More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01360 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  100 
 
 		 405 aa  834    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1347  SufS subfamily cysteine desulfurase  70.86 
 
 		 405 aa  615  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969925  hitchhiker  0.000000000139909 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.64 
 
 		 451 aa  482  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.58 
 
 		 404 aa  480  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.32 
 
 		 417 aa  469  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.48 
 
 		 408 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  57.39 
 
 		 417 aa  461  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.85 
 
 		 412 aa  459  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.07 
 
 		 418 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.52 
 
 		 404 aa  457  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.33 
 
 		 429 aa  454  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.58 
 
 		 429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  51.73 
 
 		 412 aa  452  1.0000000000000001e-126  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.84 
 
 		 429 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  52.87 
 
 		 419 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  52.1 
 
 		 420 aa  444  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.09 
 
 		 421 aa  444  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  52.13 
 
 		 414 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.27 
 
 		 427 aa  438  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  52.49 
 
 		 404 aa  436  1e-121  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.96 
 
 		 409 aa  437  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.63 
 
 		 406 aa  435  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.76 
 
 		 621 aa  433  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.86 
 
 		 408 aa  432  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  49.87 
 
 		 405 aa  431  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.88 
 
 		 605 aa  431  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  49.62 
 
 		 405 aa  430  1e-119  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50 
 
 		 429 aa  429  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  49.88 
 
 		 420 aa  431  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50 
 
 		 415 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.35 
 
 		 425 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.01 
 
 		 657 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.5 
 
 		 404 aa  421  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.39 
 
 		 641 aa  421  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.48 
 
 		 419 aa  424  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.75 
 
 		 630 aa  421  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.37 
 
 		 414 aa  421  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.75 
 
 		 678 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.63 
 
 		 662 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.75 
 
 		 414 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.13 
 
 		 416 aa  419  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.5 
 
 		 413 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.49 
 
 		 774 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  50.12 
 
 		 414 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0655  hypothetical protein  50.62 
 
 		 414 aa  415  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0639  hypothetical protein  50.62 
 
 		 414 aa  415  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  49.25 
 
 		 626 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.25 
 
 		 413 aa  417  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.88 
 
 		 408 aa  415  9.999999999999999e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0767  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.75 
 
 		 403 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  50.12 
 
 		 414 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.63 
 
 		 679 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  48.99 
 
 		 604 aa  414  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.62 
 
 		 444 aa  413  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  49.13 
 
 		 422 aa  412  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50 
 
 		 413 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  49.75 
 
 		 682 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  49.75 
 
 		 688 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  49.75 
 
 		 412 aa  413  1e-114  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  47.1 
 
 		 425 aa  413  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  48.99 
 
 		 604 aa  414  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  48.38 
 
 		 410 aa  409  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.25 
 
 		 629 aa  409  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.75 
 
 		 406 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.59 
 
 		 416 aa  410  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.89 
 
 		 414 aa  408  1e-113  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.87 
 
 		 608 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  48.99 
 
 		 661 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  49.12 
 
 		 413 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.65 
 
 		 414 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  48.99 
 
 		 666 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  47.65 
 
 		 404 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.14 
 
 		 414 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.75 
 
 		 413 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  47.75 
 
 		 665 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.99 
 
 		 650 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  46.91 
 
 		 414 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.74 
 
 		 666 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  50.37 
 
 		 416 aa  401  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  50 
 
 		 419 aa  403  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.27 
 
 		 644 aa  402  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.52 
 
 		 413 aa  403  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  48.77 
 
 		 413 aa  401  9.999999999999999e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.88 
 
 		 413 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  46.65 
 
 		 403 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.78 
 
 		 413 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  48.19 
 
 		 429 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.78 
 
 		 413 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0854  aminotransferase, class V  47.51 
 
 		 403 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0840  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.87 
 
 		 437 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.550163  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  50.63 
 
 		 408 aa  401  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.88 
 
 		 413 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.52 
 
 		 418 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.28 
 
 		 418 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0859  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.51 
 
 		 403 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  48.03 
 
 		 406 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.88 
 
 		 414 aa  396  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0735  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.01 
 
 		 403 aa  397  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  48.15 
 
 		 415 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.4 
 
 		 414 aa  396  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>