131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01982 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01982  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 297 aa  619  1e-176  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0899928  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1896  hypothetical protein  40.21 
 
 		 249 aa  210  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00295537  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2000  hypothetical protein  36.14 
 
 		 257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03212  hypothetical protein  33.1 
 
 		 251 aa  168  9e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002771  SAM-dependent methyltransferase  33.22 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531144  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2400  hypothetical protein  34.15 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1827  hypothetical protein  33.1 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1053  putative methyltransferase  35.23 
 
 		 239 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.600444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2684  hypothetical protein  35.23 
 
 		 239 aa  152  7e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0282263 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1107  methyltransferase type 11  35.23 
 
 		 239 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0910  methyltransferase type 11  34.06 
 
 		 239 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3137  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 		 236 aa  151  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0747  methyltransferase type 11  34.34 
 
 		 238 aa  148  8e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.955559  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2160  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000564941  normal  0.0553209 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2562  hypothetical protein  31.99 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2237  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000104202  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2840  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0220  putative methyltransferase  35.34 
 
 		 240 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.960094  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0497  methyltransferase type 11  33.68 
 
 		 246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00659645  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1997  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00149539  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2326  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000175678  decreased coverage  0.0000300845 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2012  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000922882  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2060  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000118598  decreased coverage  0.0000900538 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00206  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.66 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00211  hypothetical protein  34.66 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1142  Methyltransferase type 11  33.46 
 
 		 236 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2368  methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000132187  normal  0.0100279 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0217  putative methyltransferase  34.96 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00136304  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3452  methyltransferase type 11  34.66 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.607443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0228  putative methyltransferase  34.96 
 
 		 240 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0210  putative methyltransferase  34.66 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0292  putative methyltransferase  32.85 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0306  putative methyltransferase  32.85 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0922381  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0300  putative methyltransferase  32.85 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0285  putative methyltransferase  33.21 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0287  putative methyltransferase  32.85 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.368037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0226  putative methyltransferase  34.59 
 
 		 240 aa  142  8e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.306208  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3395  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 240 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1777  methyltransferase type 11  30.26 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2206  methyltransferase type 11  30.66 
 
 		 259 aa  136  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0553658  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1008  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 239 aa  136  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.30893  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2610  hypothetical protein  28.83 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000632095  normal  0.867129 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1990  hypothetical protein  30 
 
 		 244 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000251541  hitchhiker  0.00000167474 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2113  hypothetical protein  29.32 
 
 		 240 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2405  methyltransferase type 11  31.27 
 
 		 246 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000054143  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1883  hypothetical protein  29.37 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0021884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2020  methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 239 aa  124  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00106429  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0954  Methyltransferase type 11  27.42 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2816  generic methyl-transferase  28.92 
 
 		 256 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2290  hypothetical protein  29.72 
 
 		 241 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.272643  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1480  methyltransferase type 11  30.52 
 
 		 240 aa  104  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00449789  normal  0.133133 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1620  generic methyl-transferase  37.57 
 
 		 259 aa  103  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.152762  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2207  methyltransferase type 11  31.05 
 
 		 264 aa  103  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000439917  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2040  Methyltransferase type 11  31.11 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1732  Methyltransferase type 11  30.5 
 
 		 262 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0169099  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1023  methyltransferase type 11  28.42 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.386932  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0764  hypothetical protein  29.77 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1594  generic methyl-transferase  36.67 
 
 		 238 aa  94.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1601  hypothetical protein  29.77 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2789  hypothetical protein  30.15 
 
 		 270 aa  94.7  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00141234  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1274  hypothetical protein  29.77 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0595  hypothetical protein  29.77 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1467  hypothetical protein  29.77 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1497  hypothetical protein  29.77 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0557  hypothetical protein  29.77 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0869  methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 271 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292642  normal  0.353512 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1514  hypothetical protein  28.63 
 
 		 257 aa  94  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1252  hypothetical protein  28.72 
 
 		 289 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1535  methyltransferase type 11  38.19 
 
 		 269 aa  93.6  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1679  methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 273 aa  93.6  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.822935 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0808  SAM-dependent methyltransferase  28.21 
 
 		 241 aa  92.8  5e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2280  hypothetical protein  27.31 
 
 		 278 aa  92.8  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0842  Methyltransferase type 11  27.49 
 
 		 272 aa  92.4  9e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1463  hypothetical protein  32.76 
 
 		 233 aa  92  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0975839  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0805  methyltransferase type 11  25.65 
 
 		 270 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.835113  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1286  methyltransferase type 11  25.65 
 
 		 270 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00312409  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1257  methyltransferase type 11  25.65 
 
 		 270 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2872  Methyltransferase type 11  27.11 
 
 		 287 aa  89  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00483361  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4428  hypothetical protein  27.1 
 
 		 270 aa  89  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000816138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1163  methyltransferase type 11  26.34 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0143221  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1175  methyltransferase type 11  27.1 
 
 		 270 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000783857  normal  0.143083 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1744  methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 259 aa  87.8  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1974  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 252 aa  87.8  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2034  methyltransferase type 11  27.1 
 
 		 270 aa  87.4  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0620207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2339  Methyltransferase type 11  26.24 
 
 		 251 aa  86.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.560895  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0592  methyltransferase type 11  27.35 
 
 		 274 aa  86.3  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2022  generic methyl-transferase  26.61 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2652  methyltransferase type 11  30.86 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714866 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1664  methyl-transferase  25.7 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.8813 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29610  hypothetical protein  29.55 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4896  methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4143  hypothetical protein  29.3 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41070  hypothetical protein  29.3 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3715  hypothetical protein  27.37 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1722  hypothetical protein  29.3 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3482  hypothetical protein  28.66 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1971  hypothetical protein  27.4 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536207 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3468  hypothetical protein  29.3 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2185  hypothetical protein  26.4 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1703  SAM-dependent methyltransferase  30.51 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.112357  normal  0.713631 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>