51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01570 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01570  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  494  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1295  hypothetical protein  43.1 
 
 		 237 aa  182  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.785718  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0888  hypothetical protein  35.51 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4573  hypothetical protein  34.96 
 
 		 260 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3548  hypothetical protein  32.81 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3783  hypothetical protein  29.83 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.619325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0162  hypothetical protein  29.69 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.88805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0400  uncharacterized protein-like protein  32.91 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0696  transmembrane protein  30.77 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4493  hypothetical protein  30.77 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129044 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4360  hypothetical protein  30.77 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1137  hypothetical protein  29.55 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0361  hypothetical protein  28.69 
 
 		 235 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3889  uncharacterized protein-like protein  28.4 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725868  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4257  uncharacterized protein-like protein  28.4 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.683033 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5177  hypothetical protein  27.07 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5507  uncharacterized protein-like protein  32.89 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6587  hypothetical protein  27.46 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0308609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1647  hypothetical protein  27.71 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.042207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3590  hypothetical protein  28.8 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080762  normal  0.394996 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1269  hypothetical protein  28.7 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000174467 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01781  hypothetical protein  27.45 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5200  hypothetical protein  28.81 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3056  hypothetical protein  27.62 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1085  putative transmembrane protein  28.19 
 
 		 260 aa  62  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5289  putative transmembrane protein  26.95 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4227  hypothetical protein  24.81 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2576  putative transmembrane protein  26.64 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.245443 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2172  hypothetical protein  26.64 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1332  hypothetical protein  26.05 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0073  hypothetical protein  28.57 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2362  hypothetical protein  26.2 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170965 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2635  hypothetical protein  28.21 
 
 		 232 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352315  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0088  hypothetical protein  28.57 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3700  hypothetical protein  28.74 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.677468  normal  0.239626 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3908  hypothetical protein  25.44 
 
 		 302 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3920  uncharacterized protein-like protein  30.43 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00106031  normal  0.125751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3747  hypothetical protein  26.2 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831367  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1097  hypothetical protein  26.81 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1826  hypothetical protein  27.4 
 
 		 315 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0616664  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0076  hypothetical protein  26.92 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3668  hypothetical protein  26.48 
 
 		 299 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0607  putative anti-sigmaE protein  30.65 
 
 		 210 aa  50.4  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.116214 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0461  hypothetical protein  27.47 
 
 		 240 aa  49.3  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4013  uncharacterized protein-like protein  29.18 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0859661 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1695  hypothetical protein  25 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0649  hypothetical protein  28.38 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7563  hypothetical protein  24.36 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3808  RNA polymerase sigma-70 family protein  23.25 
 
 		 248 aa  42  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178048  normal  0.362907 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2462  hypothetical protein  33.01 
 
 		 276 aa  42  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000051689 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2738  hypothetical protein  32.47 
 
 		 294 aa  41.6  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.300284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>