More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02044 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  72.12 
 
 
479 aa  719    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02044  putative mercuric reductase  100 
 
 
479 aa  982    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985853  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0168  putative mercuric reductase  68.4 
 
 
550 aa  666    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3488  putative mercuric reductase  69.61 
 
 
552 aa  654    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.852286  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  71.43 
 
 
551 aa  696    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2481  putative mercuric reductase  56.44 
 
 
547 aa  528  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0761993  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2107  putative mercuric reductase  56.22 
 
 
547 aa  526  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  57.08 
 
 
565 aa  525  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  55.39 
 
 
467 aa  522  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  56.93 
 
 
562 aa  521  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  54.74 
 
 
503 aa  513  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  57.91 
 
 
564 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  57.69 
 
 
564 aa  511  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1298  putative mercuric reductase  56.87 
 
 
562 aa  510  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.881891 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  56.56 
 
 
561 aa  510  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1787  putative mercuric reductase  56.21 
 
 
561 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152452  normal  0.329261 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  56.68 
 
 
561 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6495  putative mercuric reductase  56.68 
 
 
561 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1341  putative mercuric reductase  55.23 
 
 
541 aa  507  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.183471  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  56.68 
 
 
561 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  54.83 
 
 
561 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6174  putative mercuric reductase  56.47 
 
 
561 aa  507  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111286  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  56.68 
 
 
561 aa  508  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15460  putative mercuric reductase  56.47 
 
 
561 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698922  unclonable  2.1869799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  54.2 
 
 
561 aa  498  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2758  putative mercuric reductase  53.94 
 
 
468 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  53.99 
 
 
561 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  54.49 
 
 
560 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1340  putative mercuric reductase  54.96 
 
 
562 aa  485  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.657387  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4010  putative mercuric reductase  53.55 
 
 
468 aa  480  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  43.66 
 
 
546 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  43.88 
 
 
479 aa  364  2e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  43.01 
 
 
546 aa  363  3e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  43.01 
 
 
546 aa  362  9e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  43.44 
 
 
767 aa  361  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  44.11 
 
 
767 aa  361  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  43.66 
 
 
745 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  42.58 
 
 
546 aa  346  6e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  41.76 
 
 
475 aa  342  1e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  41.33 
 
 
548 aa  336  5e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  40.04 
 
 
550 aa  329  9e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0840  mercuric reductase  40.13 
 
 
469 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3424  mercuric reductase  40 
 
 
468 aa  324  3e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  41.51 
 
 
457 aa  323  3e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0690  mercuric reductase  40.25 
 
 
481 aa  311  2e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192452  normal  0.6373 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1778  mercuric reductase  39.19 
 
 
480 aa  310  4e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.3364  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4511  mercuric reductase  40.42 
 
 
482 aa  309  6.999999999999999e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955631 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0177  mercuric reductase MerA  37.47 
 
 
469 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  37.76 
 
 
468 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0640  mercuric reductase  37.63 
 
 
468 aa  299  8e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2329  mercuric reductase  40.75 
 
 
476 aa  297  3e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4946  mercuric reductase  38.74 
 
 
476 aa  297  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104965  decreased coverage  0.00400898 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2649  mercuric reductase  39.67 
 
 
478 aa  293  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50.33 
 
 
473 aa  289  9e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4465  mercuric reductase  38.36 
 
 
476 aa  287  4e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4296  mercuric reductase  38.36 
 
 
476 aa  287  4e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4196  mercuric reductase  38.36 
 
 
476 aa  287  4e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25620  mercuric reductase  38.66 
 
 
474 aa  282  1e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06150  mercuric reductase  38.87 
 
 
474 aa  281  2e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3213  mercuric reductase  38.14 
 
 
467 aa  276  5e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163863  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  38.39 
 
 
557 aa  273  6e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5372  mercuric reductase  38.05 
 
 
477 aa  271  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3663  mercuric reductase  35.97 
 
 
458 aa  266  5e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0504  mercuric reductase  36.09 
 
 
449 aa  266  8.999999999999999e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1504  mercuric reductase  34.19 
 
 
453 aa  265  1e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.25653 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1213  mercuric reductase  37 
 
 
464 aa  264  2e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1241  mercuric reductase  36.8 
 
 
448 aa  256  6e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.446801  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2009  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  36.97 
 
 
471 aa  254  3e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2847  mercuric reductase  32.61 
 
 
484 aa  248  2e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2994  mercuric reductase  31.89 
 
 
485 aa  247  4e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  32.75 
 
 
460 aa  244  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.58 
 
 
458 aa  232  9e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1158  mercuric reductase  32.68 
 
 
484 aa  232  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0843858  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.91 
 
 
484 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0426  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.62 
 
 
475 aa  227  4e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  31.55 
 
 
468 aa  226  6e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3597  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.41 
 
 
475 aa  226  7e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000546829  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3775  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.41 
 
 
476 aa  226  7e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000442431  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0428  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.41 
 
 
475 aa  226  7e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00251394  normal  0.166632 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0430  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.41 
 
 
475 aa  226  8e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3854  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.19 
 
 
475 aa  226  9e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.075768  hitchhiker  0.000000345632 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3932  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.62 
 
 
475 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000133391  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.69 
 
 
484 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4052  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.62 
 
 
475 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00676379  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3911  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.62 
 
 
475 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000450783  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.47 
 
 
459 aa  224  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.38 
 
 
484 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3381  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.41 
 
 
476 aa  223  4e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000696126  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.7 
 
 
492 aa  223  4e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.58 
 
 
459 aa  223  4.9999999999999996e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3415  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.2 
 
 
475 aa  223  7e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000233503  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 
464 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.39 
 
 
475 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0321  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.76 
 
 
476 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0683294 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.41 
 
 
717 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0377  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.9 
 
 
476 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349282 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.32 
 
 
463 aa  220  3.9999999999999997e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.26 
 
 
482 aa  219  8.999999999999998e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1459  mercuric reductase  32.82 
 
 
464 aa  219  1e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0433  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.82 
 
 
475 aa  219  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>