More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02112 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 127 aa  253  5e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  55.12 
 
 		 127 aa  143  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  47.54 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  48.18 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  48.7 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  47.41 
 
 		 124 aa  103  9e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  44.63 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  47.41 
 
 		 124 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  47.83 
 
 		 124 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  48.7 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  48.7 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  48.7 
 
 		 124 aa  103  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  48.7 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  47.83 
 
 		 124 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  47.83 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  47.83 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  50.86 
 
 		 133 aa  101  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  45.69 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  48.7 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  43.97 
 
 		 127 aa  100  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  50.86 
 
 		 124 aa  100  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  43.59 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  45.69 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  43.27 
 
 		 123 aa  87.8  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  41.23 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  42.74 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  43.48 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  43.1 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  43.1 
 
 		 122 aa  84.3  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  47.73 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0493  camphor resistance protein CrcB  43.7 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  41.96 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  46.23 
 
 		 228 aa  80.5  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  42.74 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  43.75 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  39.09 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  44.63 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0903  CrcB protein  50.54 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0925  CrcB protein  50.54 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  39.53 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  41.12 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  42.98 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  41.28 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  46.23 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  46.73 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  40.19 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  40.19 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  42.73 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  41.28 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0182  CrcB protein  45.56 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.453198  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  36.94 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2060  CrcB protein  46.46 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000119505  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  44.86 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  40.98 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  42.24 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  44.07 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  42.24 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  40.68 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  41.24 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  34.13 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  40 
 
 		 121 aa  70.1  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4903  camphor resistance protein CrcB  36.61 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  41.58 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  35.59 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  40.4 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  40.21 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  47.92 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  36.61 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  40.38 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  33.33 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  35.24 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  40.16 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  39.17 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0981  camphor resistance protein CrcB  41.53 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3649  camphor resistance protein CrcB  35.24 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  40 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  44.12 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0015  camphor resistance CrcB protein  37.14 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  45.24 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2955  camphor resistance protein CrcB  45.74 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433823  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  42.53 
 
 		 125 aa  67  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  37.17 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0520  CrcB protein  39.52 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  37.17 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  42.53 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  35.71 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  37.17 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  39.8 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  38.52 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>