More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01274 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  100 
 
 		 150 aa  305  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  73.83 
 
 		 152 aa  229  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  73.43 
 
 		 152 aa  210  5.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  61.54 
 
 		 151 aa  184  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  58.33 
 
 		 151 aa  174  4e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  52.08 
 
 		 143 aa  155  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  53.79 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  53.52 
 
 		 165 aa  154  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  48.65 
 
 		 148 aa  151  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  51.06 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  51.35 
 
 		 146 aa  150  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  50 
 
 		 148 aa  148  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  50 
 
 		 145 aa  147  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  44.97 
 
 		 148 aa  146  8e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  45.77 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  49.65 
 
 		 149 aa  144  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  48.63 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  48.23 
 
 		 145 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  49.66 
 
 		 153 aa  143  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  52.05 
 
 		 151 aa  143  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  49.31 
 
 		 144 aa  143  9e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  51.43 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  51.43 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  51.43 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  51.43 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  51.43 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  51.43 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  51.43 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2731  response regulator receiver protein  55.1 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  51.43 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  51.43 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  47.55 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  47.02 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  52.59 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  47.89 
 
 		 148 aa  140  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  46.43 
 
 		 139 aa  140  7e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  48.94 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  51.45 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  47.86 
 
 		 139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  48.97 
 
 		 153 aa  136  7.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  49.29 
 
 		 145 aa  136  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  47.59 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  44.68 
 
 		 146 aa  133  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  42.95 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  42.95 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  42.95 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  44 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  44.37 
 
 		 146 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  44.29 
 
 		 147 aa  129  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  44.29 
 
 		 147 aa  129  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  44.68 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  44.37 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  46.62 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  44.29 
 
 		 148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  46.62 
 
 		 149 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  45.52 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 148 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  45.39 
 
 		 145 aa  124  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  43.45 
 
 		 148 aa  123  8.000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  44.93 
 
 		 149 aa  123  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  41.43 
 
 		 148 aa  123  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 144 aa  122  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1004  response regulator receiver domain-containing protein  43.92 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  40.67 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1861  response regulator receiver protein  46.97 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.123392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  45 
 
 		 148 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  43.45 
 
 		 143 aa  120  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  45.99 
 
 		 181 aa  120  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  44.27 
 
 		 162 aa  120  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  41.3 
 
 		 145 aa  120  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  41.33 
 
 		 153 aa  120  8e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  42.45 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  44.29 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  41.48 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  43.28 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  45.8 
 
 		 137 aa  118  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  42.14 
 
 		 149 aa  118  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  43.51 
 
 		 162 aa  117  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  39.86 
 
 		 160 aa  117  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0092  response regulator receiver protein  38.51 
 
 		 152 aa  117  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2404  response regulator receiver  36.49 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0437246 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  47.58 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  37.14 
 
 		 156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  39.57 
 
 		 146 aa  113  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  39.86 
 
 		 151 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  42.03 
 
 		 153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1248  response regulator receiver protein  41.73 
 
 		 157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.234845  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  41.04 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  40.29 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  39.85 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3434  response regulator receiver protein  37.88 
 
 		 146 aa  110  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0662678 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4440  response regulator receiver protein  42.14 
 
 		 145 aa  110  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  39.86 
 
 		 164 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  40.46 
 
 		 156 aa  110  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  40.43 
 
 		 144 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  39.86 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2630  response regulator receiver domain-containing protein  40.54 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0587673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  39.71 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>