More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01373 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  100 
 
 
290 aa  572  1.0000000000000001e-162  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  81.59 
 
 
290 aa  456  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  67.51 
 
 
292 aa  381  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  67.26 
 
 
283 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  67.72 
 
 
285 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  67.72 
 
 
285 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  67.72 
 
 
285 aa  376  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  66.19 
 
 
283 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3359  elongation factor Ts  65.84 
 
 
283 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461306  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  65.84 
 
 
283 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  65.84 
 
 
283 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  65.84 
 
 
283 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  65.84 
 
 
283 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0942  elongation factor Ts  66.19 
 
 
283 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00345216  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  65.84 
 
 
283 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  64.77 
 
 
283 aa  363  2e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  64.77 
 
 
283 aa  363  2e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  64.77 
 
 
283 aa  363  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  64.77 
 
 
283 aa  363  2e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  64.77 
 
 
283 aa  363  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  64.77 
 
 
283 aa  363  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  64.77 
 
 
283 aa  363  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  64.77 
 
 
283 aa  363  2e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  64.77 
 
 
283 aa  363  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  62.9 
 
 
285 aa  353  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  63.25 
 
 
285 aa  352  5e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  65 
 
 
283 aa  350  2e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1554  elongation factor Ts  60.9 
 
 
282 aa  328  5.0000000000000004e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1140  elongation factor Ts  64.26 
 
 
283 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000133846  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  57.34 
 
 
293 aa  318  7.999999999999999e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2634  elongation factor Ts  64.75 
 
 
282 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000554469  normal  0.227391 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2426  elongation factor Ts  65.25 
 
 
282 aa  311  5.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00181853  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  56.51 
 
 
294 aa  311  6.999999999999999e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2884  elongation factor Ts  64.62 
 
 
303 aa  310  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000033426  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  56.6 
 
 
292 aa  310  2e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3280  elongation factor Ts  64.39 
 
 
282 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141167  hitchhiker  0.0000739911 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1271  elongation factor Ts  62.76 
 
 
283 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000259112  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1555  elongation factor Ts  62.76 
 
 
283 aa  301  9e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000849908  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3160  elongation factor Ts  62.45 
 
 
282 aa  299  4e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000947375  normal  0.213818 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1273  elongation factor Ts  55.75 
 
 
286 aa  298  6e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00309579  normal  0.676189 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2640  elongation factor Ts  62.2 
 
 
283 aa  297  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000024092  normal  0.161673 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2707  elongation factor Ts  62.2 
 
 
283 aa  297  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000189418  normal  0.0108139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2814  elongation factor Ts  62.2 
 
 
283 aa  297  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000281155  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  55.36 
 
 
292 aa  296  2e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  55.02 
 
 
292 aa  295  5e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1630  elongation factor Ts  61.86 
 
 
283 aa  295  7e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1349  elongation factor Ts  61.51 
 
 
283 aa  295  7e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281434  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0564  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  55.1 
 
 
289 aa  293  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  52.25 
 
 
289 aa  293  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  55.36 
 
 
292 aa  291  1e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  56.74 
 
 
290 aa  288  8e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03236  elongation factor Ts  61.62 
 
 
281 aa  287  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1850  elongation factor Ts  60.78 
 
 
280 aa  286  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000427669  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  52.08 
 
 
291 aa  286  4e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  53.24 
 
 
293 aa  285  5e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  53.26 
 
 
292 aa  282  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002747  translation elongation factor Ts  60.64 
 
 
281 aa  281  8.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000973884  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1102  elongation factor Ts  51.89 
 
 
287 aa  278  9e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.433956  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1535  translation elongation factor Ts  51.03 
 
 
287 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1344  elongation factor Ts  50.69 
 
 
287 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2901  elongation factor Ts  59.66 
 
 
283 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000344412  normal  0.175279 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1482  elongation factor Ts  59.66 
 
 
283 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000112791  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1446  elongation factor Ts  59.66 
 
 
283 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1451  elongation factor Ts  59.66 
 
 
283 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000175062  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3052  elongation factor Ts  53.43 
 
 
287 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.204992  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  52.07 
 
 
292 aa  272  4.0000000000000004e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38980  elongation factor Ts  55.2 
 
 
289 aa  272  5.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  54.39 
 
 
294 aa  271  7e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  52.22 
 
 
292 aa  269  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  52.22 
 
 
292 aa  269  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  49.83 
 
 
302 aa  268  5e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2547  elongation factor Ts  54.84 
 
 
306 aa  267  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1592  elongation factor Ts  51.08 
 
 
287 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4081  elongation factor Ts  50.72 
 
 
287 aa  265  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.356848 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  51.04 
 
 
292 aa  265  5e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4185  elongation factor Ts  50.72 
 
 
287 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1147  elongation factor Ts  50.72 
 
 
287 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2065  elongation factor Ts  50.35 
 
 
292 aa  263  2e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  48.61 
 
 
291 aa  261  8.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  48.61 
 
 
291 aa  261  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1544  elongation factor Ts  51.03 
 
 
296 aa  260  2e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0609  elongation factor Ts  51.03 
 
 
296 aa  260  2e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00638051  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  49.48 
 
 
291 aa  259  4e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0390  elongation factor Ts  51.89 
 
 
294 aa  258  7e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.432291  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1337  elongation factor Ts  48.74 
 
 
293 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16021  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0351  elongation factor Ts  50.86 
 
 
294 aa  253  3e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.556574  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1683  elongation factor Ts  48.38 
 
 
293 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21632  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1258  elongation factor Ts  49.1 
 
 
293 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363945  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2028  elongation factor Ts  49.1 
 
 
293 aa  250  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  47.42 
 
 
296 aa  250  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1265  elongation factor Ts  50.85 
 
 
291 aa  249  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0528  translation elongation factor Ts  43.11 
 
 
280 aa  249  4e-65  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.101205  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2454  elongation factor Ts  47.65 
 
 
293 aa  249  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.050391  hitchhiker  0.000441551 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  47.78 
 
 
294 aa  248  7e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2492  elongation factor Ts  48.74 
 
 
293 aa  248  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1554  elongation factor Ts  48.74 
 
 
293 aa  248  9e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2582  elongation factor Ts  48.74 
 
 
293 aa  248  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.898525  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1327  elongation factor Ts  48.74 
 
 
293 aa  248  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2436  elongation factor Ts  48.74 
 
 
293 aa  248  9e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.224396  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2055  elongation factor Ts  48.74 
 
 
293 aa  248  9e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0787286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>