245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02003 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02003  sodium-dependent symporter family protein  100 
 
 		 431 aa  846    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.130323  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1994  sodium:neurotransmitter symporter  75.12 
 
 		 448 aa  633  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000364284  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1411  sodium:neurotransmitter symporter  63.22 
 
 		 449 aa  531  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4081  sodium-dependent symporter family protein  56.45 
 
 		 448 aa  487  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1274  putative sodium-dependent transporter  54.55 
 
 		 448 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1935  sodium-dependent transporter  52.53 
 
 		 448 aa  434  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0352  sodium:neurotransmitter symporter  48.24 
 
 		 458 aa  431  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4156  sodium:neurotransmitter symporter  47.21 
 
 		 452 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0762  sodium-dependent transporter  46.95 
 
 		 454 aa  409  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0994295  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0300  sodium:neurotransmitter symporter  45.65 
 
 		 452 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1873  sodium-dependent transporter  48.22 
 
 		 451 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002721  sodium-dependent transporter  46.56 
 
 		 454 aa  392  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03257  hypothetical protein  46.56 
 
 		 454 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4339  sodium-dependent transporter, putative  46.37 
 
 		 454 aa  389  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4023  sodium:neurotransmitter symporter  47.07 
 
 		 454 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4000  sodium:neurotransmitter symporter  47.07 
 
 		 454 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4116  sodium:neurotransmitter symporter  46.84 
 
 		 454 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3924  sodium:neurotransmitter symporter  46.84 
 
 		 454 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0460  sodium:neurotransmitter symporter  48.02 
 
 		 436 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3587  sodium-dependent symporter family protein  46.45 
 
 		 445 aa  376  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  38.16 
 
 		 453 aa  249  6e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  38.12 
 
 		 455 aa  237  4e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21340  SNF family Na+-dependent transporter  33.78 
 
 		 461 aa  233  5e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00519934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  37.33 
 
 		 456 aa  229  7e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  34.32 
 
 		 453 aa  229  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  36.63 
 
 		 476 aa  226  8e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  37.11 
 
 		 455 aa  225  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  32.82 
 
 		 453 aa  223  4e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  35.06 
 
 		 455 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  35.46 
 
 		 468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  33.85 
 
 		 452 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  37.05 
 
 		 449 aa  217  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1054  sodium:neurotransmitter symporter  33.8 
 
 		 460 aa  218  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000229453  hitchhiker  0.00371281 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1122  sodium- and chloride-dependent transporter  34.61 
 
 		 444 aa  218  2e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000094571  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03634  putative sodium-dependent transporter  32.67 
 
 		 473 aa  216  5e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.439665  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  34.74 
 
 		 450 aa  213  5.999999999999999e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  34.67 
 
 		 446 aa  213  5.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  34.53 
 
 		 454 aa  213  7e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4060  sodium:neurotransmitter symporter  34.5 
 
 		 473 aa  212  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  38.44 
 
 		 475 aa  212  1e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  33.93 
 
 		 450 aa  211  2e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  33.11 
 
 		 453 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4406  sodium-dependent symporter family protein  34.8 
 
 		 474 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11970  SNF family Na+-dependent transporter  33.18 
 
 		 458 aa  208  2e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.277422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  35.48 
 
 		 452 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  32.96 
 
 		 452 aa  206  9e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  33.55 
 
 		 486 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  33.55 
 
 		 461 aa  204  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  34.29 
 
 		 470 aa  204  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  33.64 
 
 		 446 aa  203  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  32.76 
 
 		 454 aa  203  6e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  35.75 
 
 		 453 aa  202  7e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  33.33 
 
 		 486 aa  202  7e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  32.73 
 
 		 446 aa  202  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  32.73 
 
 		 446 aa  202  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  33.73 
 
 		 454 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  35.62 
 
 		 452 aa  202  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  32.95 
 
 		 446 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  32.37 
 
 		 447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  32.73 
 
 		 446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  33.18 
 
 		 446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  33.55 
 
 		 459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17410  SNF family Na+-dependent transporter  33.19 
 
 		 470 aa  200  3e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.231473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  32.73 
 
 		 446 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  32.73 
 
 		 446 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  33.11 
 
 		 454 aa  200  5e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  33.77 
 
 		 454 aa  199  6e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  32.95 
 
 		 446 aa  199  7e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  35.67 
 
 		 464 aa  199  7e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  32.5 
 
 		 446 aa  199  9e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  32.5 
 
 		 446 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  35.2 
 
 		 443 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12871  hypothetical protein  35.54 
 
 		 447 aa  196  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1505  sodium:neurotransmitter symporter family protein  32.96 
 
 		 450 aa  196  8.000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2570  sodium:neurotransmitter symporter  33.26 
 
 		 456 aa  193  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.818181  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0110  sodium:neurotransmitter symporter  33.95 
 
 		 472 aa  193  5e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12951  hypothetical protein  34.54 
 
 		 447 aa  193  5e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0640548  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13021  SNF family Na(+)-dependent transporter  34.54 
 
 		 447 aa  193  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  33.19 
 
 		 457 aa  193  5e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2742  sodium:neurotransmitter symporter  33.33 
 
 		 460 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  34.32 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  31.65 
 
 		 458 aa  191  2e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2394  sodium:neurotransmitter symporter  35.54 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  34.55 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  34.32 
 
 		 445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  34.09 
 
 		 445 aa  190  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  34.32 
 
 		 445 aa  190  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  34.76 
 
 		 447 aa  190  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  34.32 
 
 		 445 aa  190  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1292  sodium- and chloride-dependent transporter  32.75 
 
 		 458 aa  190  5e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.889918  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  34.32 
 
 		 445 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  33.04 
 
 		 464 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3631  sodium:neurotransmitter symporter  34.48 
 
 		 467 aa  189  7e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  34.89 
 
 		 452 aa  189  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  34.09 
 
 		 445 aa  189  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3037  sodium:neurotransmitter symporter  35.35 
 
 		 442 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0942  sodium transporter, putative  32.29 
 
 		 444 aa  188  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  37.41 
 
 		 448 aa  187  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0879  putative sodium transporter  32.58 
 
 		 444 aa  187  5e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0225063  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  33.41 
 
 		 445 aa  186  7e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>