144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01638 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01638  arginyl-tRNA-protein transferase  100 
 
 
214 aa  454  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000119762  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2372  arginyl-tRNA-protein transferase  50.26 
 
 
231 aa  210  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0011943  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2252  arginyl-tRNA-protein transferase  45.73 
 
 
239 aa  193  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000157492  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2697  arginyl-tRNA-protein transferase  45.73 
 
 
236 aa  193  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000253337  normal  0.128903 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1836  arginyl-tRNA-protein transferase  46.03 
 
 
233 aa  192  4e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000137975  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1568  arginyl-tRNA-protein transferase  49.74 
 
 
234 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000198847  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1881  arginyl-tRNA-protein transferase  45.73 
 
 
236 aa  187  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000197497  hitchhiker  0.000837728 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2463  arginyl-tRNA-protein transferase  45.73 
 
 
236 aa  187  7e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000249099  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2225  arginyl-tRNA-protein transferase  47.15 
 
 
235 aa  187  9e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000635584  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1725  arginyl-tRNA-protein transferase  46.63 
 
 
238 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000702749  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1650  arginyl-tRNA-protein transferase  46.11 
 
 
238 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736484  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2583  arginyl-tRNA-protein transferase  45.73 
 
 
236 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000870424  normal  0.0975132 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2470  arginyl-tRNA-protein transferase  45.23 
 
 
236 aa  185  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000771659  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1755  arginyl-tRNA-protein transferase  45.6 
 
 
238 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000858101  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2624  arginyl-tRNA-protein transferase  44.72 
 
 
238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2054  arginyl-tRNA-protein transferase  44.22 
 
 
237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000273717  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1888  arginyl-tRNA-protein transferase  45.23 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000499329  hitchhiker  0.000014618 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01569  arginyl-tRNA-protein transferase  44.62 
 
 
233 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2216  arginyl-tRNA-protein transferase  41.71 
 
 
230 aa  175  5e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2530  arginyl-tRNA-protein transferase  43.37 
 
 
241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000125656  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1337  arginyl-tRNA-protein transferase  43.33 
 
 
233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223511  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3588  arginyl-tRNA-protein transferase  45.18 
 
 
235 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30260  arginyl-tRNA-protein transferase  45.18 
 
 
235 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2764  arginyl-tRNA-protein transferase  39.19 
 
 
253 aa  170  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0812306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2589  arginyl-tRNA-protein transferase  45.18 
 
 
235 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28250  arginyl-tRNA-protein transferase  44.16 
 
 
252 aa  169  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2391  arginyl-tRNA-protein transferase  44.16 
 
 
235 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0694877 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003954  arginine-tRNA-protein transferase  42.41 
 
 
233 aa  165  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000149764  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3351  hypothetical protein  43.88 
 
 
235 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3181  arginyl-tRNA-protein transferase  43.88 
 
 
235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248167  normal  0.0460167 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2438  arginyl-tRNA-protein transferase  43.28 
 
 
247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1690  arginyl-tRNA-protein transferase  40.8 
 
 
236 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.672767  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4006  arginyl-tRNA-protein transferase  43.08 
 
 
235 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1827  arginyl-tRNA-protein transferase  43.08 
 
 
235 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.856379  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3410  arginyl-tRNA-protein transferase  42.56 
 
 
235 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.317388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3611  arginyl-tRNA-protein transferase  42.56 
 
 
235 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85938  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1755  arginyl-tRNA-protein transferase  39.07 
 
 
237 aa  155  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1109  arginyl-tRNA-protein transferase  40.91 
 
 
251 aa  153  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157369  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0617  arginyl-tRNA-protein transferase  44.04 
 
 
281 aa  149  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.224071 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0019  arginyl-tRNA-protein transferase  41.58 
 
 
247 aa  142  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0648  arginyl-tRNA-protein transferase  37.06 
 
 
238 aa  142  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2042  arginyl-tRNA-protein transferase  38.78 
 
 
240 aa  141  7e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000226368  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04859  arginyl-tRNA-protein transferase  40.31 
 
 
251 aa  139  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.791729  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2597  arginyl-tRNA-protein transferase  41.49 
 
 
238 aa  138  7.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00148691  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1195  arginyl-tRNA-protein transferase  39.09 
 
 
247 aa  137  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0181  Arginyltransferase  35.61 
 
 
246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0334  arginyl-tRNA-protein transferase  39.8 
 
 
254 aa  132  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0236431  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0304  arginyl-tRNA-protein transferase  39.29 
 
 
254 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0181876  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1791  arginyl-tRNA-protein transferase  37.89 
 
 
233 aa  129  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1477  arginyl-tRNA-protein transferase  38.73 
 
 
276 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718047  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1456  arginyl-tRNA-protein transferase  38.73 
 
 
276 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.691361  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1531  arginyl-tRNA-protein transferase  38.24 
 
 
276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1075  arginyl-tRNA-protein transferase  38.24 
 
 
276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1555  arginyl-tRNA-protein transferase  38.24 
 
 
276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1677  arginyl-tRNA-protein transferase  38.24 
 
 
276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.278409 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4697  arginyl-tRNA-protein transferase  38.24 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.165949  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2377  arginyl-tRNA-protein transferase  37.5 
 
 
249 aa  126  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2348  arginyl-tRNA-protein transferase  37.93 
 
 
253 aa  125  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0931  arginyl-tRNA-protein transferase  37.24 
 
 
248 aa  125  6e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0193494  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1075  arginyl-tRNA-protein transferase  37.24 
 
 
248 aa  125  6e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.646097  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1252  arginyl-tRNA-protein transferase  37.5 
 
 
276 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1979  arginyl-tRNA-protein transferase  37.5 
 
 
276 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1735  arginyl-tRNA-protein transferase  37.5 
 
 
276 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0393  arginyl-tRNA-protein transferase  37.5 
 
 
276 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.639576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1810  arginyl-tRNA-protein transferase  37.5 
 
 
276 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.663288  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1826  arginyl-tRNA-protein transferase  37.5 
 
 
276 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0769  arginyl-tRNA-protein transferase  37.5 
 
 
276 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107158  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2510  arginyl-tRNA-protein transferase  36.54 
 
 
276 aa  121  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0990136  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1663  arginyl-tRNA-protein transferase  35.58 
 
 
279 aa  121  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0145011 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0249  arginine-tRNA--protein transferase  35.86 
 
 
236 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0425  Arginyltransferase  35.86 
 
 
236 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557109  hitchhiker  0.00000000502727 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1398  arginyl-tRNA-protein transferase  37.11 
 
 
236 aa  119  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1175  arginyl-tRNA-protein transferase  37.13 
 
 
280 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1979  arginyl-tRNA-protein transferase  35.82 
 
 
247 aa  119  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0083576 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2592  arginyl-tRNA-protein transferase  35.03 
 
 
242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.214767  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1714  arginyl-tRNA-protein transferase  37.82 
 
 
239 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.484439 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3105  arginyl-tRNA-protein transferase  36.95 
 
 
245 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.526442  normal  0.279686 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1079  arginyl-tRNA-protein transferase  34.65 
 
 
252 aa  117  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.474847  normal  0.305047 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1468  arginyl-tRNA-protein transferase  37.13 
 
 
256 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.874672  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2325  arginyl-tRNA-protein transferase  35.64 
 
 
254 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.117095  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2639  arginyl-tRNA-protein transferase  34.65 
 
 
280 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.286005  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1296  arginyl-tRNA-protein transferase  34.65 
 
 
280 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1987  arginyl-tRNA-protein transferase  35.47 
 
 
246 aa  115  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13709  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1787  arginyl-tRNA-protein transferase  35.47 
 
 
246 aa  115  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1724  arginyl-tRNA-protein transferase  34.95 
 
 
253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.290117  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1214  arginyl-tRNA-protein transferase  33.5 
 
 
262 aa  112  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0519713 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0742  arginyl-tRNA-protein transferase  32.18 
 
 
248 aa  113  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4611  arginyl-tRNA-protein transferase  32.85 
 
 
248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.209476  normal  0.240432 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4241  arginyl-tRNA-protein transferase  32.85 
 
 
248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2708  arginyl-tRNA-protein transferase  36 
 
 
251 aa  112  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4761  arginyl-tRNA-protein transferase  32.37 
 
 
248 aa  111  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.767227  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1731  arginyl-tRNA-protein transferase  33.33 
 
 
273 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.226677  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1204  arginyl-tRNA-protein transferase  35.78 
 
 
257 aa  111  8.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0882  arginyl-tRNA-protein transferase  33.33 
 
 
274 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.883111  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2168  arginyl-tRNA-protein transferase  34.27 
 
 
281 aa  110  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0971053  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4859  arginyl-tRNA-protein transferase  33.66 
 
 
249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6838  arginyl-tRNA-protein transferase  33.82 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.143277  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2883  arginyl-tRNA-protein transferase  34.69 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167037 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1318  arginyl-tRNA-protein transferase  33.5 
 
 
266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1931  arginyl-tRNA-protein transferase  33.17 
 
 
255 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14051  normal  0.0172021 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>