More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00992 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00992  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 
395 aa  799    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000137814  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0800  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  74.17 
 
 
391 aa  623  1e-177  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00706  nucleotide sugar dehydrogenase  77 
 
 
388 aa  622  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1418  UDP-glucose 6-dehydrogenase  75.97 
 
 
388 aa  621  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1572  nucleotide sugar dehydrogenase  74.68 
 
 
388 aa  623  1e-177  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1330  UDP-glucose 6-dehydrogenase  74.68 
 
 
388 aa  621  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.143594  decreased coverage  0.000414466 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3019  nucleotide sugar dehydrogenase  73.42 
 
 
397 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0876853 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1968  UDP-glucose 6-dehydrogenase  75.45 
 
 
389 aa  620  1e-176  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1203  UDP-glucose 6-dehydrogenase  75.19 
 
 
388 aa  619  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.699954  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1202  nucleotide sugar dehydrogenase  74.94 
 
 
389 aa  618  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.988641  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001761  UDP-glucose dehydrogenase  76.23 
 
 
388 aa  616  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2849  nucleotide sugar dehydrogenase  75.45 
 
 
388 aa  617  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2115  DNA gyrase, subunit A  75.19 
 
 
388 aa  610  1e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.539484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1387  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  74.16 
 
 
388 aa  609  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.496605  hitchhiker  0.0000966488 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  74.42 
 
 
388 aa  610  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112663  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01930  UDP-glucose 6-dehydrogenase  72.87 
 
 
388 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.586017  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1629  nucleotide sugar dehydrogenase  72.87 
 
 
388 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00733567  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1795  nucleotide sugar dehydrogenase  72.09 
 
 
389 aa  605  9.999999999999999e-173  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1032  UDP-glucose 6-dehydrogenase  73.13 
 
 
388 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.366892 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2961  UDP-glucose 6-dehydrogenase  72.87 
 
 
388 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000204361 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01916  hypothetical protein  72.87 
 
 
388 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2641  UDP-glucose 6-dehydrogenase  73.64 
 
 
388 aa  606  9.999999999999999e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2319  UDP-glucose 6-dehydrogenase  73.39 
 
 
388 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1510  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  73.52 
 
 
390 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1614  nucleotide sugar dehydrogenase  72.87 
 
 
388 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.812894 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0591  UDP-glucose 6-dehydrogenase  71.83 
 
 
388 aa  594  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2205  udp-glucose 6-dehydrogenase  71.83 
 
 
388 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.638468  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3483  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  73.39 
 
 
389 aa  594  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.956099  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2306  udp-glucose 6-dehydrogenase  71.58 
 
 
388 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0255325 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2418  udp-glucose 6-dehydrogenase  71.83 
 
 
388 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233828 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2259  udp-glucose 6-dehydrogenase  71.83 
 
 
388 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.389868  normal  0.025931 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1373  UDP-glucose 6-dehydrogenase  72.61 
 
 
388 aa  593  1e-168  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  71.58 
 
 
388 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0186642 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0919  nucleotide sugar dehydrogenase  69.77 
 
 
388 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00213667  normal  0.147124 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4687  UDP-glucose 6-dehydrogenase  71.5 
 
 
387 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3978  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  69.62 
 
 
409 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2679  nucleotide sugar dehydrogenase  70.28 
 
 
388 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0071  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  71.06 
 
 
387 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3885  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  69.11 
 
 
409 aa  579  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4328  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  70.98 
 
 
387 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4468  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  70.73 
 
 
387 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4273  nucleotide sugar dehydrogenase  70.54 
 
 
387 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4088  phosphoglycerate mutase  68.86 
 
 
409 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0720  UDP-glucose 6-dehydrogenase  69.25 
 
 
388 aa  568  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875671  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2929  nucleotide sugar dehydrogenase  68.99 
 
 
388 aa  564  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1349  nucleotide sugar dehydrogenase  67.18 
 
 
388 aa  553  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1563  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.15 
 
 
397 aa  550  1e-155  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.03127  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2850  nucleotide sugar dehydrogenase  64.86 
 
 
388 aa  531  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217055  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1498  nucleotide sugar dehydrogenase  65.04 
 
 
389 aa  528  1e-149  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1256  transcriptional regulator, XRE family  61.22 
 
 
491 aa  521  1e-147  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1067  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.59 
 
 
391 aa  521  1e-147  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.575864  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3861  UDP-glucose 6-dehydrogenase  64.42 
 
 
398 aa  518  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0444005  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0900  hypothetical protein  59.34 
 
 
397 aa  485  1e-136  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0374108 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1737  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.72 
 
 
388 aa  480  1e-134  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0275  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase, dimerisation  52.54 
 
 
422 aa  429  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0309187  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0150  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.23 
 
 
372 aa  414  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0958685  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0568  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  45.36 
 
 
389 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00339328  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0599  nucleotide sugar dehydrogenase  45.36 
 
 
389 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0592  nucleotide sugar dehydrogenase  45.36 
 
 
389 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.887508 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.33 
 
 
442 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  33.14 
 
 
427 aa  178  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1121  nucleotide sugar dehydrogenase  31.25 
 
 
447 aa  175  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396392  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.52 
 
 
467 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3180  nucleotide sugar dehydrogenase  34.55 
 
 
449 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000062373  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  30.81 
 
 
467 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.29 
 
 
451 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.44 
 
 
451 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3344  nucleotide sugar dehydrogenase  32.39 
 
 
457 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2024  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  31.04 
 
 
450 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2477  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.47 
 
 
471 aa  168  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5385  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.13 
 
 
457 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463781  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0917  UDP-glucose 6-dehydrogenase 2  29.78 
 
 
473 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.78 
 
 
473 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2484  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.78 
 
 
473 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2878  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.27 
 
 
466 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2941  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.79 
 
 
466 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0750  nucleotide sugar dehydrogenase  29.97 
 
 
470 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.259677  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0423  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.27 
 
 
466 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.78 
 
 
460 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0942  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.27 
 
 
466 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1642  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.27 
 
 
466 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602201  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  30.05 
 
 
470 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.05 
 
 
470 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0206  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.27 
 
 
466 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2567  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.27 
 
 
466 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0034  nucleotide sugar dehydrogenase  30.41 
 
 
440 aa  163  5.0000000000000005e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.250011 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  32.2 
 
 
435 aa  163  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.73 
 
 
473 aa  162  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  31.48 
 
 
440 aa  162  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2988  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30 
 
 
466 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  30 
 
 
440 aa  161  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.78 
 
 
467 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.46 
 
 
470 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  31.79 
 
 
439 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.46 
 
 
470 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.46 
 
 
470 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  29.46 
 
 
470 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2750  nucleotide sugar dehydrogenase  31.32 
 
 
475 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  31.78 
 
 
441 aa  160  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  30.81 
 
 
437 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>