More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01173 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  46.26 
 
 
956 aa  812    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  44.61 
 
 
960 aa  822    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  48 
 
 
929 aa  834    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  48 
 
 
949 aa  833    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  50.17 
 
 
921 aa  892    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  47.89 
 
 
947 aa  830    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  44.74 
 
 
952 aa  754    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  44.83 
 
 
962 aa  824    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  100 
 
 
930 aa  1905    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  43.92 
 
 
959 aa  767    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2615  peptidase M16 domain-containing protein  52.66 
 
 
910 aa  971    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0381043  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  46.32 
 
 
967 aa  803    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  45.43 
 
 
949 aa  823    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  35.94 
 
 
943 aa  542  9.999999999999999e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  33.51 
 
 
945 aa  437  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  32.91 
 
 
947 aa  439  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  34.02 
 
 
944 aa  439  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  33.08 
 
 
947 aa  430  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  33.51 
 
 
944 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  32.04 
 
 
969 aa  428  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  33.3 
 
 
943 aa  429  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  34.49 
 
 
949 aa  425  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1218  peptidase M16-like protein  33.37 
 
 
974 aa  425  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  34.31 
 
 
949 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  34.42 
 
 
949 aa  423  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  34.17 
 
 
944 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  34.06 
 
 
950 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  34.17 
 
 
950 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  34.17 
 
 
950 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  31.26 
 
 
958 aa  421  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  33.48 
 
 
944 aa  422  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  31.42 
 
 
945 aa  417  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  33.19 
 
 
945 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  33.99 
 
 
949 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  30.82 
 
 
959 aa  416  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  33.98 
 
 
944 aa  415  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  32.15 
 
 
950 aa  412  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0298  peptidase M16-like  34.29 
 
 
903 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0309  peptidase M16 domain protein  33.98 
 
 
901 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  31.31 
 
 
952 aa  405  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0320  peptidase M16 domain protein  33.9 
 
 
904 aa  389  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812117  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  28.31 
 
 
954 aa  372  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  29.05 
 
 
954 aa  337  5e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  43.03 
 
 
458 aa  319  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  43.03 
 
 
458 aa  318  4e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  42.79 
 
 
458 aa  317  9e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  26.23 
 
 
896 aa  283  9e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  26.88 
 
 
937 aa  283  1e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  25.03 
 
 
945 aa  265  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1272  peptidase M16 domain protein  39.71 
 
 
470 aa  260  7e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720642  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3569  peptidase M16 domain-containing protein  38.19 
 
 
429 aa  252  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.368012  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0871  peptidase M16 domain protein  37.32 
 
 
423 aa  251  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  26.29 
 
 
876 aa  234  5e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3948  peptidase M16 domain-containing protein  38.61 
 
 
429 aa  233  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425388  normal  0.429143 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2363  putative zinc proteinase  34.58 
 
 
447 aa  230  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  24.4 
 
 
929 aa  222  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0404  peptidase M16 domain protein  35.27 
 
 
442 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  34.38 
 
 
440 aa  216  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  32.88 
 
 
440 aa  214  7e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19030  predicted Zn-dependent peptidase  35.42 
 
 
427 aa  211  5e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.498908  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3008  peptidase M16 domain protein  25.25 
 
 
918 aa  208  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0019  peptidase M16 domain protein  33.09 
 
 
413 aa  208  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.638871  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  33.57 
 
 
461 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0276  hypothetical protein  32.2 
 
 
411 aa  201  7e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.166911 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  25.45 
 
 
919 aa  200  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1834  peptidase M16 domain protein  25.39 
 
 
934 aa  199  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106959  normal  0.617697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1589  peptidase M16 domain protein  33.09 
 
 
414 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43128  normal  0.157627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0704  peptidase M16 domain protein  34.78 
 
 
411 aa  199  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0081  peptidase M16 domain-containing protein  31.65 
 
 
463 aa  196  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.197532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4238  peptidase M16 domain protein  31.74 
 
 
436 aa  196  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.259515  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4128  peptidase M16 domain-containing protein  33.58 
 
 
437 aa  196  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  34.45 
 
 
464 aa  195  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3747  peptidase M16 domain-containing protein  34.1 
 
 
448 aa  195  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.386078 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  32.45 
 
 
489 aa  195  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  33.61 
 
 
461 aa  193  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  30.51 
 
 
464 aa  193  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  30.88 
 
 
441 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  31.48 
 
 
477 aa  192  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3796  peptidase M16-like  33.41 
 
 
433 aa  191  5e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0607988  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  25.11 
 
 
912 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  33.01 
 
 
463 aa  191  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  24.92 
 
 
949 aa  191  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  31.41 
 
 
506 aa  190  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2253  peptidase M16 domain-containing protein  25.68 
 
 
912 aa  190  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.890772  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  23.31 
 
 
853 aa  189  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  33.33 
 
 
476 aa  188  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  30.51 
 
 
459 aa  188  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  25.16 
 
 
942 aa  187  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  29.07 
 
 
442 aa  187  7e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0863  peptidase M16 domain protein  33.8 
 
 
428 aa  187  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.282828  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  28.13 
 
 
443 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  32.35 
 
 
448 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  31.6 
 
 
448 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  31.6 
 
 
448 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3182  zinc protease  31.71 
 
 
411 aa  185  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  27.41 
 
 
461 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  31.22 
 
 
453 aa  184  8.000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  28.87 
 
 
443 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1312  peptidase M16 domain protein  23.87 
 
 
840 aa  183  1e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2922  peptidase M16 domain protein  23.85 
 
 
903 aa  183  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.179553  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>