More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01142 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01142  putative fumarylacetoacetate hydrolase family protein  100 
 
 
222 aa  462  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2395  hypothetical protein  50 
 
 
218 aa  237  9e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0911799  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2007  hypothetical protein  50 
 
 
218 aa  237  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0101882  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2118  hypothetical protein  50 
 
 
218 aa  237  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0891763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2468  5-oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase  52.45 
 
 
219 aa  234  8e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0015022  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2753  hypothetical protein  49.54 
 
 
218 aa  234  9e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000267242  hitchhiker  0.000114559 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2800  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  49.08 
 
 
219 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9861  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01155  predicted isomerase/hydrolase  52.45 
 
 
219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00189492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2445  hypothetical protein  52.45 
 
 
219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000248355  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1666  hypothetical protein  52.45 
 
 
219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000638137  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01165  hypothetical protein  52.45 
 
 
219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0013679  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1280  hypothetical protein  52.45 
 
 
219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000019251  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1335  hypothetical protein  52.45 
 
 
219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00641682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1324  hypothetical protein  52.45 
 
 
219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000369423  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1969  hypothetical protein  51.96 
 
 
219 aa  231  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000105527  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1951  hypothetical protein  50.98 
 
 
219 aa  231  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1505  hypothetical protein  50.98 
 
 
219 aa  231  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474935  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2011  hypothetical protein  50.98 
 
 
219 aa  231  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.517468  normal  0.203097 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1954  hypothetical protein  50.98 
 
 
219 aa  231  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0707644  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1321  hypothetical protein  50.98 
 
 
219 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114215  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2369  hypothetical protein  50.23 
 
 
219 aa  230  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000473957  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2004  hypothetical protein  49.05 
 
 
218 aa  229  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.394178  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1999  hypothetical protein  48.17 
 
 
218 aa  226  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00012789  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1942  hypothetical protein  49.25 
 
 
218 aa  220  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000035991  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2238  hypothetical protein  49.25 
 
 
218 aa  220  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000304661  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2815  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  49.08 
 
 
220 aa  209  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5292  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  44.8 
 
 
221 aa  198  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0585  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  45.45 
 
 
218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3666  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  45 
 
 
218 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0202115  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4850  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  44.13 
 
 
221 aa  194  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2937  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  43.81 
 
 
218 aa  192  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000218618 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5385  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45.71 
 
 
221 aa  191  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.02221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0312  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45.71 
 
 
221 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.163162 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4230  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  43.44 
 
 
232 aa  190  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3591  5-oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase  44.33 
 
 
218 aa  190  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000122928  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5060  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  44.29 
 
 
221 aa  188  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0543  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  48.53 
 
 
225 aa  188  5e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0262694  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5153  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  44.29 
 
 
221 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479206  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0663  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  43.78 
 
 
218 aa  187  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8085999999999997e-26 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5206  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  44.29 
 
 
221 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.640418  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48300  Fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein  43.81 
 
 
233 aa  184  8e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04150  hypothetical protein  42.99 
 
 
221 aa  184  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0650  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  43.84 
 
 
218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0979  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  42.78 
 
 
212 aa  180  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202477  normal  0.468073 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0603  FAA hydrolase family protein  43.52 
 
 
217 aa  178  7e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000290593  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2939  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.84 
 
 
203 aa  177  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.494423  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0411  hypothetical protein  42.08 
 
 
221 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0299  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.91 
 
 
238 aa  169  3e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0330  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40 
 
 
238 aa  168  6e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0882  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.69 
 
 
203 aa  165  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00308706 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1389  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  38.53 
 
 
234 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.025067  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4986  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  42.7 
 
 
203 aa  164  9e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13578  putative hydrolase  42.55 
 
 
204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.503047  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4140  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.62 
 
 
232 aa  161  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0134832 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1114  5-oxopent-3-ene-1,2,5- tricarboxylatedecarboxylas e  39.39 
 
 
219 aa  159  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3854  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.04 
 
 
232 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.684929  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1891  2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase  40.3 
 
 
203 aa  160  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00665763 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4514  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.04 
 
 
232 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0703423  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1190  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  37.16 
 
 
234 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.264121  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0012  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.16 
 
 
234 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.416391  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0151  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  37.16 
 
 
234 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.618923  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1409  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  37.16 
 
 
234 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.607879  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1149  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  37.16 
 
 
234 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180256  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0429  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  37.16 
 
 
234 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.843936  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1495  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.7 
 
 
234 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.336195  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3945  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.62 
 
 
232 aa  157  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.58292  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1336  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.04 
 
 
252 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.392784 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1535  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  42.31 
 
 
203 aa  156  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0341155  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80437  fumarylacetoacetate hydralase  39.07 
 
 
231 aa  154  8e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0346038  normal  0.482803 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4408  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.58 
 
 
232 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.212446 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3907  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.6 
 
 
232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3169  FAA-hydrolase-family protein  39.6 
 
 
232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.750282  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1185  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  38.54 
 
 
219 aa  152  4e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5790  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.81 
 
 
232 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1692  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.07 
 
 
228 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1607  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.07 
 
 
233 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89984  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0072  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  36.5 
 
 
225 aa  149  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.620736  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3042  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  36.49 
 
 
228 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0423  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.31 
 
 
256 aa  149  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.661948  normal  0.403519 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1425  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.24 
 
 
233 aa  148  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1536  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.31 
 
 
203 aa  148  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0073  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  35.86 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0173  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  34.34 
 
 
236 aa  146  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0063  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  36.14 
 
 
229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0062  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  36.14 
 
 
229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1873  hypothetical protein  36.14 
 
 
235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01832  fumarylacetoacetate hydrolase  39.42 
 
 
237 aa  145  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.856311  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0677  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  35.55 
 
 
234 aa  145  6e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2706  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  35.19 
 
 
231 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4515  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  36.73 
 
 
233 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3437  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  34.72 
 
 
228 aa  145  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518688  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2018  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  33.66 
 
 
233 aa  144  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0213  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  35.92 
 
 
228 aa  144  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.508726 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3195  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.32 
 
 
238 aa  144  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.48446  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1562  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  36.41 
 
 
228 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2909  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase  37.44 
 
 
230 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.332948 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2376  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  35.19 
 
 
231 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.127733 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2816  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  33.17 
 
 
231 aa  143  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.721008  hitchhiker  0.0000024017 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2527  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase  40 
 
 
258 aa  143  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00539509  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2538  hypothetical protein  37.63 
 
 
228 aa  142  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.570188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>