphoserine aminotransferase  53.19 
 
 		 364 aa  60.5  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.471166  hitchhiker  0.00532682 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0922  phosphoserine aminotransferase  59.09 
 
 		 360 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2286  phosphoserine aminotransferase  53.19 
 
 		 363 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000800198  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2403  phosphoserine aminotransferase  53.19 
 
 		 363 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.107805  unclonable  0.0000117739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15820  phosphoserine aminotransferase  54.35 
 
 		 361 aa  60.5  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0918  phosphoserine aminotransferase  59.09 
 
 		 360 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2792  phosphoserine aminotransferase  57.45 
 
 		 368 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159543 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1017  phosphoserine aminotransferase  54.35 
 
 		 362 aa  60.1  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000448614 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0895  phosphoserine aminotransferase  54.35 
 
 		 362 aa  60.1  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2540  phosphoserine aminotransferase  51.06 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0455506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4155  phosphoserine aminotransferase  56.82 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2262  phosphoserine aminotransferase  59.09 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.022425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1568  phosphoserine aminotransferase  55.32 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.110042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3040  phosphoserine aminotransferase  54.35 
 
 		 365 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.382748  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3007  phosphoserine aminotransferase  56.82 
 
 		 360 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.0187233 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1443  phosphoserine aminotransferase  54.55 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.103698  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0433  phosphoserine aminotransferase  56.82 
 
 		 360 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2998  phosphoserine aminotransferase  56.82 
 
 		 360 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.748154  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1634  phosphoserine aminotransferase  56.82 
 
 		 360 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0976  phosphoserine aminotransferase  56.82 
 
 		 360 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1489  phosphoserine aminotransferase  61.54 
 
 		 364 aa  58.9  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0105187  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4720  phosphoserine aminotransferase  53.19 
 
 		 369 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3281  phosphoserine aminotransferase  53.19 
 
 		 369 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0372795  normal  0.449595 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2576  phosphoserine aminotransferase  56.82 
 
 		 360 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0951  phosphoserine aminotransferase  56.82 
 
 		 360 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2886  phosphoserine aminotransferase  56.82 
 
 		 360 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2949  phosphoserine aminotransferase  56.82 
 
 		 360 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254012  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0197  phosphoserine aminotransferase  56.82 
 
 		 360 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00717  phosphoserine aminotransferase  54.76 
 
 		 361 aa  58.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0191898  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1498  phosphoserine aminotransferase  54.55 
 
 		 360 aa  58.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1395  phosphoserine aminotransferase  51.06 
 
 		 371 aa  58.2  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.13819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0563  phosphoserine aminotransferase  56.82 
 
 		 360 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1042  phosphoserine aminotransferase  56.82 
 
 		 360 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>