More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01681 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01681  hypothetical protein  100 
 
 
545 aa  1120    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  50.46 
 
 
550 aa  566  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4088  hypothetical protein  51.95 
 
 
540 aa  550  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  46.94 
 
 
568 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  46.58 
 
 
563 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  46.22 
 
 
563 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  46.4 
 
 
563 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  46.4 
 
 
565 aa  526  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  45.67 
 
 
565 aa  522  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  47.71 
 
 
560 aa  523  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3710  hypothetical protein  47.96 
 
 
547 aa  520  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  45.68 
 
 
565 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  48.19 
 
 
533 aa  513  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001937  methylglyoxal synthase  45.47 
 
 
552 aa  501  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0255  hypothetical protein  43.72 
 
 
581 aa  413  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0827  methylglyoxal synthase  36.84 
 
 
435 aa  183  8.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0227  putative lipid kinase  32.43 
 
 
328 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535184 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1619  putative lipid kinase  34.88 
 
 
322 aa  147  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742984 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3628  putative lipid kinase  33.56 
 
 
349 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.619357  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4772  putative lipid kinase  32.78 
 
 
323 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7230  Sphingosine kinase-like protein  29.89 
 
 
309 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2781  membrane-associated phospholipid phosphatase  32.57 
 
 
478 aa  97.1  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000634589  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4521  dual specificity protein phosphatase  32.34 
 
 
468 aa  95.1  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1730  Dual specificity protein phosphatase  30.84 
 
 
246 aa  94.7  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4093  diacylglycerol kinase catalytic region  28.1 
 
 
296 aa  94  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2227  diacylglycerol kinase catalytic region  27.15 
 
 
312 aa  94  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0510  hypothetical protein  26.07 
 
 
303 aa  93.6  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01140  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  25.16 
 
 
392 aa  91.7  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2655  diacylglycerol kinase, catalytic region  26.09 
 
 
291 aa  91.3  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.244783  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1455  hypothetical protein  25.73 
 
 
326 aa  89.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.435019  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3254  diacylglycerol kinase catalytic region  29.61 
 
 
300 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2682  diacylglycerol kinase catalytic region  27.63 
 
 
287 aa  88.6  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1023  putative lipid kinase  29.84 
 
 
291 aa  88.6  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0472  diacylglycerol kinase catalytic region  26.05 
 
 
294 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1348  hypothetical protein  25.58 
 
 
293 aa  87.8  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1354  dual specificity protein phosphatase  29.85 
 
 
471 aa  87.8  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302883  normal  0.435307 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1279  dual specificity protein phosphatase  31.55 
 
 
467 aa  87.4  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594668  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0894  dual specificity protein phosphatase  29.85 
 
 
471 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197258  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1376  dual specificity protein phosphatase  29.85 
 
 
471 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1582  diacylglycerol kinase catalytic region  29.28 
 
 
302 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1607  diacylglycerol kinase catalytic region  29.28 
 
 
302 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0369  putative lipid kinase  30.25 
 
 
301 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000301  methylglyoxal synthase  24.76 
 
 
300 aa  85.1  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.235944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4951  putative lipid kinase  30.25 
 
 
301 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1562  diacylglycerol kinase catalytic region  24.25 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0308  putative lipid kinase  30.25 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0291  putative lipid kinase  30.25 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0323  putative lipid kinase  30.25 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0355  putative lipid kinase  30.25 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0303  putative lipid kinase  30.25 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3848  diacylglycerol kinase catalytic region  28.51 
 
 
291 aa  84  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000041794  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2400  diacylglycerol kinase, catalytic region  28.1 
 
 
290 aa  84.3  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0352  putative lipid kinase  29.83 
 
 
301 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0396  putative lipid kinase  29.83 
 
 
301 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2014  PAP2 family protein  30.74 
 
 
430 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0252  putative lipid kinase  25.49 
 
 
293 aa  82.8  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0300  putative lipid kinase  29.83 
 
 
301 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0294  putative lipid kinase  29.83 
 
 
301 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4164  diacylglycerol kinase catalytic region  26.15 
 
 
292 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00574485  hitchhiker  0.00000041756 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0128  diacylglycerol kinase catalytic region  26.64 
 
 
314 aa  82.4  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1631  PAP2 family protein  31.17 
 
 
430 aa  81.6  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832741  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0139  diacylglycerol kinase, catalytic region  25.4 
 
 
364 aa  81.3  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2392  diacylglycerol kinase catalytic region  26.8 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1761  PAP2 family protein  30.6 
 
 
430 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113055 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01366  predicted phosphatase, inner membrane protein  30.74 
 
 
430 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2361  putative dual specificity phosphatase  29.46 
 
 
428 aa  79.7  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0173  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.05 
 
 
506 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.373591  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01378  hypothetical protein  30.74 
 
 
430 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1592  PAP2 family protein  30.74 
 
 
430 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2473  diacylglycerol kinase catalytic region  25.17 
 
 
371 aa  79.3  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  normal  0.358521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2259  diacylglycerol kinase catalytic region  25.08 
 
 
364 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2234  putative dual specificity phosphatase  30.74 
 
 
438 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1254  dual specificity protein phosphatase  30.32 
 
 
467 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1448  diacylglycerol kinase catalytic region  24.41 
 
 
325 aa  78.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  0.551794 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1994  diacylglycerol kinase catalytic region  27.47 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0635024  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1494  PAP2 family protein  30.6 
 
 
430 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2664  diacylglycerol kinase catalytic region  29.58 
 
 
361 aa  78.2  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2247  putative dual specificity phosphatase  30.6 
 
 
438 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1952  putative lipid kinase  25.52 
 
 
315 aa  77.4  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.669604  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1986  putative lipid kinase  25.52 
 
 
315 aa  77.4  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.520999  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1846  putative lipid kinase  29.51 
 
 
309 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1436  putative lipid kinase  32.16 
 
 
316 aa  75.9  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0248  diacylglycerol kinase catalytic region  22.74 
 
 
366 aa  75.5  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00504383  hitchhiker  0.00109168 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3476  putative lipid kinase  26.16 
 
 
300 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0081  putative lipid kinase  26.1 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1567  putative lipid kinase  29.51 
 
 
309 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1852  diacylglycerol kinase catalytic region  25.82 
 
 
301 aa  75.9  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0390  bmrU protein  24.57 
 
 
307 aa  75.1  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0577  hypothetical protein  27.72 
 
 
323 aa  74.7  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0619  hypothetical protein  26.92 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1672  putative lipid kinase  28.86 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3229  diacylglycerol kinase catalytic region  26.77 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2406  diacylglycerol kinase catalytic region  25.52 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.45203  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3842  diacylglycerol kinase catalytic region  26.02 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3052  diacylglycerol kinase, catalytic region  24.1 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.397807  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2741  diacylglycerol kinase catalytic region  27.36 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.775354 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5818  diacylglycerol kinase catalytic region  25.47 
 
 
303 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.331457  hitchhiker  0.00657101 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2179  putative lipid kinase  26.2 
 
 
304 aa  73.6  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4068  diacylglycerol kinase, catalytic region  25.64 
 
 
328 aa  73.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4013  dual specificity protein phosphatase  29.53 
 
 
464 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>