25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00993 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00993  transposase  100 
 
 
146 aa  304  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000412297  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4989  hypothetical protein  66.37 
 
 
110 aa  155  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.417508  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1746  insertion element protein  42.86 
 
 
324 aa  112  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114953  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2858  insertion element protein  42.86 
 
 
324 aa  112  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0252228 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5484  insertion element protein  41.98 
 
 
342 aa  101  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000857225 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13670  transposase  41.13 
 
 
317 aa  99.4  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12230  transposase  41.13 
 
 
236 aa  99  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2468  putative transposase  38.28 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.1034  normal  0.284766 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1273  insertion element protein  34.33 
 
 
342 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.510438  normal  0.550669 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2839  insertion element protein  34.33 
 
 
342 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.642058  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3368  insertion element protein  34.33 
 
 
342 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.528053 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1523  hypothetical protein  33.33 
 
 
353 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00490598  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2092  Insertion element protein  25.6 
 
 
294 aa  50.1  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.223101  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0890  hypothetical protein  33.33 
 
 
107 aa  50.1  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2389  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4200  Insertion element protein  24.8 
 
 
294 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.913227  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0919  hypothetical protein  25.19 
 
 
311 aa  47  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.299986  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1665  hypothetical protein  25.78 
 
 
313 aa  43.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0645935 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1177  hypothetical protein  29.76 
 
 
165 aa  42  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000647133  decreased coverage  0.00771536 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0871  putative ISH4 transposase  26.61 
 
 
294 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1476  putative ISH4 transposase  26.61 
 
 
294 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1705  putative ISH4 transposase  26.61 
 
 
294 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.99413  normal  0.0773274 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3320  putative ISH4 transposase  26.61 
 
 
294 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.498779  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1232  Transposase-like protein  24.56 
 
 
279 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1332  Transposase-like protein  24.56 
 
 
279 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.138478  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2140  Transposase-like protein  24.56 
 
 
279 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.165163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>