More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01729 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01729  Holliday junction resolvase  100 
 
 		 146 aa  294  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000012224  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  69.75 
 
 		 173 aa  169  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  68.91 
 
 		 173 aa  167  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2145  Holliday junction resolvase  67.5 
 
 		 173 aa  167  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.25841  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2778  Holliday junction resolvase  70 
 
 		 173 aa  167  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0283844 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2423  Holliday junction resolvase  67.5 
 
 		 173 aa  167  6e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0385722  normal  0.655907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2032  Holliday junction resolvase  67.5 
 
 		 173 aa  167  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000234301  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  68.07 
 
 		 173 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000885772  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  68.07 
 
 		 173 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000504743  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  68.07 
 
 		 173 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  69.17 
 
 		 173 aa  166  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2032  Holliday junction resolvase  69.75 
 
 		 173 aa  166  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00302461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  68.07 
 
 		 173 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2573  Holliday junction resolvase  68.91 
 
 		 173 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00104649  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  68.91 
 
 		 173 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  68.07 
 
 		 173 aa  164  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2431  Holliday junction resolvase  68.07 
 
 		 173 aa  164  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2112  Holliday junction resolvase  67.23 
 
 		 173 aa  164  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0214105 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2052  Holliday junction resolvase  67.23 
 
 		 173 aa  164  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  65.89 
 
 		 173 aa  164  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1225  Holliday junction resolvase  67.23 
 
 		 173 aa  164  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.177509  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2057  Holliday junction resolvase  67.23 
 
 		 173 aa  164  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0681914 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1900  Holliday junction resolvase  68.07 
 
 		 173 aa  164  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300533  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2078  Holliday junction resolvase  68.07 
 
 		 173 aa  164  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000308371  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1349  Holliday junction resolvase  67.23 
 
 		 173 aa  164  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353939 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1885  Holliday junction resolvase  64.34 
 
 		 173 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.94551  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01834  Holliday junction resolvase  66.39 
 
 		 173 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.837934  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1777  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  66.39 
 
 		 173 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00202932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01822  hypothetical protein  66.39 
 
 		 173 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.621329  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1769  Holliday junction resolvase  66.39 
 
 		 173 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0125353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2599  Holliday junction resolvase  66.39 
 
 		 173 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1323  Holliday junction resolvase  66.39 
 
 		 173 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1109  Holliday junction resolvase  66.39 
 
 		 173 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  67.23 
 
 		 173 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1956  Holliday junction resolvase  66.39 
 
 		 173 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.396234  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1955  Holliday junction resolvase  68.07 
 
 		 173 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.873797 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2259  Holliday junction resolvase  65.83 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2431  Holliday junction resolvase  67.23 
 
 		 173 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2093  Holliday junction resolvase  66.39 
 
 		 173 aa  161  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00029798  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2946  Holliday junction resolvase  70.59 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185202  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1841  Holliday junction resolvase  68.07 
 
 		 173 aa  161  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.291427 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1706  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  65.83 
 
 		 175 aa  160  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0826466  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0509  Holliday junction resolvase  63.87 
 
 		 189 aa  160  5.0000000000000005e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  59.71 
 
 		 173 aa  160  8.000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1818  Holliday junction resolvase  65 
 
 		 173 aa  158  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.311556  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2102  Holliday junction resolvase  65 
 
 		 173 aa  158  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2157  Holliday junction resolvase  65.83 
 
 		 173 aa  157  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  64.46 
 
 		 175 aa  156  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  70.59 
 
 		 173 aa  153  9e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0138  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  62.71 
 
 		 174 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  52.78 
 
 		 165 aa  149  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0314  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  60 
 
 		 173 aa  147  4e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.290454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  61.34 
 
 		 174 aa  146  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  61.34 
 
 		 174 aa  146  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2188  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  60.17 
 
 		 185 aa  146  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240809  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  60 
 
 		 174 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  52.74 
 
 		 175 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  61.34 
 
 		 174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  59.5 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  59.5 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2535  Holliday junction resolvase  59.17 
 
 		 173 aa  143  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.278528 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1250  Holliday junction resolvase  54.17 
 
 		 174 aa  141  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  57.02 
 
 		 176 aa  141  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  59.84 
 
 		 176 aa  140  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1250  Holliday junction resolvase  54.17 
 
 		 174 aa  140  7e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  60 
 
 		 180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  59.17 
 
 		 183 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  59.17 
 
 		 183 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  58.33 
 
 		 180 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1433  Holliday junction resolvase  56.45 
 
 		 194 aa  137  4.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  55.38 
 
 		 180 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  58.33 
 
 		 180 aa  137  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  55.38 
 
 		 180 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  59.17 
 
 		 180 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  59.17 
 
 		 180 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  55.38 
 
 		 180 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  55.38 
 
 		 180 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  55.38 
 
 		 180 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  55.38 
 
 		 180 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  58.33 
 
 		 275 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  58.33 
 
 		 284 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0699  Holliday junction resolvase  55.65 
 
 		 194 aa  135  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.207762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  57.5 
 
 		 180 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0671  Holliday junction resolvase  55.65 
 
 		 194 aa  135  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.674635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  59.17 
 
 		 180 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2214  Holliday junction resolvase  57.5 
 
 		 171 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0307344 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  56.2 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  55.83 
 
 		 180 aa  134  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  55.37 
 
 		 164 aa  134  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  56.2 
 
 		 171 aa  133  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2236  Crossover junction endodeoxyribonuclease  55.83 
 
 		 179 aa  133  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1846  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  55.46 
 
 		 186 aa  133  9e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.018832  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  55.93 
 
 		 183 aa  132  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2493  Holliday junction resolvase  53.39 
 
 		 165 aa  132  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  55.37 
 
 		 181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4000  Holliday junction resolvase  63.03 
 
 		 174 aa  131  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  55.37 
 
 		 181 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  55.37 
 
 		 181 aa  130  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4063  Holliday junction resolvase  55.46 
 
 		 179 aa  130  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36710  Holliday junction resolvase  61.34 
 
 		 174 aa  129  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>