More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01662 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  82.3 
 
 		 644 aa  796    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  82.42 
 
 		 647 aa  802    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  82.3 
 
 		 644 aa  796    Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  81.95 
 
 		 651 aa  792    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4718  ATP-dependent metalloprotease FtsH  74.58 
 
 		 637 aa  701    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518421  normal  0.0121069 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1770  ATP-dependent metalloprotease FtsH  74.53 
 
 		 651 aa  692    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.292571  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  76.11 
 
 		 638 aa  743    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3424  ATP-dependent metalloprotease FtsH  79.66 
 
 		 657 aa  771    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000853792  decreased coverage  0.000155742 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.25 
 
 		 634 aa  656    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5471  cell division protein FtsH  75.84 
 
 		 642 aa  699    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  81.7 
 
 		 660 aa  800    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  82.42 
 
 		 647 aa  802    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  79.74 
 
 		 649 aa  768    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4497  cell division protein FtsH  74 
 
 		 634 aa  689    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.554573  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.35 
 
 		 641 aa  656    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  71.73 
 
 		 630 aa  692    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  79.87 
 
 		 655 aa  781    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0592  cell division protein FtsH  80.85 
 
 		 660 aa  782    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000468831  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2842  cell division protease ftsH  74.79 
 
 		 639 aa  708    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2711  cell division protease ftsH  74.79 
 
 		 639 aa  708    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4187  peptidase M41, FtsH  73.78 
 
 		 634 aa  691    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000128423  normal  0.66671 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  82.42 
 
 		 647 aa  802    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  71.34 
 
 		 626 aa  690    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0811  ATP-dependent metalloprotease FtsH  75.21 
 
 		 663 aa  752    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.569146  hitchhiker  0.0043584 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  82.2 
 
 		 647 aa  800    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000114537  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  84.04 
 
 		 658 aa  806    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1133  membrane protease FtsH catalytic subunit  71.34 
 
 		 630 aa  666    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0177636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  68.35 
 
 		 641 aa  656    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  67.38 
 
 		 639 aa  643    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  82.63 
 
 		 647 aa  806    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  75.48 
 
 		 641 aa  730    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0772  membrane protease FtsH catalytic subunit  74 
 
 		 635 aa  691    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000087079  normal  0.0618887 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  73.36 
 
 		 659 aa  692    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000208375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0074  cell division protein  69.17 
 
 		 645 aa  646    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  82.42 
 
 		 647 aa  805    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  82.3 
 
 		 644 aa  796    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01662  cell division protein FtsH  100 
 
 		 475 aa  967    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000430091  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  69.17 
 
 		 645 aa  646    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107147  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0703  ATP-dependent metalloprotease FtsH  75.63 
 
 		 650 aa  699    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0142787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  80.93 
 
 		 650 aa  778    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0812  ATP-dependent metalloprotease FtsH  71.31 
 
 		 651 aa  683    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0310743  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  79.66 
 
 		 657 aa  771    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000356985  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.31 
 
 		 642 aa  639    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  79.66 
 
 		 657 aa  771    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000231825  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  71.19 
 
 		 631 aa  656    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  84.36 
 
 		 651 aa  822    Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.38 
 
 		 639 aa  643    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4584  ATP-dependent metalloprotease FtsH  74.63 
 
 		 634 aa  697    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  75.58 
 
 		 647 aa  721    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1467  ATP-dependent metalloprotease FtsH  70.39 
 
 		 644 aa  649    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.179606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1440  cell division protein  70.97 
 
 		 650 aa  660    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  77.54 
 
 		 650 aa  754    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000774852  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  82.73 
 
 		 644 aa  800    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  82.3 
 
 		 644 aa  796    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.52 
 
 		 639 aa  637    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  80.08 
 
 		 657 aa  771    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000520805  hitchhiker  0.00000681699 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  71.61 
 
 		 631 aa  688    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  67.95 
 
 		 640 aa  643    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  82.63 
 
 		 647 aa  806    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1000  ATP-dependent metalloprotease FtsH  80.08 
 
 		 656 aa  781    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000544697  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.52 
 
 		 640 aa  645    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  73.47 
 
 		 655 aa  676    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3985  ATP-dependent metalloprotease  82.63 
 
 		 647 aa  804    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000069949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  82.42 
 
 		 647 aa  802    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  77.38 
 
 		 637 aa  752    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  77.83 
 
 		 627 aa  761    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  78.81 
 
 		 659 aa  774    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  82.84 
 
 		 647 aa  806    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0714  ATP-dependent metalloprotease FtsH  74.63 
 
 		 634 aa  700    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.87442  normal  0.0617842 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  82.63 
 
 		 647 aa  806    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  69.96 
 
 		 640 aa  666    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00158  cell division protease FtsH  69.92 
 
 		 646 aa  640    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1571  ATP-dependent metalloprotease FtsH  89.24 
 
 		 656 aa  843    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000144806  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  82.3 
 
 		 644 aa  796    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  79.66 
 
 		 657 aa  771    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000787677  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4719  ATP-dependent metalloprotease FtsH  74.84 
 
 		 634 aa  697    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  74.89 
 
 		 612 aa  736    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1121  ATP-dependent metalloprotease FtsH  79.87 
 
 		 652 aa  773    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000570756  unclonable  0.00000000000918847 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  79.66 
 
 		 657 aa  772    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000780208  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1084  membrane protease FtsH catalytic subunit  79.66 
 
 		 657 aa  773    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000445375  normal  0.0888545 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  74.36 
 
 		 639 aa  713    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  79.03 
 
 		 657 aa  778    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  70.97 
 
 		 647 aa  660    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  82.94 
 
 		 643 aa  798    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  82.42 
 
 		 650 aa  801    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62860  cell division protein FtsH  75.9 
 
 		 639 aa  694    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3352  ATP-dependent metalloprotease FtsH  82.2 
 
 		 654 aa  803    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000888182  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  82.42 
 
 		 649 aa  802    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42890  ATP-dependent metalloprotease FtsH  74.05 
 
 		 637 aa  696    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3615  membrane protease FtsH catalytic subunit  73.74 
 
 		 640 aa  694    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0280177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  67.95 
 
 		 641 aa  648    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.38 
 
 		 638 aa  635    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  79.66 
 
 		 657 aa  773    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000161981  hitchhiker  0.0000832625 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  74.84 
 
 		 656 aa  708    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000729584  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  84.36 
 
 		 660 aa  816    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  82.63 
 
 		 647 aa  806    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2720  membrane protease FtsH catalytic subunit  70.43 
 
 		 641 aa  631  1e-180  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.38 
 
 		 655 aa  628  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  66.24 
 
 		 681 aa  626  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  66.1 
 
 		 640 aa  622  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>