More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01281 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  100 
 
 		 87 aa  174  5e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  50.59 
 
 		 97 aa  92.8  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  48.24 
 
 		 110 aa  92  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1917  regulatory protein, ArsR  47.62 
 
 		 117 aa  90.1  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.984874 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  43.53 
 
 		 106 aa  89.4  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  48.15 
 
 		 102 aa  87.4  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 106 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 109 aa  87  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  49.38 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 102 aa  86.7  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1264  regulatory protein, ArsR  46.43 
 
 		 117 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2606  ArsR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  45.88 
 
 		 115 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  43.02 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6792  ArsR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.439051  normal  0.0283932 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  48.15 
 
 		 101 aa  83.6  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  47.5 
 
 		 114 aa  83.6  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 102 aa  83.6  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 101 aa  83.6  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  46.91 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  49.38 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  46.91 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  46.91 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  48.15 
 
 		 101 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2812  transcriptional regulator  47.06 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.158239 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00976  hypothetical protein  46.51 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  46.91 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  48.84 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1425  regulatory protein, ArsR  51.32 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 116 aa  82  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1527  regulatory protein ArsR  47.06 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6240  ArsR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 94 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 119 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  42.35 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3220  ArsR family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  43.53 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3726  ArsR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1791  ArsR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4262  ArsR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203517  normal  0.594903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4139  transcriptional regulator, ArsR family  47.67 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.908803  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2068  ArsR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 96 aa  78.6  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.887596  normal  0.21575 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4146  regulatory protein, ArsR  45.24 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  46.43 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  38.27 
 
 		 106 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2316  transcriptional regulator, TrmB  46.51 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.66279  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 111 aa  77.8  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  38.82 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004423  transcriptional activator HlyU  44.71 
 
 		 100 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188739  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  45 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4378  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0649635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  43.53 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  43.53 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  42.53 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4967  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  43.21 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  40.74 
 
 		 116 aa  77  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1182  regulatory protein, ArsR  44.05 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2105  ArsR family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0923  transcriptional regulator, TrmB  49.35 
 
 		 105 aa  77  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  42.35 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  43.53 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  43.53 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0210  transcriptional activator HlyU  45.12 
 
 		 85 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000976206  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  43.02 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  40.24 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2292  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 99 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863307  hitchhiker  0.000000172581 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  40.74 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3922  hypothetical protein  43.53 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.63414  normal  0.473928 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2752  transcriptional regulator, TrmB  46.75 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3418  ArsR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00835555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1619  regulatory protein ArsR  43.02 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2309  regulatory protein ArsR  43.82 
 
 		 114 aa  74.7  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.374797 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>