More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01463 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  100 
 
 		 738 aa  1511    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  62.59 
 
 		 720 aa  938    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  36.11 
 
 		 730 aa  487  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  32.02 
 
 		 724 aa  365  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  31.75 
 
 		 735 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  29.86 
 
 		 714 aa  321  3e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  30.48 
 
 		 717 aa  318  3e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  31.65 
 
 		 714 aa  316  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.64 
 
 		 701 aa  304  5.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  30 
 
 		 732 aa  303  9e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  30 
 
 		 732 aa  303  9e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  29.72 
 
 		 732 aa  300  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  28.55 
 
 		 735 aa  294  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  29.55 
 
 		 739 aa  287  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  29.07 
 
 		 746 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  31.5 
 
 		 728 aa  283  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  31.5 
 
 		 728 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  27.32 
 
 		 714 aa  280  5e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.43 
 
 		 713 aa  280  5e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  29.4 
 
 		 739 aa  280  5e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  32.43 
 
 		 491 aa  238  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  25.66 
 
 		 803 aa  234  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  33.41 
 
 		 478 aa  223  8e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.18 
 
 		 474 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  33.73 
 
 		 518 aa  220  8.999999999999998e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  30.25 
 
 		 502 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  32 
 
 		 483 aa  215  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  29.52 
 
 		 525 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  30.3 
 
 		 483 aa  212  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  31.95 
 
 		 512 aa  212  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  30.3 
 
 		 498 aa  211  4e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  30.59 
 
 		 572 aa  207  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.95 
 
 		 498 aa  205  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.28 
 
 		 504 aa  205  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.74 
 
 		 502 aa  204  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.55 
 
 		 521 aa  203  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  30.68 
 
 		 504 aa  198  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.88 
 
 		 507 aa  191  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  28.04 
 
 		 482 aa  187  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.84 
 
 		 507 aa  187  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  29.47 
 
 		 517 aa  187  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4330  phospholipase D/transphosphatidylase  34.69 
 
 		 515 aa  177  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  29.67 
 
 		 504 aa  174  7.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4847  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.42 
 
 		 517 aa  167  8e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.119076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.36 
 
 		 503 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4699  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.69 
 
 		 513 aa  164  7e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.1 
 
 		 514 aa  156  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  28.16 
 
 		 510 aa  150  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2772  hypothetical protein  28.84 
 
 		 232 aa  102  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  26.42 
 
 		 470 aa  100  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  25.24 
 
 		 533 aa  97.8  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2133  putative transmembrane phospholipase protein  29.67 
 
 		 252 aa  94  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1333  SNARE associated Golgi protein  31.22 
 
 		 236 aa  90.5  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261195 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  29.33 
 
 		 228 aa  89  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  29.51 
 
 		 224 aa  85.5  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  27.86 
 
 		 226 aa  84.7  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  30.07 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  30.69 
 
 		 229 aa  83.2  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  26.81 
 
 		 623 aa  82  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  25.29 
 
 		 510 aa  81.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1237  SNARE associated Golgi protein  29.78 
 
 		 236 aa  79.7  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  30.5 
 
 		 231 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  25.07 
 
 		 754 aa  78.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  25.07 
 
 		 754 aa  78.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  25.07 
 
 		 734 aa  78.2  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  32.14 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  27.03 
 
 		 223 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  26.51 
 
 		 533 aa  76.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  25.7 
 
 		 516 aa  75.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  25.7 
 
 		 516 aa  75.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81277  phospholipase D  22.71 
 
 		 1783 aa  75.9  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  33.58 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2345  hypothetical protein  30.77 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  29.34 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  32.73 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  32.3 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  28.14 
 
 		 239 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.17 
 
 		 546 aa  73.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1483  SNARE associated Golgi protein  25.96 
 
 		 246 aa  72.4  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.183252 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  27.01 
 
 		 320 aa  72.4  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  29.92 
 
 		 240 aa  72  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  31.13 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  21.15 
 
 		 1522 aa  71.6  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3651  hypothetical protein  26.29 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3833  phospholipase D/transphosphatidylase  24.83 
 
 		 472 aa  71.6  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  27.86 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  26.7 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  28.77 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  28.14 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  29.84 
 
 		 224 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  31.93 
 
 		 232 aa  70.1  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1617  DedA-like protein  29.44 
 
 		 234 aa  70.1  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.538877 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  32.5 
 
 		 242 aa  70.5  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  24.21 
 
 		 465 aa  70.5  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3563  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  25.25 
 
 		 497 aa  70.1  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  25.15 
 
 		 242 aa  70.1  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  27.13 
 
 		 222 aa  69.7  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  28.81 
 
 		 325 aa  69.3  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2624  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.01 
 
 		 544 aa  68.9  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1595  hypothetical protein  28.26 
 
 		 227 aa  68.6  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>