More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02051 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02051  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  100 
 
 
545 aa  1103    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00514196  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0610  sodium/hydrogen exchanger  47.79 
 
 
542 aa  465  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.554486  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4111  sodium/hydrogen exchanger  59.63 
 
 
528 aa  451  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000149336 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2306  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  57.18 
 
 
524 aa  424  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1105  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  46.68 
 
 
553 aa  330  3e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3267  sodium/hydrogen exchanger  50.27 
 
 
542 aa  325  9e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.389403  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0537  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  50 
 
 
535 aa  325  1e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0971234  normal  0.013329 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2640  sodium/hydrogen exchanger  46.92 
 
 
535 aa  324  3e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0415  sodium/hydrogen exchanger  48.53 
 
 
559 aa  318  1e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1189  sodium/hydrogen exchanger  47.01 
 
 
534 aa  318  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3667  sodium/hydrogen exchanger  48.92 
 
 
556 aa  317  4e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1223  sodium/hydrogen exchanger  45.58 
 
 
531 aa  313  3.9999999999999997e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0693873  normal  0.0816945 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0653  sodium/hydrogen exchanger  48.92 
 
 
544 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000617306 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0582  sodium/hydrogen exchanger  50.81 
 
 
552 aa  310  4e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4016  sodium/hydrogen exchanger  49.73 
 
 
541 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000212571 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3407  sodium/hydrogen exchanger  50.93 
 
 
545 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.792145  normal  0.0393803 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3248  sodium/hydrogen exchanger  50.94 
 
 
547 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3577  sodium/hydrogen exchanger  51.46 
 
 
547 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.549647 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0545  sodium/hydrogen exchanger  50.66 
 
 
545 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.408022  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0635  sodium/hydrogen exchanger  49.34 
 
 
551 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0662  sodium/hydrogen exchanger  49.6 
 
 
551 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3727  sodium/hydrogen exchanger  49.87 
 
 
551 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0658  sodium/hydrogen exchanger  49.87 
 
 
551 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0695  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  50.27 
 
 
547 aa  293  7e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0828  sodium/hydrogen antiporter  47.06 
 
 
527 aa  292  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0513  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.87 
 
 
528 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004131  putative Glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  44.92 
 
 
529 aa  283  5.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01333  hypothetical protein  44.65 
 
 
529 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3453  sodium/hydrogen exchanger  45.24 
 
 
523 aa  259  9e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2076  bacterioferritin  73.58 
 
 
159 aa  249  6e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.790215  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  68.18 
 
 
154 aa  218  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  61.04 
 
 
154 aa  207  5e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2230  bacterioferritin  63.69 
 
 
156 aa  206  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.769936  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  58.75 
 
 
172 aa  200  6e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  58.86 
 
 
158 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2530  bacterioferritin subunit 2  70.13 
 
 
156 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.489061  normal  0.794719 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  58.23 
 
 
158 aa  197  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0948  bacterioferritin  68.18 
 
 
157 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.811124  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  59.74 
 
 
156 aa  196  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3358  bacterioferritin  67.53 
 
 
157 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000472947  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3555  bacterioferritin  67.53 
 
 
157 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159062  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2834  bacterioferritin  59.74 
 
 
154 aa  195  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.517561  normal  0.0403197 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0932  bacterioferritin  67.53 
 
 
157 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0946  bacterioferritin  67.53 
 
 
157 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3430  bacterioferritin  67.53 
 
 
157 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0326699  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  58.86 
 
 
158 aa  194  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0944  bacterioferritin  67.53 
 
 
157 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0982  bacterioferritin  67.53 
 
 
157 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.136664  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1082  bacterioferritin  58.23 
 
 
157 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1123  bacterioferritin  58.23 
 
 
157 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4330  bacterioferritin  58.23 
 
 
157 aa  193  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0957  bacterioferritin  68.18 
 
 
156 aa  193  7e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.147551  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1111  bacterioferritin subunit 2  67.53 
 
 
157 aa  192  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  58.23 
 
 
158 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  56.77 
 
 
157 aa  192  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  58.23 
 
 
158 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1061  bacterioferritin  64.52 
 
 
160 aa  192  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  57.59 
 
 
159 aa  189  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1168  bacterioferritin, subunit 2  61.84 
 
 
155 aa  189  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.316626  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0990  bacterioferritin  67.53 
 
 
156 aa  188  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000039605  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  59.09 
 
 
154 aa  187  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2873  bacterioferritin  66.88 
 
 
157 aa  187  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  57.79 
 
 
159 aa  187  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0225  bacterioferritin  54.55 
 
 
159 aa  186  9e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000531808 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0206  bacterioferritin  54.55 
 
 
159 aa  186  9e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142507  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0321  bacterioferritin  59.09 
 
 
157 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2113  bacterioferritin  58.44 
 
 
157 aa  186  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  54.55 
 
 
156 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0403  bacterioferritin  57.79 
 
 
157 aa  183  7e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000898304  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  56.86 
 
 
158 aa  183  7e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3608  bacterioferritin  64.29 
 
 
156 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.199181  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1111  bacterioferritin  57.59 
 
 
157 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0281  bacterioferritin  57.96 
 
 
157 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000088272  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0582  bacterioferritin  57.96 
 
 
157 aa  182  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000092678  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1078  ferritin:bacterioferritin  54.43 
 
 
157 aa  182  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000658417  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3917  bacterioferritin  57.96 
 
 
157 aa  182  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.15009e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0637  bacterioferritin  62.89 
 
 
159 aa  182  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.444791  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  55.84 
 
 
158 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1374  bacterioferritin  53.5 
 
 
158 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599882  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4004  bacterioferritin  55.41 
 
 
157 aa  181  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000958722  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2883  bacterioferritin  54.78 
 
 
158 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00559633  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2370  bacterioferritin  54.78 
 
 
158 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5073  bacterioferritin  55.19 
 
 
158 aa  180  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.66204  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3825  bacterioferritin  55.41 
 
 
157 aa  180  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1383  bacterioferritin  53.8 
 
 
157 aa  180  5.999999999999999e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0116361  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  56.05 
 
 
160 aa  180  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  59.33 
 
 
156 aa  179  8e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03187  bacterioferritin, iron storage and detoxification protein  56.49 
 
 
158 aa  179  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0377  bacterioferritin  56.49 
 
 
158 aa  179  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3530  bacterioferritin  56.49 
 
 
158 aa  179  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457026  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03138  hypothetical protein  56.49 
 
 
158 aa  179  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  56.49 
 
 
158 aa  179  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.705222 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0299  bacterioferritin  53.9 
 
 
159 aa  178  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.91961  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3810  bacterioferritin  55.06 
 
 
158 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101659  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4645  bacterioferritin  55.06 
 
 
158 aa  178  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818391  normal  0.0227171 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3747  bacterioferritin  55.06 
 
 
158 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.051812  normal  0.0497296 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3712  bacterioferritin  55.06 
 
 
158 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00504468  normal  0.710575 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0248  bacterioferritin  54.55 
 
 
159 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3639  bacterioferritin  55.06 
 
 
158 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000409317  normal  0.31124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3639  bacterioferritin  55.06 
 
 
158 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>