222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01370 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01370  uridylyltransferase  100 
 
 		 309 aa  646    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000345793  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_1247  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  61.64 
 
 		 870 aa  389  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1549  protein-P-II uridylyltransferase  51.09 
 
 		 878 aa  295  6e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1853  PII uridylyl-transferase  48.34 
 
 		 881 aa  287  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172176  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00165  PII uridylyl-transferase  46.85 
 
 		 890 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3493  PII uridylyl-transferase  46.85 
 
 		 890 aa  280  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.761936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00164  hypothetical protein  46.85 
 
 		 890 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.920413  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0175  PII uridylyl-transferase  46.85 
 
 		 890 aa  279  5e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0452861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0169  PII uridylyl-transferase  47.02 
 
 		 890 aa  279  5e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0159  PII uridylyl-transferase  46.85 
 
 		 890 aa  279  5e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0691765  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1268  PII uridylyl-transferase  49.82 
 
 		 857 aa  279  5e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3792  PII uridylyl-transferase  45.77 
 
 		 892 aa  279  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.991129  hitchhiker  0.000938474 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0939  PII uridylyl-transferase  44.34 
 
 		 904 aa  278  7e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3436  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  46.5 
 
 		 890 aa  278  8e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0238  PII uridylyl-transferase  46.69 
 
 		 890 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0235  PII uridylyl-transferase  46.69 
 
 		 890 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.862739  normal  0.902468 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0253  PII uridylyl-transferase  46.69 
 
 		 890 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0177  PII uridylyl-transferase  46.85 
 
 		 890 aa  278  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002744  [Protein-PII] uridylyltransferase  45.25 
 
 		 874 aa  277  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0251  PII uridylyl-transferase  46.69 
 
 		 890 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.372246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0235  PII uridylyl-transferase  47.18 
 
 		 890 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2983  PII uridylyl-transferase  45.33 
 
 		 890 aa  277  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03239  PII uridylyl-transferase  45.1 
 
 		 874 aa  277  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3362  PII uridylyl-transferase  45.77 
 
 		 903 aa  276  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0170  PII uridylyl-transferase  46.5 
 
 		 890 aa  276  4e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.751876  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_0705  PII uridylyl-transferase  46.32 
 
 		 891 aa  275  7e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.707926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3167  PII uridylyl-transferase  45.23 
 
 		 893 aa  275  7e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2904  PII uridylyl-transferase  48.42 
 
 		 861 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0760318  normal  0.279173 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1448  PII uridylyl-transferase  48.42 
 
 		 861 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.1847  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1479  PII uridylyl-transferase  48.42 
 
 		 861 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.450236  normal  1 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_1011  PII uridylyl-transferase  45.61 
 
 		 893 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0146749  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_1064  PII uridylyl-transferase  45.61 
 
 		 912 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3437  PII uridylyl-transferase  45.61 
 
 		 893 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1626  PII uridylyl-transferase  48.07 
 
 		 861 aa  273  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2429  PII uridylyl-transferase  46.24 
 
 		 883 aa  273  3e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1443  PII uridylyl-transferase  48.42 
 
 		 861 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.322557  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1346  PII uridylyl-transferase  50.55 
 
 		 860 aa  272  7e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00951231  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2817  PII uridylyl-transferase  47.72 
 
 		 861 aa  270  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0674494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2643  PII uridylyl-transferase  47.37 
 
 		 861 aa  269  5e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843339  normal  0.359945 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_2710  PII uridylyl-transferase  47.37 
 
 		 861 aa  269  5e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.468819  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2637  PII uridylyl-transferase  48.59 
 
 		 857 aa  267  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0239463  normal  0.432402 
 
 
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NC_008709  Ping_3004  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  43.4 
 
 		 869 aa  266  4e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.38403 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2550  PII uridylyl-transferase  44.22 
 
 		 881 aa  263  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1552  PII uridylyl-transferase  47.92 
 
 		 861 aa  262  6e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.350187  n/a   
 
 
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NC_009901  Spea_2887  PII uridylyl-transferase  46.72 
 
 		 851 aa  262  6e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.664043  n/a   
 
 
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NC_008345  Sfri_0910  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  42.41 
 
 		 882 aa  261  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0445386  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_1137  PII uridylyl-transferase  47.18 
 
 		 856 aa  261  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0729778  normal  0.136181 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  46.08 
 
 		 894 aa  258  9e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal  1 
 
 
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NC_007954  Sden_2877  protein-P-II uridylyltransferase  43 
 
 		 874 aa  256  4e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.521501  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  43.11 
 
 		 900 aa  251  8.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  42.41 
 
 		 899 aa  251  8.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  43.6 
 
 		 900 aa  249  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
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NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  42.21 
 
 		 900 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  45.66 
 
 		 899 aa  247  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  42.21 
 
 		 899 aa  246  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002977  MCA0565  protein-P-II uridylyltransferase  43.2 
 
 		 877 aa  246  4e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.184337  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3942  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  42.86 
 
 		 868 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3746  (protein-PII) uridylyltransferase  43.21 
 
 		 867 aa  245  6e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  44.61 
 
 		 893 aa  245  6e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  42.21 
 
 		 900 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1270  metal dependent phosphohydrolase  46.07 
 
 		 897 aa  243  3.9999999999999997e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.439382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3283  PII uridylyl-transferase  45.83 
 
 		 859 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.0000397326 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  41.87 
 
 		 900 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  41.87 
 
 		 898 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  41.87 
 
 		 900 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3163  PII uridylyl-transferase  46.21 
 
 		 859 aa  239  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.258503  normal  0.795531 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  41.18 
 
 		 900 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  41.18 
 
 		 900 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0556  metal dependent phosphohydrolase  42.56 
 
 		 899 aa  236  3e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258602 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0806  protein-P-II uridylyltransferase  43.45 
 
 		 892 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389764  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0395  protein-P-II uridylyltransferase  44.36 
 
 		 915 aa  229  6e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919932 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1287  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  41.11 
 
 		 888 aa  228  9e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.934135  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0441  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  43.98 
 
 		 913 aa  228  9e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1341  PII uridylyl-transferase  42.21 
 
 		 898 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1468  metal dependent phosphohydrolase  43.45 
 
 		 889 aa  222  7e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3229  protein-P-II uridylyltransferase  38.59 
 
 		 857 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0829  PII uridylyl-transferase  40.56 
 
 		 861 aa  216  5e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.328211  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0924  protein-P-II uridylyltransferase  41.95 
 
 		 862 aa  209  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1043  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  41.95 
 
 		 862 aa  209  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030161 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0561  PII uridylyl-transferase  42.26 
 
 		 891 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1685  hypothetical protein  38.52 
 
 		 861 aa  200  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1684  hypothetical protein  38.52 
 
 		 861 aa  200  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  38.01 
 
 		 852 aa  195  9e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1532  PII uridylyl-transferase  38.55 
 
 		 856 aa  195  9e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0731964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1883  PII uridylyl-transferase  37.84 
 
 		 869 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.779236  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  39.78 
 
 		 894 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2457  PII uridylyl-transferase  37.04 
 
 		 859 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100241  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  39.42 
 
 		 894 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1453  PII uridylyl-transferase  36.82 
 
 		 865 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1557  PII uridylyl-transferase  36.52 
 
 		 858 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2496  PII uridylyl-transferase  36.52 
 
 		 858 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0815155  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2585  PII uridylyl-transferase  36.52 
 
 		 858 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2059  PII uridylyl-transferase  36.52 
 
 		 858 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222746  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3252  PII uridylyl-transferase  36.52 
 
 		 858 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.131607  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2439  PII uridylyl-transferase  36.52 
 
 		 858 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1331  PII uridylyl-transferase  36.52 
 
 		 858 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.118754  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2025  PII uridylyl-transferase  36.59 
 
 		 858 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A1679  PII uridylyl-transferase  36.7 
 
 		 859 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894657  normal  0.0862944 
 
 
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NC_010084  Bmul_1255  PII uridylyl-transferase  36.17 
 
 		 858 aa  188  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0751944  normal  1 
 
 
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NC_010551  BamMC406_1923  PII uridylyl-transferase  36.17 
 
 		 858 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.289399 
 
 
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