More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02012 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  53.79 
 
 
640 aa  681  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2471  ABC transporter ATPase component  52.55 
 
 
638 aa  652  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0490995  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1744  ABC transporter ATPase component  52.97 
 
 
634 aa  674  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.30913  hitchhiker  4.34555e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1948  ABC transporter ATPase component  52.7 
 
 
645 aa  655  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000765701  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2683  ABC transporter ATPase component  53.63 
 
 
641 aa  682  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324813  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1609  ABC transporter ATPase component  53.94 
 
 
640 aa  681  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  55.24 
 
 
637 aa  714  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2647  ABC transporter ATPase component  55.47 
 
 
635 aa  688  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0437839  hitchhiker  0.000617984 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2170  ABC transporter ATPase component  55.47 
 
 
635 aa  701  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  7.10719e-06  normal  0.220785 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2145  ABC transporter ATPase component  53.88 
 
 
639 aa  657  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338763  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2368  ABC transporter ATPase component  55.31 
 
 
635 aa  688  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.561386  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  55.4 
 
 
637 aa  714  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1792  ABC transporter ATPase component  53.49 
 
 
642 aa  667  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1103  ABC transporter ATPase component  55.78 
 
 
635 aa  691  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1064  ABC transporter ATPase component  55.47 
 
 
635 aa  689  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  1.87784e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1058  ABC transporter ATPase component  55.47 
 
 
635 aa  688  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.77813e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  57.21 
 
 
639 aa  731  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1602  ABC transporter ATPase component  52.86 
 
 
638 aa  670  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2281  ABC transporter ATP-binding protein  54.22 
 
 
638 aa  657  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.962843  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2659  ABC transporter ATPase component  53.07 
 
 
638 aa  652  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1542  ABC transporter ATPase component  53.94 
 
 
640 aa  683  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2568  ABC transporter ATPase component  53.63 
 
 
641 aa  682  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.452475  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1814  ABC transporter ATPase component  54.1 
 
 
639 aa  650  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  4.85056e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2006  ABC transporter related  64.33 
 
 
647 aa  843  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1461  ABC transporter ATPase component  54.05 
 
 
635 aa  684  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.185296  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1634  ABC transporter ATPase component  53.05 
 
 
641 aa  681  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202979  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1093  ABC transporter ATPase component  57.21 
 
 
639 aa  721  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.140566  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2468  ABC transporter ATPase component  53.09 
 
 
640 aa  649  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  5.65711e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2608  ABC transporter ATPase component  53.63 
 
 
641 aa  682  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00157626  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  55.24 
 
 
637 aa  714  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1171  ABC transporter ATPase component  55.78 
 
 
635 aa  691  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311518  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1137  ABC transporter ATPase component  55.78 
 
 
635 aa  691  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1553  ABC transporter ATPase component  57.85 
 
 
636 aa  705  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1853  ABC transporter ATPase component  54.1 
 
 
640 aa  681  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3277  ABC transporter, ATP-binding protein Uup  52.57 
 
 
645 aa  689  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1020  ABC transporter ATPase component  55.78 
 
 
635 aa  691  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00168337  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1650  ABC transporter ATPase component  53.83 
 
 
637 aa  686  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00960  hypothetical protein  55.47 
 
 
635 aa  688  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000554098  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1113  ABC transporter ATPase component  55.78 
 
 
635 aa  701  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00085111  normal  0.933236 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1681  ABC transporter ATPase component  54.11 
 
 
649 aa  694  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  57.21 
 
 
639 aa  732  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00953  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  55.47 
 
 
635 aa  688  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000475773  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2065  ABC transporter ATPase component  54.93 
 
 
636 aa  683  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2694  ABC transporter related protein  55.47 
 
 
635 aa  688  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.562851  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1776  ABC transporter ATPase component  53.63 
 
 
641 aa  682  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205391  hitchhiker  0.000192841 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1124  ABC transporter ATPase component  55.78 
 
 
635 aa  691  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.915369  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02012  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
646 aa  1320  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0535295  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0797  ABC transporter ATPase component  55.24 
 
 
644 aa  627  1e-178  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.131165  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0499  ABC transporter related  51.17 
 
 
631 aa  617  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.107412  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1761  ABC transporter related  48.84 
 
 
642 aa  614  1e-174  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1779  ABC transporter, ATP-binding protein  51.16 
 
 
637 aa  606  1e-172  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  5.14394e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  48.86 
 
 
650 aa  599  1e-170  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1388  ABC transporter related  50.55 
 
 
623 aa  594  1e-168  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0285354  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  47.2 
 
 
643 aa  583  1e-165  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0609  ABC transporter, ATP-binding protein  50.63 
 
 
632 aa  583  1e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.446122  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1140  ABC transporter related  47.69 
 
 
645 aa  582  1e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1950  ABC transporter related  46.28 
 
 
653 aa  581  1e-164  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2563  ABC transporter related protein  48.51 
 
 
637 aa  578  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0140209 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  47.34 
 
 
632 aa  580  1e-164  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1649  ABC transporter related  48.31 
 
 
642 aa  578  1e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.39648  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1632  ABC transporter related  48.83 
 
 
627 aa  578  1e-163  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27498  normal  0.259057 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  45.77 
 
 
641 aa  566  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1576  ABC transporter related  49.07 
 
 
641 aa  565  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.712623 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  45.23 
 
 
642 aa  566  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  46.5 
 
 
641 aa  568  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  46.44 
 
 
645 aa  565  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00393  ABC transporter ATP-binding protein  48.8 
 
 
615 aa  568  1e-160  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  46.35 
 
 
636 aa  568  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  46.49 
 
 
640 aa  568  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1419  ABC transporter:AAA ATPase  46.01 
 
 
648 aa  564  1e-159  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.148207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  46.48 
 
 
636 aa  565  1e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1582  ABC transporter related  46.01 
 
 
648 aa  565  1e-159  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0018197  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0913  ABC transporter, ATP-binding protein  47.66 
 
 
633 aa  565  1e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14160  ABC transporter, ATP binding component  48.84 
 
 
639 aa  561  1e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  45.81 
 
 
640 aa  563  1e-159  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0618  ABC transporter related  46.09 
 
 
635 aa  564  1e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.17313e-05 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  45.37 
 
 
649 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0384  ABC transporter related  47.98 
 
 
628 aa  557  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  48.18 
 
 
631 aa  556  1e-157  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  46.17 
 
 
663 aa  558  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  45.37 
 
 
661 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  45.75 
 
 
648 aa  554  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3294  ABC transporter  47.82 
 
 
636 aa  554  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313351  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  45.37 
 
 
649 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  45.37 
 
 
661 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  45.22 
 
 
649 aa  555  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3882  ABC transporter-like  46.99 
 
 
640 aa  553  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3511  ABC transporter related  46.41 
 
 
594 aa  552  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1673  ABC transporter related  47 
 
 
642 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.437344 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  45.75 
 
 
648 aa  554  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3521  ABC transporter, ATP-binding protein  47.82 
 
 
636 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  45.75 
 
 
648 aa  554  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  45.75 
 
 
660 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  45.75 
 
 
660 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3609  ABC transporter related  47.15 
 
 
642 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677442  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  45.75 
 
 
660 aa  554  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2131  ABC transporter ATP-binding protein  47.15 
 
 
642 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40675  normal  0.030462 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1199  ABC transporter related  46.73 
 
 
648 aa  553  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.219582  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  45.96 
 
 
641 aa  548  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.59167e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  44.69 
 
 
626 aa  550  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>