More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02085 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  100 
 
 		 412 aa  853    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  44.39 
 
 		 404 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  46.15 
 
 		 404 aa  345  7e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  44.63 
 
 		 404 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  44.63 
 
 		 404 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  44.01 
 
 		 404 aa  338  7e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  43.57 
 
 		 419 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  45.26 
 
 		 401 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  43.39 
 
 		 391 aa  335  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  42.86 
 
 		 420 aa  332  9e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3540  phage integrase family site specific recombinase  43.87 
 
 		 411 aa  332  9e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000292707  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  41.95 
 
 		 402 aa  332  9e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  42.14 
 
 		 404 aa  329  6e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  41.3 
 
 		 404 aa  328  8e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  41.56 
 
 		 404 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  42.93 
 
 		 421 aa  327  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  43.89 
 
 		 394 aa  327  3e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3676  integrase family protein  43.41 
 
 		 421 aa  326  4.0000000000000003e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329272  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  41.52 
 
 		 404 aa  326  5e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3537  integrase family protein  42.69 
 
 		 419 aa  324  2e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  42.96 
 
 		 396 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  42.96 
 
 		 394 aa  323  5e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0501  integrase family protein  42.21 
 
 		 419 aa  322  8e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3412  integrase family protein  42.69 
 
 		 424 aa  322  9.000000000000001e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  41.83 
 
 		 404 aa  322  9.000000000000001e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  41.83 
 
 		 404 aa  322  9.000000000000001e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  45.97 
 
 		 402 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  42.46 
 
 		 394 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  41.83 
 
 		 404 aa  321  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3034  integrase family protein  42.45 
 
 		 419 aa  320  3e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  41.75 
 
 		 422 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  41.84 
 
 		 418 aa  319  5e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1586  integrase family protein  42.96 
 
 		 425 aa  319  6e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.97396  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1727  integrase family protein  42.25 
 
 		 425 aa  319  7e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  42.14 
 
 		 402 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  41.61 
 
 		 418 aa  318  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2459  integrase family protein  42.96 
 
 		 428 aa  318  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  41.94 
 
 		 394 aa  316  5e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  42.14 
 
 		 404 aa  315  6e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0858  integrase family protein  41.49 
 
 		 419 aa  315  7e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  43 
 
 		 394 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3419  integrase family protein  41.97 
 
 		 419 aa  315  9.999999999999999e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.837092  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1766  integrase family protein  42.99 
 
 		 425 aa  315  9.999999999999999e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0264741  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  43 
 
 		 394 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  42.29 
 
 		 438 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  43.03 
 
 		 407 aa  312  6.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  42.55 
 
 		 445 aa  312  7.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1669  integrase family protein  41.67 
 
 		 421 aa  312  9e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0447  integrase family protein  41.69 
 
 		 419 aa  311  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0809  phage integrase family site specific recombinase  40.94 
 
 		 419 aa  311  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  42.75 
 
 		 406 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  42.46 
 
 		 417 aa  310  4e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  40.94 
 
 		 396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  40.77 
 
 		 411 aa  306  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3727  integrase family protein  42.97 
 
 		 396 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  40.25 
 
 		 410 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  40.51 
 
 		 397 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04136  predicted integrase  42.71 
 
 		 396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04100  hypothetical protein  42.71 
 
 		 396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  40.79 
 
 		 404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  40.88 
 
 		 420 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  40.52 
 
 		 421 aa  302  6.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  40.88 
 
 		 420 aa  301  9e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  42.75 
 
 		 421 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  41.35 
 
 		 396 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2305  integrase  43.37 
 
 		 424 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000673705  hitchhiker  1.06104e-16 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  41.33 
 
 		 419 aa  300  3e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  40.63 
 
 		 421 aa  300  4e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  40.86 
 
 		 413 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  41.77 
 
 		 409 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2068  integrase  42.34 
 
 		 424 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306631  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  41.41 
 
 		 396 aa  296  6e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  38.81 
 
 		 420 aa  296  6e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  39.95 
 
 		 395 aa  295  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4272  site-specific recombinase, phage integrase family protein  40.15 
 
 		 421 aa  295  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1693  integrase family protein  39.86 
 
 		 423 aa  293  5e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  40.49 
 
 		 406 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4773  integrase  39.43 
 
 		 449 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.368119  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  41.65 
 
 		 419 aa  290  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  38.42 
 
 		 389 aa  290  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  41.5 
 
 		 419 aa  290  3e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  41.5 
 
 		 419 aa  290  3e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  39.75 
 
 		 387 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  41.16 
 
 		 412 aa  288  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0979  site-specific recombinase, phage integrase family protein  40.24 
 
 		 420 aa  288  1e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000444866  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  41.83 
 
 		 397 aa  287  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2887  phage integrase family protein  40.52 
 
 		 416 aa  287  2.9999999999999996e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.416458  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  38.99 
 
 		 391 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  39.61 
 
 		 403 aa  286  5.999999999999999e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4935  integrase family protein  39.76 
 
 		 439 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.020057  hitchhiker  0.000000122122 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2104  phage integrase family site specific recombinase  40.05 
 
 		 420 aa  285  7e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000885987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1514  integrase family protein  39.62 
 
 		 423 aa  285  8e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  40.92 
 
 		 419 aa  285  9e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  40.36 
 
 		 387 aa  285  9e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  40.15 
 
 		 403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  39.75 
 
 		 412 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  38.26 
 
 		 402 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  38.63 
 
 		 404 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  40.64 
 
 		 404 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  39.56 
 
 		 400 aa  282  8.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>