More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02116 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2759  cell division protein FtsK  55.77 
 
 
879 aa  845    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2011  cell divisionFtsK/SpoIIIE  55.23 
 
 
896 aa  848    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000146975  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1662  DNA segregation ATPase FtsK  50.68 
 
 
855 aa  744    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0615412  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2191  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.51 
 
 
917 aa  839    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000178712  normal  0.118465 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02116  cell division protein FtsK  100 
 
 
831 aa  1701    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00337191  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2215  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.51 
 
 
917 aa  840    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000327747  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2156  cell divisionFtsK/SpoIIIE  55.01 
 
 
917 aa  840    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000852872  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1772  cell division protein FtsK, putative  53.59 
 
 
928 aa  805    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00023204  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2323  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.17 
 
 
917 aa  840    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000157277  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2483  cell divisionFtsK/SpoIIIE  54.05 
 
 
850 aa  783    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000281786  hitchhiker  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2460  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.63 
 
 
837 aa  923    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000438856  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003879  cell division protein FtsK  48.02 
 
 
1014 aa  718    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000123897  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1963  DNA translocase FtsK  55.46 
 
 
914 aa  850    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000218677  normal  0.918259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2013  DNA translocase FtsK  54.6 
 
 
913 aa  837    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00817822  normal  0.0372318 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2050  DNA translocase FtsK  55.09 
 
 
917 aa  845    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000503772  hitchhiker  0.00152361 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2306  cell division protein FtsK, putative  77.31 
 
 
911 aa  632  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28220  Cell division protein FtsK  44.52 
 
 
973 aa  634  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41946  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1743  cell divisionFtsK/SpoIIIE  78.87 
 
 
932 aa  627  1e-178  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000155833  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1795  cell divisionFtsK/SpoIIIE  73.8 
 
 
884 aa  612  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00936905  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2233  cell divisionFtsK/SpoIIIE  73.55 
 
 
849 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00175436  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2127  cell division protein FtsK/SpoIIIE  78.09 
 
 
837 aa  597  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000271124  normal  0.0651093 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2024  cell divisionFtsK/SpoIIIE  77.72 
 
 
841 aa  593  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000111229  unclonable  0.00000274809 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01797  cell division protein FtsK  62.96 
 
 
1120 aa  588  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2596  DNA translocase FtsK  56.52 
 
 
1310 aa  584  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.0000000000551266  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1613  DNA translocase FtsK  73.2 
 
 
1299 aa  583  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00457522  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2685  cell divisionFtsK/SpoIIIE  73.2 
 
 
1310 aa  584  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00501186  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2360  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.65 
 
 
1202 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.647961  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1493  putative cell division protein FtsK  73.1 
 
 
960 aa  578  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121086  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1730  hypothetical protein  70.57 
 
 
794 aa  572  1.0000000000000001e-162  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1730  hypothetical protein  70.82 
 
 
794 aa  573  1.0000000000000001e-162  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2260  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.13 
 
 
1174 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.535537  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1719  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.8 
 
 
1157 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1987  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.28 
 
 
1145 aa  572  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.252325  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1841  DNA translocase FtsK  71.5 
 
 
1091 aa  569  1e-161  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3256  cell divisionFtsK/SpoIIIE  44.88 
 
 
917 aa  568  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00372122  unclonable  0.00000000000948051 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2388  DNA translocase FtsK  71.17 
 
 
802 aa  567  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0162583 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1683  cell division protein FtsK/SpoIIIE  72.16 
 
 
1187 aa  568  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.175033 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00894  DNA-binding membrane protein required for chromosome resolution and partitioning  72.68 
 
 
1342 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2753  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.68 
 
 
1329 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000229654  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0994  DNA translocase FtsK  72.68 
 
 
1360 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.208263  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1074  DNA translocase FtsK  72.68 
 
 
1358 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.282682  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1550  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.1 
 
 
866 aa  565  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2438  DNA translocase FtsK  72.68 
 
 
1310 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000385986  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1052  DNA translocase FtsK  72.68 
 
 
1342 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000465717  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1414  DNA translocase FtsK  67.29 
 
 
1244 aa  562  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0287873  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00901  hypothetical protein  72.68 
 
 
1342 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0965  DNA translocase FtsK  72.68 
 
 
1360 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00251572  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2706  DNA translocase FtsK  72.68 
 
 
1329 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00221849  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1025  DNA translocase FtsK  72.68 
 
 
1321 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.68582  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0965  DNA translocase FtsK  72.68 
 
 
1368 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000342338  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0995  DNA translocase FtsK  72.68 
 
 
1329 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  0.00000000000212407  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1827  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.88 
 
 
789 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.346925  hitchhiker  0.00000783388 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1059  DNA translocase FtsK  72.68 
 
 
1379 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1712  DNA translocase FtsK  66.13 
 
 
789 aa  560  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475518  normal  0.695556 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2593  cell division protein FtsK  69.9 
 
 
804 aa  551  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30290  cell division protein FtsK  69.9 
 
 
811 aa  551  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4004  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.47 
 
 
834 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500623 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1519  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.95 
 
 
786 aa  548  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1829  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.61 
 
 
831 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0290854 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1693  DNA translocase FtsK  64.6 
 
 
782 aa  546  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.782698  normal  0.477366 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1186  DNA translocase FtsK  40.66 
 
 
903 aa  546  1e-154  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00816417  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3609  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.91 
 
 
807 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3349  cell division protein FtsK  64.81 
 
 
801 aa  545  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.293432  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3179  cell divisionFtsK/SpoIIIE protein  68.53 
 
 
801 aa  544  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3408  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.35 
 
 
819 aa  545  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3586  DNA translocase FtsK  68.78 
 
 
802 aa  544  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345612  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1695  cell division protein FtsK, putative  70.98 
 
 
844 aa  542  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2004  DNA translocase FtsK  69.69 
 
 
769 aa  540  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01038  DNA translocase FtsK  68.7 
 
 
786 aa  537  1e-151  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.37301  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1343  FtsK/SpoIIIE family protein  68.91 
 
 
778 aa  538  1e-151  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06128  DNA translocase FtsK  68.7 
 
 
786 aa  537  1e-151  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185359  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1282  cell division protein  68.91 
 
 
778 aa  538  1e-151  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0546  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.73 
 
 
733 aa  533  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.803279  hitchhiker  0.0000950013 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0347  cell division FtsK/SpoIIIE  69.09 
 
 
814 aa  533  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2436  DNA translocase FtsK  67.62 
 
 
1085 aa  532  1e-150  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.277561  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0793  cell division protein  63.51 
 
 
784 aa  529  1e-149  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0704  cell divisionFtsK/SpoIIIE  63.51 
 
 
784 aa  530  1e-149  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1933  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.45 
 
 
786 aa  528  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.440835  normal  0.487385 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2089  cell division FtsK/SpoIIIE  65.57 
 
 
1369 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.123454 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0764  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.1 
 
 
821 aa  527  1e-148  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1764  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.91 
 
 
763 aa  529  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.947558  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0956  cell divisionFtsK/SpoIIIE  66.06 
 
 
1707 aa  524  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.810802  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1193  DNA translocase FtsK  63.36 
 
 
1851 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2600  DNA translocase FtsK  66.07 
 
 
774 aa  524  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1344  hypothetical protein  63.36 
 
 
1851 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0176  cell division FtsK/SpoIIIE  67.26 
 
 
776 aa  523  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3178  cell divisionFtsK/SpoIIIE  65.19 
 
 
784 aa  523  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2240  cell divisionFtsK/SpoIIIE  66.84 
 
 
1610 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.751818 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2344  cell divisionFtsK/SpoIIIE  63.36 
 
 
1527 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0427458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1596  DNA translocase FtsK  67.1 
 
 
1123 aa  525  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262939  normal  0.732523 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1709  cell divisionFtsK/SpoIIIE  63.36 
 
 
1527 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2360  cell divisionFtsK/SpoIIIE  66.84 
 
 
1640 aa  525  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2321  cell divisionFtsK/SpoIIIE  66.58 
 
 
1527 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.800211  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0835  putative cell division protein FtsK  63.36 
 
 
1725 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.816405  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1038  cell divisionFtsK/SpoIIIE  66.33 
 
 
770 aa  520  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.648604 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1185  DNA translocase FtsK  63.36 
 
 
1834 aa  522  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3382  DNA translocase FtsK  66.07 
 
 
776 aa  520  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1924  cell division protein FtsK, putative  63.36 
 
 
1725 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0976  cell division protein FtsK  66.06 
 
 
1784 aa  520  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2423  cell divisionFtsK/SpoIIIE  66.84 
 
 
779 aa  521  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>