More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01882 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  39.3 
 
 		 998 aa  657    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  52.23 
 
 		 1429 aa  1492    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  38.01 
 
 		 1117 aa  643    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  51.54 
 
 		 1440 aa  1492    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  52.95 
 
 		 1432 aa  1549    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  100 
 
 		 1472 aa  3034    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  61.13 
 
 		 1450 aa  1816    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  41.52 
 
 		 1328 aa  927    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  41.19 
 
 		 1035 aa  747    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  51.48 
 
 		 1440 aa  1492    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  52.92 
 
 		 1441 aa  1481    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  41.74 
 
 		 1329 aa  942    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  37.58 
 
 		 1124 aa  608  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  34.58 
 
 		 1942 aa  553  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  37.35 
 
 		 1025 aa  550  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  36.32 
 
 		 1176 aa  541  9.999999999999999e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  37.38 
 
 		 2156 aa  533  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  35.56 
 
 		 1062 aa  525  1e-147  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  36.07 
 
 		 891 aa  525  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  37.35 
 
 		 1975 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  34.89 
 
 		 946 aa  511  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  33.43 
 
 		 991 aa  501  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2273  pullulanase  39.55 
 
 		 717 aa  498  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  34.9 
 
 		 1891 aa  488  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  34.12 
 
 		 1331 aa  486  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  34.14 
 
 		 1248 aa  480  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  33.3 
 
 		 1855 aa  476  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  33.44 
 
 		 2068 aa  444  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  28.91 
 
 		 1136 aa  291  6e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  29.17 
 
 		 1043 aa  288  5.999999999999999e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  31.59 
 
 		 852 aa  278  5e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  31.55 
 
 		 852 aa  275  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  31.55 
 
 		 852 aa  275  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  31.7 
 
 		 850 aa  275  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  31.3 
 
 		 852 aa  273  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  31.25 
 
 		 848 aa  268  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  28.45 
 
 		 899 aa  259  3e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  31.28 
 
 		 856 aa  258  8e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  30.84 
 
 		 848 aa  256  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  31.4 
 
 		 852 aa  254  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  27.56 
 
 		 655 aa  253  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  28.82 
 
 		 843 aa  250  1e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  28.18 
 
 		 874 aa  250  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  27.32 
 
 		 655 aa  249  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  29.7 
 
 		 843 aa  248  4e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  28.45 
 
 		 1064 aa  248  6.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  31.4 
 
 		 852 aa  247  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  30.8 
 
 		 647 aa  247  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  28.45 
 
 		 1064 aa  247  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  31.08 
 
 		 1888 aa  243  1e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  28.49 
 
 		 640 aa  240  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  29.55 
 
 		 842 aa  239  3e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  30.34 
 
 		 841 aa  231  8e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  31.01 
 
 		 825 aa  231  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  29.65 
 
 		 928 aa  225  4e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  30.22 
 
 		 601 aa  222  3e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  27 
 
 		 766 aa  207  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  25.22 
 
 		 2638 aa  207  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  28.96 
 
 		 718 aa  200  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  28.06 
 
 		 713 aa  199  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  28.67 
 
 		 713 aa  198  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  27.72 
 
 		 713 aa  197  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  27.72 
 
 		 713 aa  197  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  28.23 
 
 		 713 aa  196  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  28.67 
 
 		 713 aa  196  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  27.06 
 
 		 669 aa  196  4e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  27.6 
 
 		 713 aa  195  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  27.82 
 
 		 713 aa  195  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  27.65 
 
 		 713 aa  195  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  27.45 
 
 		 712 aa  190  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  27.04 
 
 		 640 aa  189  3e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  27.35 
 
 		 713 aa  177  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  25.24 
 
 		 776 aa  152  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  26.78 
 
 		 1252 aa  147  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7550  glycogen debranching enzyme GlgX  26.31 
 
 		 702 aa  113  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317676  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  26.15 
 
 		 701 aa  112  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  23.16 
 
 		 706 aa  108  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3828  glycoside hydrolase family 13 protein  23.5 
 
 		 817 aa  107  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  23.44 
 
 		 713 aa  107  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1885  glycogen debranching enzyme GlgX  24.56 
 
 		 727 aa  105  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1249  glycogen debranching enzyme GlgX  23.76 
 
 		 735 aa  105  9e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6811  glycogen debranching enzyme GlgX  26.11 
 
 		 702 aa  104  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  24.39 
 
 		 701 aa  104  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2272  type II secretory pathway protein  31.35 
 
 		 496 aa  103  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  25.4 
 
 		 711 aa  103  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13830  glycogen debranching enzyme GlgX  23.13 
 
 		 720 aa  102  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844349  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  25.4 
 
 		 721 aa  101  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1782  glycogen debranching enzyme GlgX  23.45 
 
 		 688 aa  100  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1495  glycogen operon protein  25.36 
 
 		 750 aa  100  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  24.5 
 
 		 718 aa  99.4  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  22.92 
 
 		 710 aa  99.8  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6129  glycogen debranching enzyme GlgX  24.53 
 
 		 717 aa  99.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1601  glycogen debranching protein GlgX  23.91 
 
 		 701 aa  99  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  24.21 
 
 		 709 aa  98.2  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  23.25 
 
 		 720 aa  97.1  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  23.06 
 
 		 710 aa  96.3  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3027  glycogen debranching enzyme GlgX  23.1 
 
 		 733 aa  96.3  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1358  glycogen debranching enzyme GlgX  23.1 
 
 		 733 aa  95.9  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2449  putative glycosyl hydrolase  24.18 
 
 		 688 aa  95.5  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1322  glycogen debranching enzyme GlgX  22.95 
 
 		 733 aa  95.9  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>