More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00973 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  100 
 
 
860 aa  1788    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  46.55 
 
 
902 aa  797    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  35.32 
 
 
703 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  35.49 
 
 
994 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  34.57 
 
 
700 aa  391  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  33.28 
 
 
1106 aa  359  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  33.81 
 
 
1340 aa  355  2e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 
1152 aa  261  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
892 aa  255  3e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  30.68 
 
 
1837 aa  251  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 
824 aa  242  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2061  glycosyltransferase  36.39 
 
 
537 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2423  glycosyltransferase  35.61 
 
 
537 aa  220  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.848309 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  26.82 
 
 
1075 aa  217  5.9999999999999996e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  25.76 
 
 
683 aa  206  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 
535 aa  204  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  25.83 
 
 
691 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  30.64 
 
 
1119 aa  196  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 
691 aa  196  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  25.12 
 
 
691 aa  193  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  39.58 
 
 
1739 aa  192  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
956 aa  191  4e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2183  glycosyl transferase family protein  25.31 
 
 
995 aa  182  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  39.17 
 
 
1077 aa  182  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  29.71 
 
 
456 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  27.45 
 
 
443 aa  160  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
443 aa  156  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0054  glycosyl transferase family 2  30.65 
 
 
557 aa  147  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 
499 aa  145  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 
401 aa  137  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  34.84 
 
 
2401 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  31.99 
 
 
1359 aa  127  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  26.53 
 
 
1156 aa  125  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 
733 aa  123  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  30.32 
 
 
525 aa  122  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 
318 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  32.61 
 
 
1334 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 
617 aa  119  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  35.56 
 
 
293 aa  119  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 
880 aa  117  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2866  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 
410 aa  117  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.614431  hitchhiker  0.0000195595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2643  hypothetical protein  26.54 
 
 
429 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1770  putative glycosyltransferase  25.5 
 
 
419 aa  114  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  31.32 
 
 
729 aa  113  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  35.27 
 
 
1486 aa  113  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
624 aa  111  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1550  glycosyl transferase, group 1  24.2 
 
 
414 aa  111  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  32.68 
 
 
808 aa  111  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
632 aa  111  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  28.62 
 
 
670 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02426  putative glycosyltransferase  26.67 
 
 
423 aa  110  9.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 
785 aa  110  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 
832 aa  110  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  32.67 
 
 
662 aa  110  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 
289 aa  109  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 
1152 aa  109  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 
337 aa  109  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07620  hypothetical protein  27.74 
 
 
410 aa  108  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 
1152 aa  108  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  28.39 
 
 
684 aa  107  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2479  glycosyl transferase family protein  29.88 
 
 
882 aa  107  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.524105  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 
346 aa  107  8e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 
1759 aa  107  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  27.11 
 
 
1435 aa  107  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2443  hypothetical protein  24.79 
 
 
407 aa  106  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000302372 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
1267 aa  106  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  26.95 
 
 
679 aa  106  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
635 aa  106  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 
294 aa  105  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
311 aa  105  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 
337 aa  104  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 
775 aa  104  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 
387 aa  104  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  28.41 
 
 
602 aa  103  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0439  hypothetical protein  25.96 
 
 
419 aa  103  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 
312 aa  103  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  27 
 
 
340 aa  102  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 
1267 aa  102  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  28.57 
 
 
358 aa  102  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
586 aa  102  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
1268 aa  102  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2710  hypothetical protein  23.33 
 
 
402 aa  101  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0543542  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 
1275 aa  101  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  30.11 
 
 
709 aa  101  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  30.11 
 
 
709 aa  101  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 
625 aa  100  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 
625 aa  100  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 
958 aa  100  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  27.47 
 
 
710 aa  100  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  32.44 
 
 
303 aa  100  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
721 aa  100  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  28.41 
 
 
746 aa  100  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
359 aa  100  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  34.04 
 
 
1067 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 
313 aa  99.4  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1794  glycosyl transferase, group 1  24.65 
 
 
419 aa  99.4  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.164392  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
728 aa  97.8  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.11 
 
 
809 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  32.29 
 
 
305 aa  97.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  28.29 
 
 
632 aa  96.3  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>