More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01673 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01673  Gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 		 192 aa  384  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000162178  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0151  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.22 
 
 		 420 aa  239  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3942  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  63.89 
 
 		 415 aa  236  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4057  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  63.33 
 
 		 415 aa  234  6e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3849  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  62.78 
 
 		 415 aa  230  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4145  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.99 
 
 		 413 aa  225  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4285  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.11 
 
 		 415 aa  222  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0115  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.11 
 
 		 415 aa  222  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4238  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.11 
 
 		 415 aa  222  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4425  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.11 
 
 		 415 aa  221  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3015  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.89 
 
 		 415 aa  217  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0081  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.67 
 
 		 415 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0762  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.67 
 
 		 415 aa  205  4e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4833  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.54 
 
 		 418 aa  189  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0444  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.31 
 
 		 430 aa  177  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.312195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0781  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.89 
 
 		 456 aa  171  5e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.59 
 
 		 418 aa  170  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.16 
 
 		 418 aa  169  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0792  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.73 
 
 		 410 aa  168  4e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.59 
 
 		 418 aa  167  9e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.23 
 
 		 418 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0235  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.3 
 
 		 429 aa  167  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1776  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.02 
 
 		 427 aa  167  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.67 
 
 		 426 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4268  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.59 
 
 		 416 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.42 
 
 		 420 aa  164  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.07 
 
 		 423 aa  164  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4280  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.88 
 
 		 427 aa  165  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.67 
 
 		 426 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.51 
 
 		 423 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0174  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.07 
 
 		 423 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0657  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.07 
 
 		 435 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291837  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.51 
 
 		 423 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.07 
 
 		 423 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_004310  BR1843  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.46 
 
 		 421 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.246188  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.94 
 
 		 435 aa  162  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.86 
 
 		 418 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.71 
 
 		 423 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0367  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.94 
 
 		 458 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2450  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.94 
 
 		 423 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.06 
 
 		 414 aa  160  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.94 
 
 		 458 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2637  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.94 
 
 		 458 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3412  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.94 
 
 		 458 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1226  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.94 
 
 		 458 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.09 
 
 		 411 aa  159  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2017  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.95 
 
 		 413 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.969749  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.67 
 
 		 418 aa  158  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.32 
 
 		 418 aa  158  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.67 
 
 		 418 aa  158  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.55 
 
 		 418 aa  157  6e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.63 
 
 		 421 aa  157  8e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.61 
 
 		 418 aa  157  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.83 
 
 		 434 aa  157  8e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2442  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.15 
 
 		 426 aa  157  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.38 
 
 		 423 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.53 
 
 		 418 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1056  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.38 
 
 		 427 aa  155  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1199  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.74 
 
 		 425 aa  155  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.30933  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.03 
 
 		 415 aa  155  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0257  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.3 
 
 		 425 aa  154  5.0000000000000005e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.76 
 
 		 418 aa  154  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.99 
 
 		 419 aa  154  6e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2831  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.68 
 
 		 426 aa  154  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20532  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2741  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.26 
 
 		 426 aa  154  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.63 
 
 		 429 aa  153  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.86 
 
 		 418 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.82 
 
 		 415 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0520  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.19 
 
 		 430 aa  153  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121097  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.37 
 
 		 432 aa  154  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.86 
 
 		 415 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.61 
 
 		 418 aa  153  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.94 
 
 		 421 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1214  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.39 
 
 		 423 aa  152  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0253  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.06 
 
 		 430 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2970  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.89 
 
 		 426 aa  152  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1205  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.02 
 
 		 434 aa  152  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.906514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2720  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.33 
 
 		 423 aa  153  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.857443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.38 
 
 		 421 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2285  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.58 
 
 		 422 aa  152  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.207157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3377  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.51 
 
 		 423 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4018  hitchhiker  0.00000000120564 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0321  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.07 
 
 		 435 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.155357  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  48.6 
 
 		 423 aa  152  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.32 
 
 		 424 aa  152  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.26 
 
 		 418 aa  152  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0291  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.63 
 
 		 425 aa  152  4e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000393853  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.63 
 
 		 425 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.93 
 
 		 418 aa  151  5.9999999999999996e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3876  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.82 
 
 		 427 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0207983 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2873  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.01 
 
 		 413 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3027  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.76 
 
 		 415 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.297708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2781  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.3 
 
 		 414 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268278  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2730  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.3 
 
 		 415 aa  149  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2711  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.3 
 
 		 415 aa  149  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0725314  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.3 
 
 		 415 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012162 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2992  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.3 
 
 		 414 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.440021  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2789  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.3 
 
 		 415 aa  149  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0579  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.94 
 
 		 423 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3415  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.85 
 
 		 424 aa  149  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0715531 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2847  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.81 
 
 		 429 aa  149  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.948477  normal  0.581146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>