39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01590 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01590  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  419  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1026  hypothetical protein  39.33 
 
 
184 aa  95.5  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3928  hypothetical protein  37.84 
 
 
181 aa  92.8  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4470  hypothetical protein  36.67 
 
 
177 aa  90.9  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4649  hypothetical protein  36.25 
 
 
183 aa  89  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.851642 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0322  hypothetical protein  34.46 
 
 
174 aa  87.4  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482084  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3425  hypothetical protein  32.43 
 
 
178 aa  86.3  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.31492 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0284  hypothetical protein  34.69 
 
 
178 aa  84.7  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0268  hypothetical protein  35.26 
 
 
168 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0260  hypothetical protein  34.62 
 
 
168 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3559  hypothetical protein  32.03 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0263  hypothetical protein  34.62 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.624489 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0268  hypothetical protein  34.62 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3456  hypothetical protein  32.9 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0467663  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1319  hypothetical protein  36.31 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1316  hypothetical protein  36.31 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0259  hypothetical protein  33.56 
 
 
177 aa  72  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000328034 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0260  hypothetical protein  34.25 
 
 
177 aa  72  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.454469  hitchhiker  0.00000127449 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3762  hypothetical protein  33.56 
 
 
177 aa  72  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0373  hypothetical protein  31.41 
 
 
179 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67650  hypothetical protein  30.72 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5857  hypothetical protein  29.73 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0399  hypothetical protein  30.72 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45880  hypothetical protein  30.87 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0341  hypothetical protein  27.63 
 
 
207 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3486  hypothetical protein  27.74 
 
 
181 aa  61.6  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.160248 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0355  hypothetical protein  31.13 
 
 
210 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4820  hypothetical protein  29.61 
 
 
210 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0014  hypothetical protein  30.25 
 
 
175 aa  57.8  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.997944  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2319  hypothetical protein  28.57 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001906  hypothetical protein  30.43 
 
 
193 aa  53.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661466  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4142  hypothetical protein  26.32 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00586  hypothetical protein  29.56 
 
 
193 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0244  hypothetical protein  28.57 
 
 
199 aa  50.8  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0768  hypothetical protein  24.39 
 
 
174 aa  49.3  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2650  hypothetical protein  24.54 
 
 
203 aa  46.2  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0048  PKD domain containing protein  25.34 
 
 
217 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3260  hypothetical protein  20.65 
 
 
174 aa  42  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5856  hypothetical protein  28.28 
 
 
173 aa  41.2  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.480656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>