65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01733 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01733  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  100 
 
 		 135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00119694  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0340  hypothetical protein  51.94 
 
 		 141 aa  139  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466882  normal  0.179324 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2358  hypothetical protein  48.91 
 
 		 145 aa  135  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000446127  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0132  hypothetical protein  51.88 
 
 		 141 aa  135  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2474  hypothetical protein  48.91 
 
 		 145 aa  135  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000241237  normal  0.0265077 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1643  hypothetical protein  55 
 
 		 137 aa  136  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00917227  normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1988  hypothetical protein  48.91 
 
 		 145 aa  135  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081199  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2371  hypothetical protein  48.91 
 
 		 145 aa  135  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000054432  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3219  hypothetical protein  47.79 
 
 		 136 aa  130  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00997135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0621  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  130  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3066  hypothetical protein  51.26 
 
 		 136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0730491  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3076  hypothetical protein  51.26 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127053  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0606  hypothetical protein  49.58 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0342  hypothetical protein  49.17 
 
 		 138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000322969  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1301  hypothetical protein  50.42 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  0.898737 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3646  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  45.83 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.432193  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01220  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  42.42 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1305  hypothetical protein  41.73 
 
 		 143 aa  100  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1422  hypothetical protein  37.21 
 
 		 142 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2857  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  33.33 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2333  hypothetical protein  41.04 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104783  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0483  hypothetical protein  30.65 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1107  hypothetical protein  29.32 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.977512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2871  hypothetical protein  31.03 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2532  hypothetical protein  36.21 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2821  hypothetical protein  33.87 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1598  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  34.71 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000483764  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3366  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0431  hypothetical protein  31.58 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02670  hypothetical protein  28.79 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4120  hypothetical protein  27.52 
 
 		 141 aa  67  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0525047  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1955  hypothetical protein  34.31 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1998  hypothetical protein  36.63 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.001435  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3456  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3761  hypothetical protein  30.65 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3514  hypothetical protein  30.48 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.888189  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1996  hypothetical protein  33.01 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000045203  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3229  hypothetical protein  33.87 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4113  hypothetical protein  28.81 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306478  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2582  hypothetical protein  26.98 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1149  hypothetical protein  32.67 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3977  hypothetical protein  32.23 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4505  hypothetical protein  36.67 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646006  normal  0.20017 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4139  hypothetical protein  30.58 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.384863 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2997  hypothetical protein  34.78 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.469628  normal  0.623946 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0287  hypothetical protein  28.33 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01494  hypothetical protein  26.97 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0058  hypothetical protein  29.31 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2033  hypothetical protein  27.12 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003638  hypothetical protein  27.52 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4111  hypothetical protein  25.78 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3097  hypothetical protein  29.25 
 
 		 124 aa  50.8  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00063  hypothetical protein  24 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4107  hypothetical protein  26.27 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02210  hypothetical protein  28.07 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0950  hypothetical protein  47.62 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000580743  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4109  hypothetical protein  23.4 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0317  hypothetical protein  30.63 
 
 		 160 aa  47  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1335  hypothetical protein  24.53 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0885608  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0570  hypothetical protein  24.6 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0613  hypothetical protein  28.41 
 
 		 137 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.764284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0610  hypothetical protein  28.41 
 
 		 137 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0615  hypothetical protein  25.22 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0807  hypothetical protein  30.3 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  27.78 
 
 		 278 aa  40.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>